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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02557
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  28/68 : Bacteria  79/915 : Eukaryota  198/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1c.37.1d.92.1g.40.1
:2038 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1199->1713 2wjyA PDBj 8e-53 37.2 %
:BLT:PDB   1791->1840 1aafA PDBj 1e-04 42.2 %
:BLT:PDB   1826->1857 2ec7A PDBj 4e-04 53.1 %
:RPS:PDB   1211->1662 3d3xB PDBj 2e-39 10.7 %
:RPS:PDB   1791->1840 2cqfA PDBj 4e-05 26.1 %
:RPS:PDB   1825->1859 2bl6A PDBj 1e-06 37.1 %
:RPS:SCOP  240->553 1wa5C  a.118.1.1 * 2e-04 9.5 %
:RPS:SCOP  1157->1293 1w36D1  c.37.1.19 * 7e-08 20.8 %
:RPS:SCOP  1412->1663 1t3aA  d.92.1.7 * 3e-48 13.1 %
:RPS:SCOP  1799->1839 1u6pA  g.40.1.1 * 8e-07 18.4 %
:RPS:SCOP  1826->1861 1bj6A  g.40.1.1 * 4e-07 41.7 %
:HMM:SCOP  1201->1702 1qhh.1 c.37.1.19 * 3.2e-62 27.1 %
:HMM:SCOP  1825->1863 1f6uA_ g.40.1.1 * 3.3e-06 41.0 %
:RPS:PFM   1218->1522 PF00580 * UvrD-helicase 5e-06 29.4 %
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:HMM:PFM   1825->1840 PF00098 * zf-CCHC 4.7e-07 50.0 16/18  
:HMM:PFM   1203->1429 PF04851 * ResIII 4.7e-06 22.4 152/184  
:BLT:SWISS 502->708,971->1699 SEN1_YEAST e-162 43.0 %
:BLT:SWISS 1800->1861 ZCH13_HUMAN 1e-08 40.4 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_02560 GT:GENE CIRG_02557 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 2038 SQ:AASEQ 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DISOP:02AL 2038-2039| PSIPRED cHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHccccccHHHHHccHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHcccccccEEEEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHccccccccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccccccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHcHHHHccccccccccHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEcccccEEEEEEEccHHHccccccccccEEEEEcccccccccccccEEEEEEcccccccEEEEEEEEccccccHHHcccccEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHcccccccccccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHccccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHcccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEcccccccHHHHHccccccEEEEEcHHcccHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccccEEccHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHcccccccccccEEEEEccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHcccccccEEEEEEEcccccccccccccccEEEEEcccccEEEEEEcHHHHHccHHHHHHHHHHHHccEEEcccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHcccHHHHcccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccc 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