[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02955
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  174/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.121.4
:1271 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   750->978 1cgwA PDBj 1e-06 7.4 %
:RPS:SCOP  751->902 1f8v.1  b.121.4.4 * 2e-04 14.8 %
:RPS:PFM   230->463 PF03399 * SAC3_GANP 2e-33 46.8 %
:RPS:PFM   943->1004 PF09770 * PAT1 6e-04 35.0 %
:HMM:PFM   227->474 PF03399 * SAC3_GANP 2e-56 40.1 192/201  
:HMM:PFM   1008->1138 PF07382 * HC2 0.00019 23.6 127/194  
:HMM:PFM   650->665 PF07145 * PAM2 9.8e-05 37.5 16/18  
:BLT:SWISS 124->549 SAC31_SCHPO 3e-57 39.6 %
:BLT:SWISS 713->905 SEC16_NEUCR 5e-05 22.5 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_02958 GT:GENE CIRG_02955 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1271 SQ:AASEQ MSTFPTGTKRGLGASSSRGRMSRGSRASSRQSNPIRDSNAHEEPSMKAGRGRGSGTTSSMRGQRASSAVRMENGRSSGGLSRGLRGTKSQSSSLFGSAPTNSIFSIDRARDPRRKQGSVPPFKPQKKDKNQDYMSRFEELKRERTKQRTKAINEGLMADPSQPTSLNRAITPTGACTDMCPEYERVERIVQKMVDKSEKLLNLDTGELDIAETRMIKRFRRSAAGYDEQLPSDIRTPNALLQTLNYILRYVISDDDTLGGIHKFVWDRTRSIRNDLSIQQLTQQQDVEIAVKCLERIARFHILSLHLLSSPTNTEQFDHHQEREQLNNTLLSLLYYYDDFRGRMVFPNEDEFRAYYILFSIHDQRPDLEARVQKWPRELLHSPRIKVALELFAAAGNTWEYQGTLDARRPNAIAQGLYSRFFNLVRSKSVSYLMACIAEIYFSQVRQTAIRSIWKAYCRQPLSQQHKNQEWTIDRLTTALWLDDEDQTIKFCEDQDLELATDSEGRLYLDWGSRSVDSVAFQPSSQQIFSERLVESKRYGRTQQAIILGMSVSQALKHGMIDKMLLHTESESAAVSAKGDGEHGGLFVSDDEGEKELQKNHDNIPNIEVQAEMPSTSPSIFSRPLESGNSQTSTNPFINHLTGTFPAGSSSTSSLSASAPPFVPQGLTNFTKSQPAQSVPSSIELRLDEVKPPVSSSPFPSVSMSGPSAPVFSPFGSNFGNPFASNLTSAKDASAPQLSPFPAKKGLFGTPSAPETVSFGRPSSSPVVATVESVESPKTPPFGPFTSNSSTIATDQPDIQKTTSKGQGSKIASTTLFQGTWGGASPAADTVSKPSNSAHPEQPQNPLFPSTSAEIFGLQPSESRESAPSPFGVVEQKQTSSQANAGKVPTSLFSSAQPTESSKPTKSVLSTSIISSTPSSNPFSATPPFTGSQSQKSLDVKAPEPKYPPPSLVGQPSSPKKTQGAPAPAVQPPTSRPSEKPVEDQDRVRRELEQQALREHEKRRILEVEAAKKEAAKRELERLKAARIEKEKKEAVEREAARREKMMREQEEELRAARREIEKREAIERKAAEKEAARKNAIEKEVAKRKALDGENEEEQSRGKAKMAKLSPKQTLTVEELLALELSKQKAAPPKQATERKSLIDEDELLFTAARMAGRELSRTGLFDGIPQLPESVSRPSTPASSFSSSVMGRASVGSREISDGQHAMVNGYKVALAPETPLGLGRSLSRTEQRIRLTGAHGLAYKPIANLLRTPNEKGKQRAPWGNTTS BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 124->549|SAC31_SCHPO|3e-57|39.6|399/1024| BL:SWS:REP 713->905|SEC16_NEUCR|5e-05|22.5|191/2084| COIL:NAA 71 COIL:NSEG 2 COIL:REGION 1000->1025| COIL:REGION 1031->1075| SEG 10->32|rglgasssrgrmsrgsrassrqs| SEG 49->62|grgrgsgttssmrg| SEG 74->86|grssgglsrglrg| SEG 330->337|llsllyyy| SEG 642->662|tgtfpagssstsslsasappf| SEG 690->708|vkppvssspfpsvsmsgps| SEG 910->930|stsiisstpssnpfsatppft| SEG 1009->1085|eaakkeaakrelerlkaariekekkeavereaarrekmmreqeeelraarreiekreaierkaaekeaarknaieke| SEG 1119->1126|eellalel| SEG 1176->1190|svsrpstpassfsss| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 750->978|1cgwA|1e-06|7.4|229/686| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 230->463|PF03399|2e-33|46.8|188/200|SAC3_GANP| RP:PFM:REP 943->1004|PF09770|6e-04|35.0|60/612|PAT1| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 227->474|PF03399|2e-56|40.1|192/201|SAC3_GANP| HM:PFM:REP 1008->1138|PF07382|0.00019|23.6|127/194|HC2| HM:PFM:REP 650->665|PF07145|9.8e-05|37.5|16/18|PAM2| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 751->902|1f8v.1|2e-04|14.8|149/380|b.121.4.4| OP:NHOMO 216 OP:NHOMOORG 174 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-----1-111111111112111211111112113111111111111111111111111111-1111111111111111122-11111-11111111115-111432113111--11112111261111211111111-112112112-1111111222111211112-1--11111-13--213111-1111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 269 STR:RPRED 21.2 SQ:SECSTR #####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccccccGGGGGccTTcccccccEEEcccccccccEEEccccccEEEccTTTTTTccccEEEcGGGccccEEEcTTcEEEEEEcccccccEEEEEEccEEcTTcEEEEEEEcccccccEEEETTEEEcGGGEEEEcccEEEEEccccccEEEEEEEEcTTccccccEEEEEEccccEEEEEEEEEcccccTTcEEEEEEccGGGcTTcGGGccccccccccccTTcEEEEEEEETTcEEEEEEEEEETTEEEEcccccEEEEcccccEE##################################################################################################################################################################################################################################################################################################### PSIPRED ccccccccccccccccHHHHHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHccccccccHHHccHHHHHHHHHHccccHHHcccccccccccccHHHHHHHHccccccccccccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHccHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHccccccccHHHHccccccccccccccccccc //