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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02550
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  5/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  191/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.60.2c.52.1
:988 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   724->795 2bhnC PDBj 2e-12 41.7 %
:BLT:PDB   915->978 1z00B PDBj 8e-05 35.9 %
:RPS:PDB   724->976 2bgwA PDBj 1e-13 24.7 %
:RPS:SCOP  724->877 2bgwA2  c.52.1.20 * 3e-27 31.7 %
:RPS:SCOP  923->982 2a1jA1  a.60.2.5 * 5e-07 35.0 %
:HMM:SCOP  714->880 2bgwA2 c.52.1.20 * 1.1e-35 39.8 %
:HMM:SCOP  909->990 1z00B1 a.60.2.5 * 1.7e-13 25.6 %
:HMM:PFM   719->797 PF02732 * ERCC4 2e-07 35.4 79/183  
:HMM:PFM   479->580 PF09763 * Sec3 0.00045 22.0 100/701  
:BLT:SWISS 11->482,595->983 RAD16_SCHPO 3e-98 46.1 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02553 GT:GENE CIRG_02550 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 988 SQ:AASEQ MSSGNTSPLVKLSLPLQYQQDVFQELRTEDKLVILAQGLGLLRIVTNLLHAYDAAGNNLVLVIGANDRENEWIGEALAEHYAVSKTPLARGLKVINTDKATVSMRQKLYAQGGILSVTSRILIVDLLSKLLDPETITGMVILHAERVVSTSLEAFIIRVYRQFNKAGFLKAFSDTPEPFTTGFSPLANMLRNLFLQKTSLWPRFQVTVAESLEGRKRAEVIELEIPMTDKMREIQNAVLECVEVSIRELKKSNPVLDIDDWNVESALQKNFDVVIQRQLDPNWHRVSVKTKQIVSDLTILKNILHLLLTDDAVSLIKYIDTVIAAHSPPPGYTKQTYSPWLYLEAAHVLLQTARSRVYRGKLDTRAKLSDPLSKIPASLEPVLEEQPKWSVLVDVLNEIDRDLHLNPRPSDDSNRTILIMCSDRKACRQVREYLHTMYVRVYAAKEGQSRVEDSSEDMESCPSAEFMMRRKLRDYISWKRDFAKVRNSLYGINAKQSQPTEVPGYTSATKDRKPERAPLNKRRRVRGSSSAASNSGRAPNSTVQEETDDTTQVSTLLDGALQPTKPEEAEKEDTVVDELHDMDDYYELLDMEDLVIIHAYDGDMDEHILEEARPRYIVMYEPDAAFIRRVEVYRSSHTDRNVRVYFMYYGGSVEEQRYLSAVRREKDAFTKLIKEKGSMAMSLTHDKNLEDPQEQFLRTVNTRIAGGGRLAATAAPPTVVVDVREFRSPLASLLHGHSMVLVPCQLTVGDYILSPDICVERKSIRDLISSLKTGRLYNQAETMLQYYKTPVLLIEFDQNKSFTFDAFTSSTAPSAFVADNPTSFSAPSFSSGNIINPTNPRSTQHLLVLLTLAFPRLKVIWSSSPHQTAEIFTELKKNDPEPDPIRAVQIGLDFDISGDPSASGPKALMAAAGVEYRMFNQLPQDMLETVPGLTPHGVESLMLRTSNIHEIANMEVEELKEIVGLQEAKMIVKFFRRSVFDDEPGEKL BL:SWS:NREP 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988-989| PSIPRED ccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEcccccHHHHHHHHHcccEEEEccHHHHHHHHHccccHHHEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEccHHHHcccHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccHHHHHHHHccccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHccccccEEEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHcccccccEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHccccccHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHcccccccccccccccccHHHHHHcccccccccccccccccHHHHcccHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHcccccccHHHHHHcccccEEEEEEccccccHHHHHHccccEEEEEccccHHEEEEEEEEccccccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEccccccHHHHHHHHcccEEEEEEcccccEEEEccEEEEEccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccccccccHHHccccEEEEccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHccccccccccccccccHHHHHccccccccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHccHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHcccccccccc //