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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02553
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  145/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.17.3
:629 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   274->438 3bghA PDBj 2e-16 7.9 %
:RPS:SCOP  441->468 2bbjA2  f.17.3.1 * 4e-06 21.4 %
:HMM:PFM   294->497 PF01544 * CorA 1.1e-10 19.6 184/292  
:BLT:SWISS 157->557 MRS2_ASPFU e-147 71.6 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02556 GT:GENE CIRG_02553 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 629 SQ:AASEQ MVSPSFVKPSAPSLRLLRFLRSQSDICCFKQNVDHPRPRVSHGNYGFYRNFRLTSDQLGCGGLKSSAVRCPSTLEASLLSFIRPKPRKYSSLLKVSSARPPHLRGGAIRHPASQQISWFSGTSKRNRNFLRRLLGLQVPRPPAHLKPDDLPSSGAFEDGQECNPFTTGRKLALKASNEPRLRCTEFDENGNVTLISEEFKKSELIAKYGLLPRDLRKIDSSVIPHILVRHSAILLSLLHLRVLIKANRVLVFDAYGSADTYTQSLFMYDLEGKLRQKEPASSRQAAALGALPYEFRALEAVLVSVTSGLEAEFEGVREPVVRVLRALEEDIDRDKLRHLLIYSKRLGTFEQKARLVRDAIEDLLEADDDLTAMYLSERSGGVRRDEHDHQEIEMLLESYHKVCDEIVQASGNLVTNIRNTEEIVKAILDANRNSLMLLELKVSIGTLGLAVGTLLSALYGMNLKNFIEESDLGFGAVSAVCFASSAFVCIYGLLKLRRVQRVKMWGEGGIQDPYMGGLGLRGSTPLPSRGNWRSDAIDPAWTGLPVEGRAQRMRRVRGAIGTAASQPSVPLSSHAAAKPKLSGKTSPVNAPQSGNVSNKNQTQKQRQSEPEKDEFEDPTMGGAALGASR BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 157->557|MRS2_ASPFU|e-147|71.6|394/597| TM:NTM 2 TM:REGION 438->460| TM:REGION 473->495| SEG 13->24|slrllrflrsqs| SEG 125->136|rnrnflrrllgl| SEG 229->244|rhsaillsllhlrvli| SEG 358->370|daiedlleadddl| SEG 476->489|avsavcfassafvc| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 274->438|3bghA|2e-16|7.9|151/187| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 294->497|PF01544|1.1e-10|19.6|184/292|CorA| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 441->468|2bbjA2|4e-06|21.4|28/57|f.17.3.1| OP:NHOMO 196 OP:NHOMOORG 145 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1---11-11-----111112111212111111111111111111111111111111211111222222222122222-2222222211-12111111111211111-1-11--11--1111-1112111351-1111---11111111-111-111111----------------5--1811---2--114------1- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 151 STR:RPRED 24.0 SQ:SECSTR #################################################################################################################################################################################################################################################################################cccccccccccccccccEEEEEccEEEEcTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTcEEEEEccGGGccHHHHHHccEEEEEEEEEEEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEEEE###cTTTccEEEEEEEEc###########cccEEEEEEcccccHHHHHHH############################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 619-619,622-622| PSIPRED ccccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccHHcccccccccccccccccccccccccccccccHHccHHHHHcccccEEEEEEEcccccEEEEEccccHHHHHHHHcccccHHHHHccccccEEEEEccEEEEEEccEEEEEEccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcEEEEEEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHccccHHHccccccccccccccc //