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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02544
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  329/915 : Eukaryota  94/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:525 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   100->265 2gfpA PDBj 2e-06 26.1 %
:RPS:SCOP  70->267 1pw4A  f.38.1.1 * 7e-12 11.2 %
:HMM:SCOP  61->516 1pw4A_ f.38.1.1 * 4.6e-77 23.7 %
:RPS:PFM   96->250 PF07690 * MFS_1 2e-16 29.2 %
:HMM:PFM   91->474 PF07690 * MFS_1 1e-53 23.3 343/353  
:BLT:SWISS 39->516 YJA1_SCHPO 9e-68 30.8 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02547 GT:GENE CIRG_02544 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 525 SQ:AASEQ MADSRASTMVEAGGTDQQPKSSSRSPSVHRGEKSSDDTVDLELAISDVEDKDVKVPEESRDPNIVDWDGPDDPQNPLNWKIKKKVMIVSSIAIITFITPLGSSMFAPGVADVMREFQSHSPELASFVVSVYLLGYAFGPLILAPMSELYGRSPVYHVCNVFFVVFNVACAVANSLDSLIVFRFFAGVAGSAPLTIGAGSMADMIRQEKRGAAMAAWALGPLLGPVIGPIAGGYLTEAKGWRWTFWVLAIVSGAITINTFIFMRESYHPILLARKTKRLIKETGNQNLRSALDRGIEPKQLILQSIIRPTKMLFCSPIVFLLSLYVAVVYGYLYLLFTTISSVFHDQYNFSQGNVGLAFLGIGIGSVGGLGFISIVSDRLLKKLSAKSGEMKPEYRLPPLIPGGLFIPVGLFWYGWTAEYGVHYIVPIIGTFFVGVGMIVTMMATSTYLVDAYTIHAASAMAANTLLRSVIGAVLPLGGLRMYETLGLGWGNSLLAFIALALVPLPVIFFRYGERIRTSKRFQMTF BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 39->516|YJA1_SCHPO|9e-68|30.8|474/491| TM:NTM 12 TM:REGION 87->109| TM:REGION 124->146| TM:REGION 155->177| TM:REGION 182->204| TM:REGION 212->234| TM:REGION 243->265| TM:REGION 305->327| TM:REGION 354->376| TM:REGION 395->417| TM:REGION 422->444| TM:REGION 456->478| TM:REGION 491->513| SEG 80->94|kikkkvmivssiaii| SEG 157->173|vcnvffvvfnvacavan| SEG 320->335|llslyvavvygylyll| SEG 358->375|flgigigsvgglgfisiv| SEG 396->410|lpplipgglfipvgl| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 100->265|2gfpA|2e-06|26.1|165/375| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 96->250|PF07690|2e-16|29.2|154/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 91->474|PF07690|1e-53|23.3|343/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 70->267|1pw4A|7e-12|11.2|197/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 61->516|1pw4A_|4.6e-77|23.7|430/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 2754 OP:NHOMOORG 424 OP:PATTERN ------------------------------------------------1------------------- 212----3221-111------2--21-----1-222--1-----11-11----1-1-1----1----11-----------------11------------11---3-3----------------1111---111----------1------------------------1-----------------------244444344243454411--12344---1-11-------11111111111111111----1--1111----11--11--------------------------------------------------------1---------------------------1-11------------------1------1---12211-12111--11-11111----1--211111-51113314331-11--11--1211--1333333332--1------------------------------------11-1---31221312111111221111111132222--223--111-------------1-----------1--1---1----------1-1111211-----------1-111--1----------111-332-1-----1-------1--111----1----------------1112--12221211122-22122112122222222221211212-22212222222222121112111---111111111111---------------111---121-11-1-112------------1111-211----11---1--------1111--------111-----------------------------------------------------------------------1- --------------1YfjYrlum****GHHIEJOOJPIHHFFHABAoZTjff*pKSLNILIKHEK46C6I97S8GBB4CBKDDELDBI-SgFfCQCJDLAG1JF97----------------------------------------------------------------------1----------5-b--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 165 STR:RPRED 31.4 SQ:SECSTR ###################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHTTcccTTHHHHH#HHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccc#################################################################################################################################################################################################################################################################### PSIPRED cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccc //