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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01252
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  249/915 : Eukaryota  94/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:541 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   98->225 2d33D PDBj 2e-04 7.8 %
:RPS:PDB   459->512 1cb8A PDBj 2e-04 9.8 %
:RPS:SCOP  42->220 1pw4A  f.38.1.1 * 8e-08 11.7 %
:HMM:SCOP  1->533 1pw4A_ f.38.1.1 * 2.7e-68 27.4 %
:RPS:PFM   100->206 PF07690 * MFS_1 3e-09 29.0 %
:HMM:PFM   53->449 PF07690 * MFS_1 3.3e-47 25.3 340/353  
:BLT:SWISS 49->540 FNX1_SCHPO 8e-50 32.9 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01254 GT:GENE CIRG_01252 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 541 SQ:AASEQ MAESSETTPLLRDNAAVEDGHPTAVPPPAADDSDAPLADEPTPKELLVIQSSIWLGVFFAALDATVVATISGPISSSFNSLSLLSWLASAYLISNAACQPLSGKLTDIFSRRTGLVVSNVLFGLGNLICGLAQDEWVMIFGRVVAGMGGGGLTAIATFVTSDLVPLRKRGLWQGIGNICYGVGSGLGGVFGGWVNDTWGWRWAFLVQIPFIVVSTVLVWWRIKIPVKETDVSRWRRVDFLGAGALVLTLVLLLFGINTGGNQVPWSHPIVVVSLVLSGVFLFVFIYIEEKVASEPVIPVRLLTDRTVLSACLTNWFGTMSIFAVFLYVPLYLQIQGYSTTQAGARLIAQAVGTSIGSLGLGLLMRVTGRYLFLSYVSVMLLAVGSILFNTFTLGTPAWPPFLYLFIAGLGYGGMITATLVALISAVAHAHQAVVTSASYAFRSTGSSIGISIASSVFQNILKSGLWSRFGGREEAARLIPKIRDSLDEINHLPEGWLPGVLDAYMDALRAVFATTLALSLLGVVVNFGMREHKLHANLARK BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 49->540|FNX1_SCHPO|8e-50|32.9|492/531| TM:NTM 12 TM:REGION 47->69| TM:REGION 76->98| TM:REGION 142->164| TM:REGION 200->221| TM:REGION 238->260| TM:REGION 272->294| TM:REGION 311->332| TM:REGION 344->366| TM:REGION 371->393| TM:REGION 403->425| TM:REGION 435->457| TM:REGION 501->523| SEG 22->41|ptavpppaaddsdapladep| SEG 70->94|isgpisssfnslsllswlasaylis| SEG 146->151|gmgggg| SEG 181->194|gvgsglggvfggwv| SEG 240->253|lgagalvltlvlll| SEG 270->284|vvvslvlsgvflfvf| SEG 352->363|gtsigslglgll| SEG 443->455|stgssigisiass| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 98->225|2d33D|2e-04|7.8|128/499| RP:PDB:REP 459->512|1cb8A|2e-04|9.8|51/674| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 100->206|PF07690|3e-09|29.0|107/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 53->449|PF07690|3.3e-47|25.3|340/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 42->220|1pw4A|8e-08|11.7|179/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 1->533|1pw4A_|2.7e-68|27.4|405/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 1294 OP:NHOMOORG 344 OP:PATTERN --------------------------------------------1----------------------- 11113111222111111----1--1111111111113334141-3211222-223212--1121421452----------1-2-----11-----------11--1-1--------------------11----1-111111--12-----------------------1--------------2-1----5223343456434445442-1-124441111-3111111156-------------------1-1--11--11111--111-1--1--------------------------------------------------12----------1-11---------2----11111---11--------1-1----------111111--------------------------1--111-11-11---11-------------111111111-----------------------------------------------111111-111111111111-21111112--111--------1---------------------------------1-----1-11----1--1------------------------------11----1---1---1111---111--------------------------1-------------------------------121---------------------1------------------------------------2-----------------------------11111111-1111-111-------------211111------------------------------------------------------------------------------ ----11--------3C8IBFGJKSWUFCC9B9AKKGCECD9AC967H9CMIJZG9CDFDCAD314234321-6472122156632335-FE584B58457A17777---------------------------------------------------------------------------------1-C--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 179 STR:RPRED 33.1 SQ:SECSTR #################################################################################################ccGGGcTTcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHTTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEccccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEEccTcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccc#########################################################################################################################################################################################################################################HcTTcTT###TTcHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHTHHHHHHHHHHHHGG############################# DISOP:02AL 540-542| PSIPRED cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHcc //