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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02935
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  177/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.151.1
:1091 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   147->447 1i9zA PDBj 2e-17 37.6 %
:BLT:PDB   636->757 2qv2A PDBj 2e-07 40.8 %
:RPS:PDB   128->337 2ddsD PDBj 2e-05 14.7 %
:RPS:PDB   367->449 2ddsA PDBj 1e-05 7.3 %
:RPS:PDB   603->728 2e6jA PDBj 2e-05 21.9 %
:RPS:SCOP  144->447 1ntfA  d.151.1.2 * 5e-13 20.7 %
:HMM:SCOP  36->578 1i9zA_ d.151.1.2 * 2.5e-52 34.7 %
:RPS:PFM   227->449 PF03372 * Exo_endo_phos 7e-12 47.6 %
:HMM:PFM   59->546 PF03372 * Exo_endo_phos 2.6e-26 23.0 239/276  
:HMM:PFM   865->942 PF00620 * RhoGAP 0.00017 22.9 70/153  
:BLT:SWISS 147->447 INP53_YEAST 4e-25 39.1 %
:BLT:SWISS 520->757 OCRL_HUMAN 7e-21 29.4 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02938 GT:GENE CIRG_02935 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1091 SQ:AASEQ MSIHESSTPTPLREAPGAFPDQPDDGDGAQGASNLNTLSRAVHARRAEYIRQRTVKVRIGSWNVAALPGTEEDLGRWFAGPLERTDKSVGEDAPQNVELGHADGASLANDENRSNERCAGKPPSLQGPSRNATVNDRAAQPADEDMDIFVLGLQEIVDLSSPAETLRPYVDPAPANKWKEAIHKALPSGYTLISSQQLTGLLLLVYASQSIAPSISSVSSTSVGTGLMGYMGNKGAVATRIVLGGATRIVLINCHLSAGADKASLDRRNWDASQIVMRTKFDPIEGDDDVDFTSSQTLGDEEFAFWFGDLNYRLEDIPGEDVRRLLHLHTENDFGPLPKRDTDSAKSRCSQEFSRSEGNFSSEAISMADNDVETCQDPASLETTLASLLPHDQLRAQQKNRKAFYEAWREGDIKFLPTYKYDIGRIGQFDSGEKQRSPSWCDRILYRTKEDYLKYQRRMKEDEDARKRDEEMKYLGLDQEAEDDNVLFDYDPEFDGAEYDENEDTVEDIVADTDQGNGSGGSLNMTCYRSHQDIVSSDHKPIHADFILTYDAVIQDLKAKVHQEVARELDKAENEARPDITVVVDQPANISEDHKLAPNGIADRDTVSFGQVRYDVPISRSVTLANTGSVPATLSFQYRPVAADEDSRVSPPWLHLKVDWPADAHAQTSSSQKEYTLPPGESAHVQLVLCVFDVNFVRQLNTGEAELEDILVLRVSSGRDHFISVRGKWLLSCFGLSLEELTRIPEGGIRSLDVASLSPYLSGNNQIDNIRTSAPRELFRLTEAVAELTERSIAEWGMIGNGDDTENNARPWGCQRAGWPFEPETWSLRNSRERYKLLGLIREGLDTGAPFFAQFPAEVPSRYRAELLAETLLAFLRSLYDGLITRALWSEVESQVFSYEKSMSASLSPEQSQSQVLEALASSPAHSVSFTFLTFMLNRISSEIAPLVPPPISTPVSPITPTTPSISSLDRRSTDLTEPLSPSISMAAPILPRPSITFSFPFRSRSRTLSSSDDNNVPVSHSRPPTSSATINIATSSIARRQAVNKAFVAIFADVIYSKDIPVPEKDKERRVLAERKRSVIEPFLRSEADS BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 147->447|INP53_YEAST|4e-25|39.1|230/1107| BL:SWS:REP 520->757|OCRL_HUMAN|7e-21|29.4|198/901| SEG 15->32|apgafpdqpddgdgaqga| SEG 207->226|asqsiapsissvsstsvgtg| SEG 457->473|rrmkededarkrdeemk| SEG 862->879|ryraellaetllaflrsl| SEG 946->969|plvpppistpvspitpttpsissl| SEG 992->1012|prpsitfsfpfrsrsrtlsss| SEG 1026->1039|tssatiniatssia| BL:PDB:NREP 2 BL:PDB:REP 147->447|1i9zA|2e-17|37.6|218/336| BL:PDB:REP 636->757|2qv2A|2e-07|40.8|98/305| RP:PDB:NREP 3 RP:PDB:REP 128->337|2ddsD|2e-05|14.7|190/291| RP:PDB:REP 367->449|2ddsA|1e-05|7.3|82/299| RP:PDB:REP 603->728|2e6jA|2e-05|21.9|96/112| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 227->449|PF03372|7e-12|47.6|145/261|Exo_endo_phos| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 59->546|PF03372|2.6e-26|23.0|239/276|Exo_endo_phos| HM:PFM:REP 865->942|PF00620|0.00017|22.9|70/153|RhoGAP| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 144->447|1ntfA|5e-13|20.7|213/280|d.151.1.2| HM:SCP:REP 36->578|1i9zA_|2.5e-52|34.7|331/0|d.151.1.2|1/1|DNase I-like| OP:NHOMO 705 OP:NHOMOORG 177 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----331-----3322323333323333333332333333333333233333331333222221122111311213312221111111-2323331313-223312-22267A47BA5222164PI4B5Oy92BCB3444554762342294292575M1132332243343321-------1-11A88-A2111111- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 465 STR:RPRED 42.6 SQ:SECSTR 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PSIPRED cccccccccccHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEEEEcccccccHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccHHccccccccHHHccccccccccccccccHHHHHcccccccccEEEEEEEEEEEcccccHHccccccccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccEEEEEEEEEccEEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccEEEEEcccHHHHccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccHHcccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEcccEEEcHHcccHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEcccccEEcccccEEEEEEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccccccccccccccccccccccEEccccEEEEEEEEcccEEEEEEEEccccccccccccccHHHHHccccccccccccccccccEEEEccccEEEEEEEEEEccccHHHHHHcccccccEEEEEEEEccEEEEEEEEEEEEcccccccHHHHHHccccccccccHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccEEHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccc 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