[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02956
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  8/915 : Eukaryota  112/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1c.69.1
:916 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   64->211 3ef3A PDBj 5e-10 12.2 %
:RPS:PDB   433->523 3batC PDBj 4e-04 20.3 %
:RPS:SCOP  79->216 1cvlA  c.69.1.18 * 4e-09 26.5 %
:RPS:SCOP  296->519 1s9hA  c.37.1.20 * 8e-09 12.4 %
:HMM:SCOP  69->306 1ku0A_ c.69.1.18 * 2.8e-21 22.0 %
:HMM:SCOP  335->564 1w5sA2 c.37.1.20 * 0.00018 18.9 %
:RPS:PFM   145->203 PF07819 * PGAP1 5e-05 40.0 %
:HMM:PFM   127->203 PF07819 * PGAP1 5.4e-09 22.5 71/225  
:HMM:PFM   384->528 PF05729 * NACHT 1.3e-07 20.8 120/166  
:BLT:SWISS 47->317 SRAC1_BOVIN 9e-20 32.2 %
:BLT:SWISS 365->720 HETE1_PODAN 5e-23 27.2 %
:PROS 159->168|PS00120|LIPASE_SER
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_02959 GT:GENE CIRG_02956 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 916 SQ:AASEQ MARLSCMPIKSFRRKKADTDSSSTDSLHDRVKIKFTTLFSRTKLFGRTAAVVDDGVADPKGPLGLNILHSPSEPLVDFIFVHGLGGGSRETWSNTSSVCHFWPQEWLRKDPAFKNVRVHTFGYDSHATKDSVLHTHHFCRSLLSEMYTSPYLGNTDTPIVLIGHSMGGIVIKKTYLLAVQDPTHRTLAKRIHSIYFLATPHSGCDSARLLNNVLRIAYSSRDYLLDPKVGSAAIDSINDEFRNYADNLHLWSFYETRKTKVGLFSRLIVGPNMAKLGYRGEKQIAMPADHRSICKFDSPKDLCYLILRDSLAETVESISKIVPKLEENPACEQIKFLENYLDLSGAIDDDLLVAQDDRMPGTCEWFFKKQNYLDWSDFASDTPRILWIKGKPGSGKSVLAGYAIDRLLASNESCSYFFFKHEDKSKARLSSCLRSLAFQMARMDVQIRETFSKMQKDGVNIDNENEHSLWKKLFLSGILQAASTTNYWVIDGLDECENVSFLFDSILPQLDESIPLRILITSRETPELQGHIVGLSRDQFRLEIISPSDIRSDVEFLVGVKTKSPALKDAGDHAALVENIVEKANGSFLWTDLVLKELPICYSGTEINRVLDGLPQEMEALYQRVLGQMALNTRGKNFSQAILTWTTCAMRPLTVKELAGVLKLDINEEFPKLEEAILARCGQLISVDEFSNVRLAHETAKNFLLKDGLDSEFAVSETEAHTRMARICLIYLTGEAIKPRSTGGSRSTSAVHDTDSDFSVYACEAFSYHLVRADSREHDILLLVNKFLESNIIPWVEIMMAHNQNPILLIHTAKNVKKYVNSCATELSPLDGNVKMAKERVTELVHIITKFSDALLTSPSAIYSAILPFYPTECTASKPVGPGRPLSILGLSDVQWVEQLCSMSFPTRGNRLSLPC BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 47->317|SRAC1_BOVIN|9e-20|32.2|258/654| BL:SWS:REP 365->720|HETE1_PODAN|5e-23|27.2|349/1356| PROS 159->168|PS00120|LIPASE_SER|PDOC00110| SEG 18->26|dtdssstds| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 64->211|3ef3A|5e-10|12.2|139/196| RP:PDB:REP 433->523|3batC|4e-04|20.3|79/85| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 145->203|PF07819|5e-05|40.0|50/98|PGAP1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 127->203|PF07819|5.4e-09|22.5|71/225|PGAP1| HM:PFM:REP 384->528|PF05729|1.3e-07|20.8|120/166|NACHT| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0006505|"GO:GPI anchor metabolic process"|PF07819|IPR012908| GO:PFM GO:0006886|"GO:intracellular protein transport"|PF07819|IPR012908| GO:PFM GO:0016788|"GO:hydrolase activity, acting on ester bonds"|PF07819|IPR012908| GO:PFM GO:0031227|"GO:intrinsic to endoplasmic reticulum membrane"|PF07819|IPR012908| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 79->216|1cvlA|4e-09|26.5|117/316|c.69.1.18| RP:SCP:REP 296->519|1s9hA|8e-09|12.4|218/268|c.37.1.20| HM:SCP:REP 69->306|1ku0A_|2.8e-21|22.0|223/0|c.69.1.18|1/1|alpha/beta-Hydrolases| HM:SCP:REP 335->564|1w5sA2|0.00018|18.9|201/0|c.37.1.20|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 811 OP:NHOMOORG 120 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1---2---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------34H-5EM5KKDH968666KE97876698444KJRmRNmZCCIc6828----------------------------494T5V-----------1--142112111--11-22-11151-122111111111111111--311111112111---11---------------1--1611--1211- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 385 STR:RPRED 42.0 SQ:SECSTR ###########################################ccccTTccEEETEEcTTcccTTTTccGGGcccEEEEEEccTTccTTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHcGGGEEEEEccTTccccGGGGcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTcEEEEEEETHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHTTEEEEEEEccTTTTTTTTccTTccGGcTTTTcccccHHGTcccccGGGGccHHHHHTHHHHHHHHHHHGGGcGGHHHHHHHHHcccTTccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEcccccHHHHHHHTTcccEEEEEEEcccGGGTcHHHHHHHHHH###################################################################################cccHHHHHHHHHHHHHH#HHHHHHHHHHHHHHHHHH###HHHHHHHH########HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcc######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 916-917| PSIPRED cccHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHcccccccccccccccHHHHcccccccccccccEEEEcccccccccEEEEcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccEEEEEcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHcccEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEcccccccccHHHccccHHHHcccccccEEEEEEccHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccccccEEccHHHHHHcccccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcHHHccccHHHHHHHHHHccccccEEEEEEccccHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHccccEEEccccEEEEEEHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHcccccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccEEEEEcccccccccccc //