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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_02965
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  91/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1d.193.1
:963 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   360->501 1dlcA PDBj 8e-04 22.8 %
:RPS:SCOP  11->120 1wa5C  a.118.1.1 * 3e-06 12.8 %
:RPS:SCOP  481->519 1vzyA1  d.193.1.1 * 4e-04 10.3 %
:HMM:SCOP  1->822 1wa5C_ a.118.1.1 * 2.2e-34 19.5 %
:HMM:PFM   33->78 PF03810 * IBN_N 1.3e-05 30.4 46/77  
:BLT:SWISS 28->630 KA111_SCHPO 6e-22 22.9 %
:PROS 884->894|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_02968 GT:GENE CIRG_02965 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 963 SQ:AASEQ MEKQGDAPQLIREATELAQVLSAPGNASFVQTAQARLQTLQKSAAGWAIADSLLGSEDANVRFYGALTLTMKIHQDWANLGEQMVRDLLIRLVDCFLLLVNKNETPVVMRKFITSMTAMFFKPQAPWTHCIRHVAISLANGKYLPEEQADLQSFQTLVLPSLNYDRLLAVMSFSTTLAEESVRHAQNSSGYQDRLTANMNDAFFLINYSFQRAINNAQASANNVSSDQPTNTAQEAISSLQAWITAMRSVRVDRGALSSAVNVPISCAIRFLSEPRLAPNTMELLTDIILSQPKLLTPDHFTGIMDFLIGSDGEQYAMAILNGEFEDDQMRFLELLLRFASSETQIRVLTHSPDEKHERILFLLFKLFHAPGVGAVEDMASNLLLEFWTEAADNISELIMEGAFDEPTLSVKENFTRVIAECFDKFRYPNPSVLSEWEDDDVKIFNTFRRDFSDFLLATYPLLGVPMIQQIQERAAVAIRDHDWERFEVAMFCLASLADTIAENKHADDLLHALFHSELFDAICFGRTDIPLKTRQTLSDMIAKYTPYFERNHNLLAPVLNFLFSSLGMPSSEQAAAKSISSLCGTCRQPLTIYVEEFISKFAQLHANPSTNGHTLERVVEGIASVIQAVGSELGKANLLLKLLDPLCQEAKQARDISRTGQHEAGLASGFRVMGCTASIGKGLRAPEEFCINLDEESPDRSAESDFWTGDPRATSLQSLIIQILEHLVNEFCADGDIIEGACDVLKAGYTEKSPGLTYLPLSDFHCYTSCRSFFSLIEAPQDKPEVVQAILHFTLVTLKGPDTLPLRAACSFWTTLLGLHDLPPAFTPDGLYKGQEQTATAKPFDAYLAQLGDVVISQIAGKCARSELDHFSEVIKKFAFQHPGAAKMHLGNALVSLDASSNEAAGGPAGQPGNNHNADSGVSKSERARFLASIFAVRGSRATNNLVREFWVSCRGKGFAYA BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 28->630|KA111_SCHPO|6e-22|22.9|571/990| PROS 884->894|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I|PDOC00161| SEG 213->226|ainnaqasannvss| SEG 634->647|lgkanlllklldpl| SEG 903->919|neaaggpagqpgnnhna| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 360->501|1dlcA|8e-04|22.8|114/584| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 33->78|PF03810|1.3e-05|30.4|46/77|IBN_N| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 11->120|1wa5C|3e-06|12.8|109/937|a.118.1.1| RP:SCP:REP 481->519|1vzyA1|4e-04|10.3|39/233|d.193.1.1| HM:SCP:REP 1->822|1wa5C_|2.2e-34|19.5|652/0|a.118.1.1|1/1|ARM repeat| OP:NHOMO 97 OP:NHOMOORG 91 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------111111111111111111111111111111111111111111111111-11-1------1------------11--1111-11111-1-11------12-11-1--11111--2-141111---111---------1--1----1--------1---------------------1--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 114 STR:RPRED 11.8 SQ:SECSTR #######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHT#TccccccHHHHHHHHHHHHHHTccc##HHHHHHHHHHHHHTccc###cHHHHHHHHHHHHHH####HHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHGGGccTTcTTTTHHHHHHH##################HHHHHHHHHHHH############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## PSIPRED ccccccccccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccccHHHccccccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccc //