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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02923
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  27/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.69.1d.61.1
:923 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   260->516 3eijA PDBj 3e-09 10.3 %
:RPS:PDB   618->677 2axuB PDBj 6e-04 16.7 %
:RPS:SCOP  207->299 3b5eA1  c.69.1.14 * 8e-04 16.5 %
:RPS:SCOP  292->457 2fsqA1  d.61.1.4 * 3e-07 9.1 %
:HMM:PFM   397->424 PF01535 * PPR 6.5e-05 42.9 28/31  
:BLT:SWISS 240->441 PP235_ARATH 6e-05 27.3 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02926 GT:GENE CIRG_02923 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 923 SQ:AASEQ MIPKPTTGATLPSRGALHVLRRLALAGSTVGAIGSACTVATISYEVNRRVQLAENLVENKRSLKTTCPNYDSTARGAMVAKMMEAAEAGEFVGMDSFRQKGVSEVNRDQSDKRTLGELNMRNSSELNDPESKGTRRRRGEEALAWMQSLHEPWNTRLYGPRPTTRRSNSNVDDASFTNLLAELQSKNAAQNRPDHGAEDIPASLPLYNLRYHDNAADNAILAEKLLLQGKPVEAAQRFLRAYPTASPNLPEEAKQLCVRLFNGNLDAENVHLAHRLFRWMDPAHVISQEAWESLIAALAKKWNLESIATLYTDHADQFELSKPLRYSVLRSLTDSFRLEEARTMIFRFLKDDSECTLCAVYLGKLWKKTRNAELVEAQFKAILSSFEENNMQVSKILFNALLEAYVESGKDEHADELVENMKSKYNFSLPARTLGLLAYGRALKSDWDGVESYFEEIHKLDGHPDGKWFAKIFDRVFLEYFLGNSASNIRDFVLRAIEKYDLVPDKVLFEHIVQAYIQKGSPKMVLELIDVAESRSWPVMMKRDRFIDLLRIQRQNCGKANVGLWQMFRRFGRFSTSQRILGYNKDYFPTGKSFDSLGKTAPTVWSRKLNSKLPSRDFNHFPALYQQMIHCMHVGSMDKAIELYNEAKMLGKVMGELDIDLALTATIVHHGSFEQAKSILAEEKDSFPWIDKSSMPPFFQKLLTAGSTSEAEALTMAILNFYRILERQVLPIKHHVTVSTCSNLIRRRRTKNALRLIRAVNRSKFGGTSPFDSVAVLMIAKASSIIGNLAGIRWAILTALKRDSALSKDLVAEIHQTIERFKSRSPVASLSGDYGQEVKYLEDLAEILNQKELYIAARNSRRAPPPPGPDPYTPDPNQSQSAGFVIPELTDPNGHLLSDTLGTWLERVQLEHALTANNLTFSK BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 240->441|PP235_ARATH|6e-05|27.3|183/687| SEG 77->90|amvakmmeaaeage| SEG 864->876|ppppgpdpytpdp| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 260->516|3eijA|3e-09|10.3|252/276| RP:PDB:REP 618->677|2axuB|6e-04|16.7|60/296| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 397->424|PF01535|6.5e-05|42.9|28/31|PPR| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 207->299|3b5eA1|8e-04|16.5|85/209|c.69.1.14| RP:SCP:REP 292->457|2fsqA1|3e-07|9.1|164/232|d.61.1.4| OP:NHOMO 27 OP:NHOMOORG 27 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------111111111111111111111111111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 412 STR:RPRED 44.6 SQ:SECSTR ###################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHccHHHHHHHHHHTccGGGGHHHHHHHHHHHTccTHHHHHHHHHHHHHcTTTccHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHcTTHHHHHHHHHTTcccTTTTTTccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHTccGGGTHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTHHHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHTcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccTTcHHHHHHHH####HHHHHHcc##ccHHHHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHcTTHHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHTccccH###################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 8-18| PSIPRED cccccccccccccccHHHHHHHHHHcccHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHccccccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHccHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcHHHcccHHHHHHHccccccHHcccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHcccccccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccc //