[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01277
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  6/68 : Bacteria  389/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  2/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.108.1
:1048 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   253->605,846->941 1z6aA PDBj 8e-30 35.7 %
:RPS:PDB   22->222 3c2pA PDBj 8e-04 9.8 %
:RPS:PDB   376->476 2bzlA PDBj 4e-10 5.7 %
:RPS:PDB   453->512 1ekuB PDBj 3e-06 10.7 %
:RPS:PDB   818->970 3dzaC PDBj 2e-22 15.5 %
:RPS:SCOP  251->513 1z63A1  c.37.1.19 * 2e-40 34.4 %
:RPS:SCOP  503->606 2hqyA2  d.108.1.4 * 8e-06 13.6 %
:RPS:SCOP  800->969 1z3iX1  c.37.1.19 * 3e-27 29.6 %
:HMM:SCOP  203->510 1z3iX2 c.37.1.19 * 5.8e-69 31.2 %
:HMM:SCOP  542->968 1z3iX1 c.37.1.19 * 8.2e-60 34.6 %
:RPS:PFM   260->572 PF00176 * SNF2_N 6e-46 48.8 %
:RPS:PFM   873->952 PF08487 * VIT 9e-05 31.2 %
:HMM:PFM   260->600 PF00176 * SNF2_N 8.3e-59 32.4 284/297  
:HMM:PFM   833->910 PF00271 * Helicase_C 1.3e-13 23.7 76/78  
:BLT:SWISS 250->673,793->970 YBMA_SCHPO 1e-85 47.2 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_01279 GT:GENE CIRG_01277 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1048 SQ:AASEQ MLNEREPPKHRPGSMGSGENQSQRMVPPEFGKPSLLGSNRGNPFYIPKPNKTRPEHHRPVTNYSQSQQSRDRRTVDPFQVVKPSSAFTGYRSSNIPDDDDVVEITRPTNVVWTTQPRSKPYFSSKPTPSISKSRSNLKNFIDLTANTVGSATGPSVYDDDSRAIEAYSYLDSAKANENIKELLEGAFEDEDDKPRTRIRKKKIQTQVDELANKLQGINVNEQNSIQKSANEGEPPKEEEDDEEEENDGTIEGLKVTLLPHQVEGVSWMRDKETGLKKTRGVLPKGGILADDMGLGKTVQTIALMLSNPRPPPGKDGEKDNPKDKAKVPDKVGKGTLIVAPVALIKQWESEIESKIESTRRLNVGVYHGPGRAKIAKDLAKYDVVITTYGTLSSEHGGSSKTKDTSDGKPGCFGIHWYRIVLDEAHTIKNRNAKSTQAVYALDSLYRWCLTGTPMQNNLDELQSLIRFLQIKPYDDLAAWRDQITRPLNNGRGGLAIRRLQIYLKAFMKRRTKDVLKLNGGLDNKSPDDEKESDKPSSGFRITKRDVIKVEVDFTTEEREFYSRLEDRTDKSLENMIGHHKLNYASALVLLLRLRQACNHADLVKGDLAREKDAIIANGNQSKGSEGGDMDEIANMLGGLSVVSKRCDICLIDLTSEETKSGAIRCNDCEADLKIHVGLSKDKKAKKQRKKKPKEKQVFVEAAEQQTARRQRNRRVILDSDDEDEGEWIVPENKRVSEDIGRAGGTDDENAEGGGEWIGSEDSETGEDEEDSAQIDDDDDVDEEQDDPDYTALRNLSSSTKIRHLLRILKREAGEFKFIVFSVFTSMLDKIEPFLKSAGIGYARYDGGMRNDLREASLEKLRHSSSTRVLLCSLRAGSLGLNLTAASRVVILEPFWNPFVEEQAIDRVHRLNQTVDVKVYKMTIKDTVEERILDLQERKRELASATIEGKTAAGKLTMNDMLALFRHDAEARYVEDEGLDFSSGKGRLLESREVAEDAFGHLSLSGSLRSSSLNPDQNQGRRASPPVMERDLNKNRKRVQESSVYGRRW BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 250->673,793->970|YBMA_SCHPO|1e-85|47.2|564/830| SEG 230->248|negeppkeeeddeeeendg| SEG 680->695|kdkkakkqrkkkpkek| SEG 758->788|gsedsetgedeedsaqidddddvdeeqddpd| SEG 1001->1012|lslsgslrsssl| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 253->605,846->941|1z6aA|8e-30|35.7|374/480| RP:PDB:NREP 4 RP:PDB:REP 22->222|3c2pA|8e-04|9.8|183/1093| RP:PDB:REP 376->476|2bzlA|4e-10|5.7|88/284| RP:PDB:REP 453->512|1ekuB|3e-06|10.7|56/254| RP:PDB:REP 818->970|3dzaC|2e-22|15.5|148/171| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 260->572|PF00176|6e-46|48.8|248/265|SNF2_N| RP:PFM:REP 873->952|PF08487|9e-05|31.2|80/119|VIT| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 260->600|PF00176|8.3e-59|32.4|284/297|SNF2_N| HM:PFM:REP 833->910|PF00271|1.3e-13|23.7|76/78|Helicase_C| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0003677|"GO:DNA binding"|PF00176|IPR000330| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF00176|IPR000330| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 251->513|1z63A1|2e-40|34.4|215/230|c.37.1.19| RP:SCP:REP 503->606|2hqyA2|8e-06|13.6|81/134|d.108.1.4| RP:SCP:REP 800->969|1z3iX1|3e-27|29.6|169/346|c.37.1.19| HM:SCP:REP 203->510|1z3iX2|5.8e-69|31.2|276/0|c.37.1.19|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| HM:SCP:REP 542->968|1z3iX1|8.2e-60|34.6|254/0|c.37.1.19|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 5975 OP:NHOMOORG 594 OP:PATTERN --------------2---------------1----------------2--1-1--------------1 --1-1122222112---11-1-----11111---1-13231-11122--11111111-11112-2-2433-1---111-112---1111111--------11---313-2222222222222223----1--12-----11---3-4212112--1111111111121321-11----1--1-111-1---222333333333333333232222333323231-11111134--------------------1-------1----1---------1111111111111111211111-11111111111111111111111122133222222222211---122111--2--3111223-1--1-1-2-21114--------------1------1--------------1---1---2------------------------------------------11-------------------------1-21------------------------11-1-----211131-----1-2---1-111--31---1---------1-111114-121111121112-311-2-1--2-651--------------------------2111--1-1-121-111111-111111--111--11----------1----1--------2-------1---1----------------------------------------------------------------21111-1---------------------------2-11112111112211112----------1--111111-----11-1-1-----------1111111--------1-------------11---1-11-------11-------22 9BCEKNM-cDB6HFQOPSINQPOQQQQMMLOMNNONMNONLOMKLJROPROPVNKLNPMONNJJJHHH5HHGJJIHH5IIHGFGHILK-JWIPOKNIFHIKqHNKP6MsKgcdakXbMRPORVQzuKuG**cAuc*NJNMVLTYXNRPNNhPM*KcTXRKaiNNNOESJMkTOOICIPN*HIGHQdRQvOfbMNFNLKY --------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--- STR:NPRED 760 STR:RPRED 72.5 SQ:SECSTR #####################TccccHHHHHHHHHHHHcccEEcHHHHHHHHHHcHHHHHHHHccccccT#####TcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH##HHHHHHHHHHHcccGGGccEEccEEEcTTccEEEcccccTTTcH###########HHHTTEEcccEEEccccTTcHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTccHHHHHHHHHHHHHcccTTccHHHHHHHHHHcccccccccTTHHHHHHHHHHHcHTcccTTccTcHHTTcccccEEEcTTccHcHHHHHHHHHHTcEETTTTccccEcc#ccEHcEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHcTTcEEEEcccGGccEEEGGGTEEEcccccccTTcHcHHHHHHHcccEEEEEEGGHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccHHHHHHHHHTTTcccTHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTcHHHHHHHHHHHHcccEEEEE########HHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccccccTTc############################################################################################################################################################################################HHcTTcEEccccTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHTcHTTccccccccccccEEEEEEEEEEEccccccHHHHHTTcHHHHHHHHHTTcEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHTcEEEEEGGHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHTTcc#################################################### PSIPRED cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEcccccccccccccccccccccccccccEEEEEcccccccccccccccccHHHHHccccccHHHcccccccccHHHcccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHccccccccEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEccccHHHHHHHHccccEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHccccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHcHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHcccccHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHcccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHcccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccHHHcccccHHHccccccHHHHHHccccccccHHHHcccHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccccccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHcccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcccccccHHHHHHccHHHHcHHccccccccccHHHcccHHHHccccccHHHHccHHHHHHHHcHHHHHcccc //