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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02106
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  35/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
g.38.1
:763 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   13->52 1hwtH PDBj 5e-07 47.5 %
:RPS:PDB   18->87 1ajyA PDBj 5e-09 25.8 %
:RPS:SCOP  13->64 1f4sP  g.38.1.1 * 2e-08 25.0 %
:HMM:SCOP  12->54 2hapC1 g.38.1.1 * 1.3e-07 34.9 %
:RPS:PFM   20->52 PF00172 * Zn_clus 7e-06 51.6 %
:RPS:PFM   342->401 PF04082 * Fungal_trans 2e-04 33.3 %
:HMM:PFM   19->54 PF00172 * Zn_clus 1.8e-11 41.2 34/40  
:HMM:PFM   327->417 PF04082 * Fungal_trans 1.7e-07 26.4 91/260  
:BLT:SWISS 13->52 HAP1_YEAST 2e-06 47.5 %
:BLT:SWISS 274->404 YIN0_YEAST 3e-07 29.4 %
:PROS 20->50|PS00463|ZN2_CY6_FUNGAL_1
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02109 GT:GENE CIRG_02106 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 763 SQ:AASEQ MGSVASPTTLMLRRNGKPHSCEPCRISKVKCDHTTPICQRCETRGIVSKCYYHPAPLTKRVKPSPGSEDSQERPNKRKKPARRTKSPTVASAISPTNLECGLATDQNAYLGSTSFLSVFHDTVPQLSNIAIQPIPPELVRWQNRHLSLQSQLFRLLSAFDLYDRLIENYYDWGLFTIIPAPLILNSLRFTRRYMENEDTSNPKQRNLYRRISQNTAKPLQLSTETTAEEFCHSFTGENLRWEFMGVIFAMAGLGAISGLTSPATNLAIRFDDGNELSRSSFAAQMVAASNDAIEISRQHEKLNDVMIWLEYTHCVLISMVLDERSHIVYRGFGTLISDMFAMGYHRHQPPGPGIPFFLSQTRKRIFAAAYRSDKNLATFLGRPPRIQHLYCDNTIPLDLDDETLMLNGEELNAAVEKLDADGWNPDRTQDGKFRSASVIRIRYMISAQREKILELSLGRKTDNSVDVLYKNYQECQNIWASIPIQFRYDANCWKTFRPVSCIAMLVIYLEYLHSLFHIQRILCQQNIAAASSLLNTSMQLLTTVLHLLKQPEQPTETQTNFSWIFLFYGLPAAGVLATELYQSTLSAVPWPSSTPPRSQIIRDLGMIISWFETAALPINPTTRVCVEITKVLSKLLDDALNYQPSGPQQQEEEQEHPQPHQESQLRLLDQVDRARSTSQANIASGTGAAPGDANERRDPTRAEGEQSRQQQVCDNPEQAQPLLAPEAPEIGIGIGIDDQFTSEKFLSWLDDLDWDATVPDLLF BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 13->52|HAP1_YEAST|2e-06|47.5|40/1483| BL:SWS:REP 274->404|YIN0_YEAST|3e-07|29.4|126/964| PROS 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RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 13->64|1f4sP|2e-08|25.0|52/65|g.38.1.1| HM:SCP:REP 12->54|2hapC1|1.3e-07|34.9|43/43|g.38.1.1|1/1|Zn2/Cys6 DNA-binding domain| OP:NHOMO 110 OP:NHOMOORG 35 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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---------------233244837972------3311111111---31583255221-----------------------------------3------------------------------------------------------------------------------------------------2--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 74 STR:RPRED 9.7 SQ:SECSTR ############cccccccccHHHHHTTcccccccccccHHHHTTcGGccccccccccccccHHH#HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH#################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### PSIPRED ccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccEEEcccccccccccccccccccccHHHHHcccccccccHHHHHccccccccccccccccccccccccHHcccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHcccccccHHccHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHccccccccccHHHHHcccHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHcccccccccccccccccccccHHHHHHcccccHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccHHcc //