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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01241
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  2/68 : Bacteria  8/915 : Eukaryota  134/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.51.1
:897 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   533->806 3dmqA PDBj 6e-06 14.3 %
:RPS:SCOP  10->166 2ic8A1  f.51.1.1 * 8e-05 17.9 %
:RPS:PFM   504->869 PF05557 * MAD 1e-09 21.9 %
:HMM:PFM   269->368 PF04156 * IncA 5.1e-07 23.5 98/191  
:HMM:PFM   635->754 PF04156 * IncA 0.00049 24.3 103/191  
:HMM:PFM   546->668 PF04582 * Reo_sigmaC 0.00039 22.8 123/326  
:HMM:PFM   703->815 PF04012 * PspA_IM30 3.5e-06 28.4 109/221  
:BLT:SWISS 241->344 DNAA_LACDB 3e-04 35.9 %
:BLT:SWISS 492->882 CD158_MOUSE 3e-14 22.8 %
:TM
:COIL
:REPEAT 2|558->587|589->618
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_01243 GT:GENE CIRG_01241 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 897 SQ:AASEQ MGLLELLQSLALVILFFGGHAIVDLPLWQTPLEEWTFVDFEAIGLRLFNTVMFMAVSAYCIGGLCSGIYGLLIPVIRAVAGMARAVTSLASEYSKNGAKGPALLALNMAKVALLRPWVSRLVELLVLGDEIAIVAVLVLPAALYYASVNVGCPVFAYLSGFIAGIVTPVDVDFDGCPYGVTRSAFDHHKQNPNLRYFCDGEIDGFDALAWWTQAQEDATSTWEFYLPIFIYSVTAMFCVFLVAIFAFGRQTQVEIGTQTDSTGDLKGDSNGLSEKVAQLLARIRELEGCRAISESVVTRLRGQIQLSDRTVQQQKIELGAARKELGDLRAVNDSQRSQCQALAEELSKASDDTSLNQLQQQLGQEKGLRILITYGYLALRQLAGTFVESGLGERLLFLTREIENKCTAIATGGTRTVEEVQGNLGNGLLTLLEEASAYAAEIRLSRRVGQNRGSSQDVVLLKRKLRKCKRLARFVKADSAARQDQAIQLAKAGTVGETNSVDDERMTQELDGYKQGLLSVRRELNDTAQKLGSLEQQLAESRALNESMNQGFTTTIAEKVTALQKLREELTVALQREATLKKEMVQRTENETALQKLREELTGALQREATLKEEAAQRAQLAEGHDQAVASLSAEKQQLTARIEEFDLKLGAANFRYSELGQRGSQLQQRVEGLTRQVSEKDQLLAWLRAENDGLFSKCKGVEVEIRELRNEQRKAKKESGNTVSNAVRMHRVQLVEQQNEIDDLQRGLQKAEKDLSSSIDEVAKRKIAELEAQVEKLTVQHQQQSGTEIELRKEVQDLKERLDQVGREKSTKKAVGSVFADPQKARAQKLQRDVQNLRQEAEVMGTMRDRLANEIRDLKAKYEPRNDNREPQTPLTVQGLQRILQKEKTSQGLSRP BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 241->344|DNAA_LACDB|3e-04|35.9|92/454| BL:SWS:REP 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--------31541-2---222111-12----112112212222133-11-12-11122-4-1-2---2--221--1-121-1111111-21--11--121---1-1-1-2-6479B5-14-461DA352EW61A543416415335631352-D3B673273-2-21156527-------211---2-213----446- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 350 STR:RPRED 39.0 SQ:SECSTR 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17-18,20-20,45-45,53-54,59-60,62-62,67-67,95-95,101-101,104-104,109-110,115-115,118-118,123-123,185-186,188-188,193-193,244-244,249-249,255-256,258-258,263-263,291-291,297-297,300-300,339-340,342-342,347-347,361-361,367-368,370-370,375-376,381-381,384-384,389-389,395-395,398-398,403-403,437-438,440-440,445-446,451-452,454-454,459-459| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHEEcccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHccccccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHcccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccHHEccccccHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccc //