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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01295
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  55/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:1495 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   635->768 3c46A PDBj 8e-04 13.5 %
:RPS:PFM   59->370 PF11597 * Med13_N 2e-06 27.9 %
:RPS:PFM   1084->1486 PF06333 * Med13_C 7e-44 35.0 %
:HMM:PFM   1084->1486 PF06333 * Med13_C 3.7e-121 39.8 397/420  
:HMM:PFM   1->370 PF11597 * Med13_N 2.4e-71 29.7 354/401  
:BLT:SWISS 959->1313,1379->1419 SSN2_PHANO 1e-49 36.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01297 GT:GENE CIRG_01295 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1495 SQ:AASEQ MEFPAGAVTNFRMTEIYSTIHWKIYYIESHQLPSPGAGVLEDPSSALAIELESAILLIRDQGCLVDAIPGGNGLWVFSHNGEFDQLQPFSVLESDCSLTSLQIGAITFKQFHAEFTPLGYLIKRLMAEPQGTIFSPLSQQKFANTNEDCPINREIVTSSAFYKAFTSAIAGSLSLRATQLHGAIPLGKRALFTTSAPDEKLGQGINADPTLGPRSLLSTLNIEFSFKSLIISWRTIPQWGLQQLSTTAGADSISDVSLHEDIWLAPTGSLCRYIGADPGHSSGPQWDPSVGDYGEFEFPGGGNLLYLREWKRAVCVRLRMFGLGSVDPDTETWIEVEALNPFESRLGGTAGENRKSIAYKRFLWPARLCFKRSSEQCLALDKRAEYLDAATLDPLSLAEKWVTEMTTRTSPEDQMAVETHVAEGMQPEATGTTEKTSSSEIFASLARKIDFSDLSAGAVYPTPPGAVTGTGLVAAGSSDVLTLPGVSSLSHAHPQNTSRRSDVNISGAGCQSTSNSLPPVDITTTALEIGSGMYDTTADDDLFDELDGDFAPKQITEADFNFFDEPDFAAFPGSIDVSMGRVNTSLQNSHGAHDGDALDIAGTSHDAVERPAGSAEPEERKDSMRNREHRVVLVPPAVSSPKENVQADLPIESGNIISPTPVTPHQPLSPSIIRKILFSGNSGIPTTTSFDKHPTSRKARSGYEPLSFGEDLSLSDGKYELDGRFWFLPNAESDQMEMHPSDIPRVGIPEWRNEERRALPMEDSSRDRLKSGMQSSSDSSAESSEDDSEPETTPLDYSNRGLRVLSASRDNSQRFKDLDFTPSPLEPLTVNTEFSNTGMNANTLSFLRTLLFRAIDWTLDGYFTSTSGRFPVLLRRDDLIQVAQIVVDQVTQSSLSHVLERRTSIGLDQQNALPLSSTSKDSWYGKFSNFDIKRYTAIDVDTSIQGLRKDFRYLTVGSMSKLDPPHIRIHRGKGELEVLPPAIFFWEPFGFEPTQGQKDILAYCIYPESAEEGADAFLGRMGLLYSSANLGQHSRPQDSKGLIPWGLECTSIRDYTAIMNRLQTTCEHLGDVISCLPPGSENILVYIANPFPYEAAVVDICTAFLFLFRKYVSNFEKHTIRLNEVALQIIPLDFIASLTSLVVPSQQDYLHLAFEVYSRCPPKNRSSDLLGCAPPFTLAKPAPKIVPFKLTPDSGSPLAEKHSIHVAYSQSIDQRWVTAAWTDNLGRDQLTMTYCLRERGSTISRPASEIRADIWSVTRHIIGKSHAYWRVMVVKDEPLELDEAEAWVSMAQHHNQTKPTKIELTLLSVNPKPCLFFKLPPPPLQPSTLTGPTTSTPVSTPNPSMPSPDPSAAAPTPPPSSAEQAQTPIAQSLDPADSETILIDKTEETWSITLSHRVNISPSLANYHPALASGYLLRRRDGTSDTEGLASLCVNLIFTHSRIPSEMVLKDTLRVYRDLVTLARTKGIFHAQGDDVLPWHISTAVKGREFLGVVL BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 959->1313,1379->1419|SSN2_PHANO|1e-49|36.0|383/1375| SEG 44->58|ssalaielesailli| SEG 465->476|gavtgtglvaag| SEG 535->551|dttadddlfdeldgdfa| SEG 775->789|sssdssaesseddse| SEG 1319->1362|lpppplqpstltgpttstpvstpnpsmpspdpsaaaptpppssa| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 635->768|3c46A|8e-04|13.5|133/1095| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 59->370|PF11597|2e-06|27.9|294/380|Med13_N| RP:PFM:REP 1084->1486|PF06333|7e-44|35.0|389/395|Med13_C| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 1084->1486|PF06333|3.7e-121|39.8|397/420|Med13_C| HM:PFM:REP 1->370|PF11597|2.4e-71|29.7|354/401|Med13_N| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0006357|"GO:regulation of transcription from RNA polymerase II promoter"|PF06333|IPR009401| GO:PFM GO:0016455|"GO:RNA polymerase II transcription mediator activity"|PF06333|IPR009401| GO:PFM GO:0016592|"GO:mediator complex"|PF06333|IPR009401| OP:NHOMO 59 OP:NHOMOORG 55 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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---------------11111111111111111111111111211111111-111211111111---1-----------------1--1----1----------221-----------------------------------------------------------------------------------1--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 133 STR:RPRED 8.9 SQ:SECSTR 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PSIPRED cccccccEEEEEEEEcccEEEEEEEEccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccEEEEEEEcccccccccEEEccccccccEEEEccHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEccccEEEcccccccccccccccccccccccccEEEEEEEEcccEEEEEEEEEcHHHHHHHHHHcccccccccccccEEEEccccEEEEEEcccccccccccccccccccEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEEccccccccccccccccccccccEEccHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEcccccccccccHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEcccccccccccccccHHHcccccccHHccccccccccccccccccEEEccccccccccccccEEccccccccccccEEEEEccccEEEEcccccHHHHHHccccccccccEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEcccHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccEEEEccccccccccEEccccccccccccEEEEEEEEEEcccEEEEEEccccccEEEEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcccccEEEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHccccccccHHHHccccccEEEEEcccccccccccEEEEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHc 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