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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01653
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  169/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1
:1905 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   1268->1490 3cfxA PDBj 7e-04 8.0 %
:RPS:PDB   1522->1757 2db0A PDBj 1e-05 12.9 %
:RPS:SCOP  1391->1762 1f59A  a.118.1.1 * 3e-07 14.7 %
:HMM:SCOP  1061->1858 1b3uA_ a.118.1.2 * 1.2e-27 18.8 %
:RPS:PFM   1815->1905 PF11919 * DUF3437 7e-25 62.5 %
:HMM:PFM   1816->1905 PF11919 * DUF3437 7.1e-34 46.0 87/90  
:BLT:SWISS 57->806,1274->1880 PSME4_MOUSE 9e-54 30.6 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01656 GT:GENE CIRG_01653 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1905 SQ:AASEQ MDHSNQRLPVLLTTATAPHTHELSRATSPGGGPPESNMNGLEDPTKKARSRPRTYPYFKYLPYKVEDEAQRQQNLDEILKYLYTAVQSGDFNPGAVHWTRELRAWLSLKFDPTREQRAKLVKLYYELTLAPGVEAAVSERFASMFMVLTKRKHYLRPVKDVMLDWKPLYREIKVFVLPSESELVHSTSSKRNIKTLTKLCAFAQLYFDPLEIPAMLEEFLPHFTTSFTEGAFVVVGLMNLFLPTSPGPEDRTDLYPQHYLPTYFHLWSTVNRSRTFDVNFLDLLSRLARDWLPANYVSFSEFGILTSEQTSLIFTAILRLLEIPVGQATSSYSAVVDLSAGLGIMLDRDSRGHPVAHHIARLIVMSLSPACVDASESILSLLEGLIQAVETFFHPSNAGAWSKGLSQLINYLADFFVMRWNRERNGEIQVPAERKLNDAIKHRFVLCLREVTFMGIYSKSRTAMNFSLATLQSLAYLEPGLILPGALQRIYPSMQGLVEVHRTTSSLRSLQVLSKIMIRTKGFRCHITTLLGLALPGIDANDLEKSLHSLAFIQSVCYNIPFEDLTQGREDVNGNMLAMQWITGELERMEEEGAAVEMNYDTDLSDEVEERILRSSTTGFGEFLISFLGRVFTLLENLPDAARVRSGSPEENVLNTLPATFTPLLASLSPELYDVALHKIVDFVAEHVIHQARDAVAFICNALCKVNPEKALKRFIPLLIRSIRTEIDENGAASTRTTGSDVLPRDRGLVWNVSMLSMCVVHVGSEVLKYKQELIGIALYMQKKCKGIPTIHISNFIHHLLLNLTVTCTVDHALENSRIKRDGSGKDWSDEVTRNIILLRLIISGISALFNNRIASSNKSADSDVDMADADDSGELLQQSDPDSVLDTSDEATIRRTFTYPTGYSLTDDDPLCIKLHDIRERIGQVLHNVHRFLVEKQEDDVSCFSPLYTAYRSWFVDVGIERSAHVLDRVTKLLSADAYPYKMSGVRKDYPRPLLVRRANVYHWQRLRHNAAPRPRSKLDETLLLDLAESSVSLYTDIRRNAQAAGESALKAVWGSRLLIIPPLIQALQTAIKQNDHPRIKGALYSLLYSSLAKTLGRHWKYTPSLIRLFIEASAVDKPSVQKVCNSALYQIIEYGRDTDRMAILDKDIIGSIAPAESVDDLIAKKKESLQKKRILIESKKADLADELVNLARESHWKKASRTAAIVIGMGLRFDNVASENLINLIVSGAIDSHPGLRGMYSQTMVAIFTMIDVRAACSHKYEDYILGKQYYPSKIQVATKREDPHWTEDFLASFAKPDAEYYVDHENPGWLVWDKTMPAYKPNMTRDLQYDDLEWDVRKCMGSLFDRRWFSAFFGYLKQEPRDVSADKFRMSSAMTLLYVFQLMTRDDLTKATFEEIKEEIAAVFDDGSDKHQHRATAEILAALIGSVADSSVERRTKVWEYAFPIIQKIFSDGLTPENSSYWTQFVHMIFQCRDPRRAWPLIDWLASFRLDMSSNAAFKESSKINLLHQCILDAGWHFQLEKPIVEDFLSHLDHPYKGVRDAVGRTLASIFRTRYHESYPDIDKLIMSQKEASSIGSRAYQPTKEFSNMVYGVFNRLEKWRHERTPGQQTPSSYTSGCKTVLLWLDGTLSSYECTQLLPFFPQLFIEQLLHMMDVKEDPELQSLAYHVFRHLPNVPHPAGEDSEFVDTLIRIGRTSQSWHQRLRVMINMQIIYFRRLFLLSKVDREKLFDCVANMLEDPQHEVRAGASATLSGMIRCSPVALRNEMVLKLRDRFTKSLIQHPLPKKPRIYTSGFSSATSTGTSTPTPEHTRLVITRHAAVLGLGALIQAFPYTSPPPPWMPGVLITLSTKAAGDPGIVGQSVKSIISEFKKTRQDTWHIDVKAFEPDQVEDLAGVLWKSYFA BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 57->806,1274->1880|PSME4_MOUSE|9e-54|30.6|1217/1843| COIL:NAA 24 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 1164->1187| SEG 375->386|sesilsllegli| SEG 836->849|iillrliisgisal| SEG 860->873|sadsdvdmadadds| SEG 1059->1066|lliippli| SEG 1085->1093|lysllyssl| SEG 1794->1810|tsgfssatstgtstptp| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 1268->1490|3cfxA|7e-04|8.0|212/293| RP:PDB:REP 1522->1757|2db0A|1e-05|12.9|217/239| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 1815->1905|PF11919|7e-25|62.5|88/90|DUF3437| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 1816->1905|PF11919|7.1e-34|46.0|87/90|DUF3437| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 1391->1762|1f59A|3e-07|14.7|348/440|a.118.1.1| HM:SCP:REP 1061->1858|1b3uA_|1.2e-27|18.8|479/0|a.118.1.2|1/1|ARM repeat| OP:NHOMO 228 OP:NHOMOORG 169 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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PSIPRED ccccccccEEEEEccccccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEccHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHccccHHHHHHHHcHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccEEEccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHccccccccccccccccccHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHcccccHHHEEccccccEEEcccccEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHccHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHccccHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEHHHHHHcccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcHHHHHHHHccccccccc 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