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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02181
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  187/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.132.1b.55.1d.338.1
:967 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   595->797 1zhtA PDBj 9e-07 25.7 %
:RPS:PDB   217->327 1bakA PDBj 2e-08 20.2 %
:RPS:PDB   703->780 3d7qA PDBj 3e-18 15.4 %
:RPS:SCOP  216->318 2codA1  b.55.1.1 * 3e-09 20.8 %
:RPS:SCOP  581->917 1zhtA1  d.338.1.1 * 9e-75 26.2 %
:HMM:SCOP  4->157 1o6uA2 b.132.1.1 * 2.1e-15 23.7 %
:HMM:SCOP  200->347 1wg7A_ b.55.1.1 * 2.4e-15 25.2 %
:HMM:SCOP  576->965 1zhxA1 d.338.1.1 * 2.4e-107 41.8 %
:RPS:PFM   220->307 PF00169 * PH 5e-05 32.1 %
:RPS:PFM   584->917 PF01237 * Oxysterol_BP 2e-84 49.4 %
:HMM:PFM   583->951 PF01237 * Oxysterol_BP 6.4e-122 48.0 342/354  
:HMM:PFM   219->309 PF00169 * PH 3.2e-06 23.6 89/104  
:BLT:SWISS 4->318,554->958 YEH1_SCHPO e-101 50.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02184 GT:GENE CIRG_02181 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 967 SQ:AASEQ MAGMEEIEIHSKSYLVRWINVSGEHTISWSIQPHKKSLNFGIFKHPGTTGTLTATSASIHSSSDFGDGRENGRPGNASSSVVTEKLKGIGLKPIRWVGKCEADKISQGTYDVGSGEGGNYALVFDNTFSKQISKTATFVLLTYPTHCPPRSGHQIHHSQAGLGYAAVTSALTRSNPNIASGASDSTESLRNSRGLANSQSKTGSRGSDSPFPFHAQLHTGILQKRRRKRHQGFARRFFSLDFNTSTLSYYHDRNSSALRGAIPLTLAAIATNSDTREISIDSGAEIWHLRALNEQDFNVWKRALEKASKISEDVVQPEPKGKVRTHSIPTRRQSMITQDTKSWTEVGWLAEKVAMARDTVRQLAKDTDPKYLPYSSDRPHVNTRQMPQQTDGTNEMADREKRSFWKLKYRNDNQSAQRAVSHGEPFGSYKPPMEMPNRGRDPVHDRLMALLQELDSVVSDFSSLLEKKRPRPSRPPSIRTRPSIESDVSEEFFDANDGHCSPLLTMHRDSEDEDEKSVAAETAVGDESSLSGSDIEERDDFLKFRHDNSSSLFPTKPKSLIPLPVENVVRRKTVLAPTVMPPSLIGFLRKNVGKDLSTISMPVSANEPISLLQRAAEQFEYSRLLDKAASATDALERLIYVTAFAISPFSNMRVKERSIRKPFNPMLGETYELVRGDLGFRFIAEKVSHRPVQLAYQADSKDWSYAQSPKPTQKFWGKSAEIITEGKVRLTLHSSGEHFSWSPGTSFLRNIIAGEKYVEPVGEMCIVNETTGQKTVVTFKAGGMFSGRSEEVTVKAFDTHGDELPLGLQGSWTTSLQLTEHGRETNHTIWAAGSLVDKAPKHYGFTVFAASLNEITAVEKAKLPPTDSRLRPDQRALENGDVDQAENLKALLEEKQRHRRKEMEAVGEVWRSRWFTKVGGTVDGANGTGTGDDDDDGVMWKLNTGKDGYWEERARGQWPGTVPVFKL BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 4->318,554->958|YEH1_SCHPO|e-101|50.0|646/945| SEG 47->58|gttgtltatsas| SEG 454->465|ldsvvsdfssll| SEG 469->484|rprpsrppsirtrpsi| SEG 918->938|vggtvdgangtgtgdddddgv| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 595->797|1zhtA|9e-07|25.7|202/436| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 217->327|1bakA|2e-08|20.2|109/119| RP:PDB:REP 703->780|3d7qA|3e-18|15.4|78/104| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 220->307|PF00169|5e-05|32.1|84/102|PH| RP:PFM:REP 584->917|PF01237|2e-84|49.4|328/344|Oxysterol_BP| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 583->951|PF01237|6.4e-122|48.0|342/354|Oxysterol_BP| HM:PFM:REP 219->309|PF00169|3.2e-06|23.6|89/104|PH| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0008202|"GO:steroid metabolic process"|PF01237|IPR000648| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 216->318|2codA1|3e-09|20.8|101/102|b.55.1.1| RP:SCP:REP 581->917|1zhtA1|9e-75|26.2|324/433|d.338.1.1| HM:SCP:REP 4->157|1o6uA2|2.1e-15|23.7|118/124|b.132.1.1|1/1|Supernatant protein factor (SPF), C-terminal domain| HM:SCP:REP 200->347|1wg7A_|2.4e-15|25.2|135/0|b.55.1.1|1/1|PH domain-like| HM:SCP:REP 576->965|1zhxA1|2.4e-107|41.8|361/0|d.338.1.1|1/1|Oxysterol-binding protein-like| OP:NHOMO 1316 OP:NHOMOORG 187 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1122553-1---3334434243332332223222222333333222344344442343333333343333563235535533333444-46343443232414A85-7-35LNGRII77778A7aQ7R7**O5QHU7875H98C75A885D65U796B737E44685844638663412P1211BA68B3C5----11- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 339 STR:RPRED 35.1 SQ:SECSTR 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ccccEEEEEEcccEEEEEEEcccccEEEEEEEEEcccEEEEEEEEccccccEEEcccccccccccccHHHccccccccHHHHHHHHHHcccEEEEEccccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEccccccccccEEEEEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEEccccccccEEEEEEEEEccccEEEEEEccccccEEEEEEccEEEEEEcccccEEEEccccEEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHcccccccHHHHcccHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHccccHHccccccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHEEcccccccccccccccccEEEEEEccccEEEEEEEEccccccEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEcccccEEEEEcccEEEEEEEEccEEEEEccEEEEEEcccccEEEEEEEccccccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEccEEEEEEcccccEEEEEccccccccccccccccEEEEEHHHccccccccccccccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEccccccccccccccccccccccEEEEEccccHHHHHHcccccccccHHHc //