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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01625
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  2/68 : Bacteria  370/915 : Eukaryota  180/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:590 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   125->236 3dlhA PDBj 8e-04 17.1 %
:RPS:PFM   160->534 PF01566 * Nramp 1e-69 48.4 %
:HMM:PFM   160->535 PF01566 * Nramp 2.3e-92 42.1 342/356  
:BLT:SWISS 138->587 SMF1_YEAST e-123 52.4 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01628 GT:GENE CIRG_01625 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 590 SQ:AASEQ MNCPSRTDNPSDNPGWNQSPPLLTADLTTRKDLNGMANMRVRKGKGTGPNGTELNPGQDIPSKSPDEDEPGAHSAGKDAHGSTVGEREVGLEEDVDNRRISSSSWPNFHGYSGGAGSGNLGKFGPRELIHRLVKTLRKFGQFIGPGFLIAVAYIDPGNYATDVAAGASTKYSLLFIIFMSNVIAVFLQSLCIKLGSVTGLNLAENCKAHLPKWLNILLYVLSEAAIIATDIAEVVGSAISLNLLFNIPLVAGCAITLVDVMVILIFYKPHGTMRALRAFEFFVMALVFGVVGCFCVQLSLIKESSVGEIFKGYLPSEAIVKDNGCGILGATVMPHSIFLGSGVVQSRLREYDINRGYIDPSVQYGNTYEDKYRPTVHAIRGCLKYSVLELVLSLFTFALFVNSSILIVAGASLSGSEASDADLFGIHRLLSETISPAAGTVFAIALLLSGISAGIVCTIAGQMVSEGMLNWSVAPWLRRLITRSISIIPSVIIAAAVGKEGLNAALTASQVVLSAMLPFVSAPLIYFTSRSRYMTVEAGLMTGNSNPEGQEVKGVSMKNNWLVTILGVLIWIVITVLNIALLVLVGMGKA BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 138->587|SMF1_YEAST|e-123|52.4|450/575| TM:NTM 10 TM:REGION 139->161| TM:REGION 176->198| TM:REGION 212->234| TM:REGION 245->267| TM:REGION 276->298| TM:REGION 390->412| TM:REGION 438->460| TM:REGION 480->502| TM:REGION 507->528| TM:REGION 562->584| SEG 110->124|gysggagsgnlgkfg| SEG 477->497|lrrlitrsisiipsviiaaav| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 125->236|3dlhA|8e-04|17.1|111/673| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 160->534|PF01566|1e-69|48.4|341/354|Nramp| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 160->535|PF01566|2.3e-92|42.1|342/356|Nramp| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF01566|IPR001046| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF01566|IPR001046| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF01566|IPR001046| OP:NHOMO 894 OP:NHOMOORG 552 OP:PATTERN -------------------------------1-------------------------------1---- 111--1----121-11111-1111111111-1-111-111---------11122---1-----11------1111111----1-----1111-1-----1-111-1-1-1----------------1------2--1--------1----------------------11--------------11--11-1-11111111111111111-1111111-1-1-1-111111-111111111111111-111112-3-33-1--1332222212112132211----111---------------------------111----1--22----------1-------------------------1-2221---1-----------11122111111-111111111111-1111111111--111111-111--1--------------1111111111111--------------------------------------1----22233232333333323222332211------1-1---1---11------11-----------------------1---1----1------------1---------------------------11-1----11--------------------1------------11111111111111111-111111111111111111111111---111111111111111121111111111111111-111111--------------1----------------------------2212-111------111---------1---------1----11111111111111--------------------------------------------------------11- 11--222-1---112111-221221121111112221212222111121112122211-32223333323333333313333443411-22211111111151342-13-43521-32222221252826N2-6271322212612222222232312211--221-3--12411342181111269D9177-146342 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 111 STR:RPRED 18.8 SQ:SECSTR ############################################################################################################################cHHHHHHHHHHHHHHTccEEEcccccccT#THHHHHHHHHHHHHTTEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHTTccEEEEEccccTTcTTHHHHHHHHHHHHTTccEEccccEEE################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## PSIPRED ccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEccccHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEccccHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccccccccccccccccccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccc //