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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01237
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  196/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.148.1
:1350 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   916->1112 1c4zA PDBj 5e-24 35.3 %
:BLT:PDB   1182->1343 1c4zA PDBj 1e-32 40.7 %
:RPS:PDB   161->397 3c3lB PDBj 2e-04 8.9 %
:RPS:PDB   921->1091 1c4zA PDBj 5e-15 34.9 %
:RPS:PDB   1171->1343 1c4zA PDBj 5e-48 39.3 %
:RPS:SCOP  909->1091 1nd7A  d.148.1.1 * 5e-25 20.9 %
:RPS:SCOP  1171->1343 1c4zA  d.148.1.1 * 4e-49 39.3 %
:HMM:SCOP  909->1345 1nd7A_ d.148.1.1 * 1.3e-90 36.7 %
:RPS:PFM   975->1071,1182->1348 PF00632 * HECT 5e-34 40.1 %
:HMM:PFM   971->1348 PF00632 * HECT 6.1e-72 32.9 289/308  
:BLT:SWISS 186->309 WHRN_MOUSE 9e-05 31.7 %
:BLT:SWISS 911->1112 UBE3A_HUMAN 1e-23 34.5 %
:BLT:SWISS 1182->1350 UBE3A_MOUSE 6e-36 42.6 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01239 GT:GENE CIRG_01237 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1350 SQ:AASEQ MTRLHGVVSGLSDSGHRSIGDDRAALRFSKLPPGTPEVILKNTVIVNDPARILSRNKDERQRNFNLLVRRYKTQLLHGCKEPNCTTPTCLSYRRRRAADRPFRNFNDLSARTLACYLASQDDPEGGLCGNAPARSLESFAQEDTTSATERWPPLAWEARTHSPHPRRPQPVKVVESISSQLKEPDSQDPIPDKPKVSNPPEHIKSPIPQDRPGVIPQPKTPKDPRSITQNLFDTLALRMIEWLPLKRASNTLDSDSLAGEGDGSGHKPVHADPSASPVRRQTSTKAQKPPITRERIQAENPSVLSSQPPIPPTLEVKVPGQPVHRLSFGELDRWKHSLRSLPDDIAKTERKSTPKLATTNTPTATSRSFPSPPPRKHRSQKYKQTEYQTDSQRDTKTRYRQPAPDKAEILPDPLQSGSADPRSPPELLSPASPSLNVDAHRQAQLGSDMEPQIESLSMLSKDIVDSLGKLMFETKEEEGNWKDEMMHLESRGCIEPRNLHFATPRQRQIFPFITQSLFFVLSSPELLRRSFRITPETSRSDNSTSADLDIDTQNLEGVFRKLYSICPWEATLHSLWMCLEGLFVPPKEFSTSKTHRRFIWRSTANNISLRSGETSRDSPSASQSHISDCDAAHIAIVTLFALASSIPPLDAQAWQVIRRVRSTGTVLPDFEMRKVSEATAGLLAEATDKFEHDLALRLMNRLVRAISARLAFHEISKLKGPPIQNVGSLGNWNPVDLIITSLQPCISAKHGYLDSSCGVYEAERQTTIPMVAVEWLKGLLLKEWDGKPEILKSGAAGGALVLLASMYHHRAQLGLVPEDFYTAYLGDNLDPLRMPIEWMSFVPNNRTMHILSHQFMFEPSALVTYFRALNFSAMAKYHETAVGHSRHVAQTAFSHARAIDDDIGLFAGLKRSVTSFLVLIVRRDNVLTDTLNQLWRREKQELMRPLRVQMGMDEGEEGADQGGVQQELFRVVMAEILDPAYGMFTLSDRDHTSWFQPCSFEPLYKFELAGLLMSLAIYNGITLPVNFPVAFYMKLLDFEVKKLDDIRSGWEDLARGLSELLSWSDGDVGDIFLRTYEFSFDAFGKVVTVDMTTVDRSDAWPPAERNVTWRKERLRSFASSSDNDDADNLDSLDNGESMLQDTPSDSRSNRRDGRLSGILKGSSSKLRERRVPSPPEHEAPLVTNANREQFVNDYIFWLTDKSIRPQYEAFARGFYTCLDRTALSIFTPQALKSVVEGIQEIDMDELEKHTRYEGYNPEDRVIRDFWDVVKTYPQEKRSRLLEFVTASDRVPVKGVSSLLFIIMKNGVGDERLPTSGTCFGRLLLPEYSSRQALEENFDRALEYCKGFGAI 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222254F-834266746446666566555676666566565765555565666646556656554555-4545444434455455486-4656566323465498A2EH5YVXQXSYLFJIKNIhWDdG**VCdO*HFHGUELUKEMMIDUHJmHXONLIUWEIGE8OFCP8AKI3664v74255A5D847967NONMA ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 668 STR:RPRED 49.5 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 18-28,31-32,1350-1351| PSIPRED 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