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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01769
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  57/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:628 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   370->477 3d2eA PDBj 1e-04 15.1 %
:RPS:PFM   338->409 PF11204 * DUF2985 4e-19 56.9 %
:RPS:PFM   432->535 PF06851 * DUF1247 2e-04 36.2 %
:HMM:PFM   338->412 PF11204 * DUF2985 5.2e-29 45.3 75/81  
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01772 GT:GENE CIRG_01769 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 628 SQ:AASEQ MDRFEDVELNDNYGSDSNRELGDNCTAATSNARNRPCSNLRPGSMGCRPERRPSIRLMRLPNTQHLLVQPVLPGSDPDHGSNLASELLGARRRSSSEPRRIPLSALLGKRRASFGRSPAPMLPLDEELGPQSSKSTQKDQVLQPTEPQAVILSPIENRQATSSFRQGRIRRMSSGARSMLGSSRVATHNGAIEAPSLPQGEYEADVVNLLDVVDPEVSTITTLTNVQNSLFVPDLGHWVNRRPTYTVSPGPTRGHVEMERPAVPQKRKEDRGEQKLERSRTMDTITSTLSDSRFAVLPDGVSLEGWSAEDKRALDDHVRHMLHSRRSAFKRGLKGFIKYVKKPLGFLVTLYATLITLFGLAWVLFLIGWINVGGKQLYVINIIDYILVALFAIVGDGLAPFRAIDTYHMIYVAHYHRVTYKLRRKQQLPKLRNKNDLPERREEEIDQHVDVEKSGETTKDSDTTELSVLTARQQERLTHHANKLAKSHTFYKPHETTTHHAFPLRMLIAVIILLDFHSLFQIALGATTWGIDYRRRPFALTTVILCCSLTCNFTAGLLIWIGDRRTRKKDVIEKMFRQELTEQAILKLQKKKSKKREEENVREGKKQGEEEEEDHTGPLSEEHALLKR TM:NTM 4 TM:REGION 347->369| TM:REGION 381->403| TM:REGION 505->527| TM:REGION 539->561| SEG 91->100|rrrssseprr| SEG 586->595|lklqkkkskk| SEG 603->613|egkkqgeeeee| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 370->477|3d2eA|1e-04|15.1|106/622| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 338->409|PF11204|4e-19|56.9|72/81|DUF2985| RP:PFM:REP 432->535|PF06851|2e-04|36.2|94/148|DUF1247| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 338->412|PF11204|5.2e-29|45.3|75/81|DUF2985| OP:NHOMO 65 OP:NHOMOORG 57 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------112111111111111111111111121111132111111---11111---------------------------12-11111111-12--------------------------------------------------------------------------------------2--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 106 STR:RPRED 16.9 SQ:SECSTR #################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################EEEccccEEEEEEEETTEEEEEEEEEETTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccGGGcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEEETTEEEE##EEEEHHHHHHH####################################################################################################################################################### PSIPRED ccccccccccccccccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccEEccccccHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHHcHHHHcccHHHHHHHHHHcccEEEEcccccccccccEEEEccccccccccccccccccccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHcccHHccccccccccccccccccccccHHHccccHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHcccccHHHHHHcc //