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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02926
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  189/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.160.1d.218.1
:1069 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   187->446 2ikfB PDBj 4e-10 27.9 %
:RPS:PDB   135->449 2b56A PDBj 6e-36 17.9 %
:RPS:SCOP  166->251 1no5A  d.218.1.5 * 8e-13 21.4 %
:RPS:SCOP  282->448 2b4vA1  a.160.1.4 * 4e-18 24.0 %
:HMM:SCOP  138->321 2b4vA2 d.218.1.10 * 6.8e-35 34.8 %
:HMM:SCOP  282->466 2b4vA1 a.160.1.4 * 6.1e-46 45.0 %
:RPS:PFM   121->160 PF01923 * Cob_adeno_trans 3e-04 50.0 %
:RPS:PFM   371->425 PF03828 * PAP_assoc 1e-11 49.1 %
:HMM:PFM   370->425 PF03828 * PAP_assoc 2.2e-20 47.3 55/61  
:HMM:PFM   173->219 PF01909 * NTP_transf_2 2e-09 26.7 45/93  
:BLT:SWISS 104->452 CID13_SCHPO 1e-91 47.3 %
:BLT:SWISS 762->873 CXA5_MOUSE 3e-05 29.1 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_02929 GT:GENE CIRG_02926 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1069 SQ:AASEQ MGAEVYGDAASSHTEGDSSPIASETSTNMSWPIPADAHSQLPPRPALTTQQSSSVPATPFHHPRGLRFPSRSHSRSPSPNRRSSSPRSAHSELNHILPLRKQYGGCKYETAMAHFRRRMPYSLGADLLPEEQGPLKDKLAPEDEERLTSHMKELYKKLLPSAESEQRRIKFVKKLENLLNTQWPGNDIKVHVFGSSGNKLCSSDSDVDICITTPFKELEHVCLLADFLAKNGMERVVCVSHAKVPIVKIWDPELQVACDMNVNNTMALENTRMIRTYVEVDERVRPLAMIVKHWTKQRILNDAALGGTLSSYTWICLIINFLQTRSPPIVPSLQKRAISRRKQQGNGQSSSSFDDNLEELASFGHKNKSTLGELLFQFFRYYGHEVDYEKNVMSVREGKLVSKEGKGWHLLQNNRLCVEEPFNTSRNLGNTADDTSFRGLHLELRRAFEAVAIGDLGKCCERYEYPPEEERTWERPAPQPRAILTPMPALPSRGGRGGGRGGRHTNHYHRGPNNMGRRASNTANRNNIRSANPSFTADIAFQAQQAQSILHDHLYQRIQILQAQEQELRMQLQNQALMTGRAPPTLLRQPYLQFTLPQHENISPEENPRVRASSVNQPPLTAPIRQNVFFNTSYVPVTLPGVQGTNTNPPSPSLPSAVPDVRRSHRRSSVANDSPRGLRAQSQPARPVPSVMLPNFPAVQQDMNSRRSPECPPRSVTEGESYLPNGVAIPKPTFGDENLPSDSPEYRTYVTMADQSNGSSGHLSPPKIGSHFMQPQRLTRSQTLPDRGPLIIDGSVPPSEHRHSIANHSSEQFMTDFSTSSSADRMYDTPRTTPDTLSQGLHEQESYDDLFGSSFETHHGSQGAGHMSGWEPGLNHTDVTATGHMGRVETLSERLQRFQLSDPNFSLDTSRNTDANHYRSTQYLYPIDDQLNCLHTKGSPEDNHPQLFNSAQSPAKDSRMMSPTTKHCVNGFDFEKVNGMPHKPKAKGRYENSNSFPVSDHKEKQGDHYRKSNGGHHLHSNANGHHSTSNGWQTTKRRNKKGPKLSAEQNDGTARPEPIPIDESERKGG 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138->321|2b4vA2|6.8e-35|34.8|141/0|d.218.1.10|1/1|Nucleotidyltransferase| HM:SCP:REP 282->466|2b4vA1|6.1e-46|45.0|169/0|a.160.1.4|1/1|PAP/OAS1 substrate-binding domain| OP:NHOMO 724 OP:NHOMOORG 189 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3311991-3--122433221111212211111122222123222111122213122322222111111-1221112222211111155-124311422121-3543-12277A74784343575B75D4Pt82D8F64577467667542834F37674333535634537392411126-211146642442-3547- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 319 STR:RPRED 29.8 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 1069-1070| PSIPRED cccEEEccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEcccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccccccccccEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccEEEEEEcccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHcEEEccccEEEEcHHccccccccccEEEEcccccccccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHccccHHHHHccccccccHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccHHHHccccccccccccccccccccEEEccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccHHHHHcccccccccccccccccccHHHHcccccccEEEEccccccccccccccccccccHHHHHccccccHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHcccccccccccccHHHHccc 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