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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01618
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  156/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.119.1
:1177 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   883->1021 2q5yA PDBj 3e-21 39.6 %
:RPS:PDB   882->1021 2aivA PDBj 4e-49 30.0 %
:RPS:SCOP  863->1021 1ko6.1  b.119.1.1 * 6e-46 36.1 %
:HMM:SCOP  871->1029 1ko6.1 b.119.1.1 * 3.3e-47 41.3 %
:RPS:PFM   883->1021 PF04096 * Nucleoporin2 1e-30 45.2 %
:HMM:PFM   882->1022 PF04096 * Nucleoporin2 1.1e-52 44.3 140/140  
:BLT:SWISS 173->226,495->640,855->1021 NU189_SCHPO 2e-32 40.6 %
:BLT:SWISS 761->868 SWR1_GIBZE 3e-04 28.3 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01620 GT:GENE CIRG_01618 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1177 SQ:AASEQ MSGFGAGSGFGGFGSGNQQQQSGGFGTGSAFGASGSGFGSGSSSSPFGSAANTFGASSGFGSGGGFGAPTAQTNPIFGGQNKGFGSTPTSTGGMFGSGTSTFGNTGFGSGSSFGNTPSTGSSGMFGSNQTSGFGSGSQGSSLFGGGTTGGTGFGGGSAFGSGTALAGAIPPASGTANPPFSAYEEKDSSGTCHYQSISCMQPYLKYSFEELRVADYDQGRRYGNASGQAGAFGATAFGGFQQPAGGFGTQASSNPFGAASSAPSTFGQTATSGFGSGTSTNPLFGATKPAGSVFGQTPTSQPSGFGTTTTGTGGFGSTTGTAFGSGNLLGNQQKTGFGTGTTGTGFGGFGQTAPTTSASPFGGTTATSSPFGQQQAGSGGFSAFGQTQQSQQNKPAFSGFGTTTQQQQPAGGTLFGGTPAGTGTTGFGTSLGQQGGTSLFGGTTGQQATSTNLFGGQQQQQQEQKPNLFGNLGTGTSTTGTSGFSGFGTQPQQQPGSSLFGGTQQQQKPSLFTPSTGQTGSLFGTQASATPASTGGSLFNLGGANQNAQQQNTGGLGLGSLGSGSMFGTPQQQTQQQPQATGLQASLLEGNPYGNQSIFSGLPAPNAPSPGPLATPLSASIKQKQRTPLPMYKVSPHAANRLITPPTRQGYGFSYSTYGTPSSSIGTPTGTSLLSRSFNGGSLGRGFSKSLSASSLRRSFEPETDSILSPGAFSPGSSRYSSSNLKRLTIDRSLRNDLFARAPQPPATITNGDSTPQQSSKLKKRVSFDSPIDSEESSAKADGALVHVQSSTPEPTPEELGFLRSGKQKSTAAESNKVREVENVNGTPDGKSSASSSDQPEMEQIRGNELAIVPEDREQEEVVTPEKPGLVKVPERDPQPGEYWMKPSRQEINKMTREQQKQVSNFTVGRKNCGSVTFNKPVDLTTVNLDDVMDSIVVIGLRSITVYPEEGSKPPRGKGLNVPSTLTIENSWPRGRDKKAPSPLTSGPLFDKHIERLKRVTNTEFVEYRKDKGIWIFKVPHFTTYGLDYDDDDEGESFDQSTMSAHPDMVTPKAQIPSHHLGSEFNDSTISVDDSFDDSMIGVEDDTFEFKKRGLVPGAFTNQSVIGKSVSFESDEEQESFLGEGSVGSNSENGYVEESDGHDTVTSELESDRDETMDMAAPKNQLSNTRESGIWMT 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883->1021|PF04096|1e-30|45.2|135/137|Nucleoporin2| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 882->1022|PF04096|1.1e-52|44.3|140/140|Nucleoporin2| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0005643|"GO:nuclear pore"|PF04096|IPR007230| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF04096|IPR007230| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 863->1021|1ko6.1|6e-46|36.1|147/158|b.119.1.1| HM:SCP:REP 871->1029|1ko6.1|3.3e-47|41.3|155/159|b.119.1.1|1/1|C-terminal autoproteolytic domain of nucleoporin nup98| OP:NHOMO 242 OP:NHOMOORG 156 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11------11111111111111111121111111311111111111111A11111111222222-2332222323322122211-11111-11111111111-1-22-1111211-1-1-22-116C4-33311--2-111111-11-11-11-----11-1-112522-1-11-----1214221211-1112- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 140 STR:RPRED 11.9 SQ:SECSTR 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PSIPRED 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