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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_10401
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  353/915 : Eukaryota  9/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:452 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   21->269 1zcdA PDBj 5e-26 31.4 %
:RPS:PFM   18->269 PF06965 * Na_H_antiport_1 3e-49 47.0 %
:RPS:PFM   334->451 PF07332 * DUF1469 3e-05 31.6 %
:HMM:PFM   1->280 PF06965 * Na_H_antiport_1 2.9e-87 44.0 277/378  
:HMM:PFM   333->450 PF07332 * DUF1469 3.9e-32 38.1 118/121  
:BLT:SWISS 19->309 NHAA_RENSM 5e-82 57.4 %
:PROS 67->78|PS00962|RIBOSOMAL_S2_1
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_10406 GT:GENE CIRG_10401 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 452 SQ:AASEQ MVVPALVYVAVNVIGDGSLAGWATPVATDIAFAVAILAVISTHLPAGLRTFLLTLAVVDDLLGIIVIAIFFTSELHIGILLLALVPIGLFAVLVQRRIRSPWLLLPLAAIAWALVHASGVHATVAGVLLGFTVPVIARNPEAKRGLAEHFEHLVRPISAGIAVPIFAFFAAGVSLGGWSGITGAFRDPITLGIILGLVVGKTVGITGSTWLLARFTRASLDDDLAWTDVIGMAMLAGIGFTVSLLIGELAFGSDPSAHDHMKVGVLFGSVLAALLATVVLRARNRVYRRIEQLETIDANKDGVPDVFEDDQGRDRVPMAVDIVKSPGGEDPTIGKLVVDATRDISELVNKEITLAKQELKVSVTNAGVGIGLFAAAAFLLVLAVIMLSVSVAYFIHWAGLGLHWSFLIVFGFYVLLAALLGFIGVLKVKKVKAPEKAIAQGKEIPRALKGQR BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 19->309|NHAA_RENSM|5e-82|57.4|291/436| PROS 67->78|PS00962|RIBOSOMAL_S2_1|PDOC00744| TM:NTM 9 TM:REGION 30->52| TM:REGION 67->89| TM:REGION 109->131| TM:REGION 153->175| TM:REGION 189->211| TM:REGION 229->251| TM:REGION 261->281| TM:REGION 370->392| TM:REGION 406->427| SEG 2->13|vvpalvyvavnv| SEG 101->114|pwlllplaaiawal| SEG 270->286|vlaallatvvlrarnrv| SEG 366->385|agvgiglfaaaafllvlavi| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 21->269|1zcdA|5e-26|31.4|242/376| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 18->269|PF06965|3e-49|47.0|249/378|Na_H_antiport_1| RP:PFM:REP 334->451|PF07332|3e-05|31.6|117/119|DUF1469| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 1->280|PF06965|2.9e-87|44.0|277/378|Na_H_antiport_1| HM:PFM:REP 333->450|PF07332|3.9e-32|38.1|118/121|DUF1469| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0006814|"GO:sodium ion transport"|PF06965|IPR004670| GO:PFM GO:0006885|"GO:regulation of pH"|PF06965|IPR004670| GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF06965|IPR004670| OP:NHOMO 433 OP:NHOMOORG 362 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -1--1---------1------3---1------32221122-312221--21-1113-1113331112142111111111-1-------1111-111---1-21-1211-1---------------1--------11-----------------------------------------------12----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------11------------1-11---------------1-11111----------1--------1111111112-21113112-1-1----1---2--11---1----------11111111311211-1------------1-1--111--11-----122111111----------------1-----------1---------111--1--11---1------------1--1-1--1--1-11--1---1211-2---1-2--12112222222212111111111-11111111-3--2-1111112111111111111---1----------11111111111111111-11111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111--1------11-1-----111111111111111-------1111-----1111-212--222211111111-11111111111121----------------2-------------------------------------------------------- ---------------------------------------11-------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1--------------2-111---------------2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 242 STR:RPRED 53.5 SQ:SECSTR ####################HTcccccccHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccTHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHHHHHHccccGGG###cccHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHcccccccccTHHHHccTTTTHHHHHTTGGGcTT####HHHHTcccTTTcccccccGGGGTTHHHHTTccHHHHHHHHHHHcTTccccHHHHHHHHHHHH####################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 452-453| PSIPRED cccHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHccccccEEEHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHccHHHHHHHccccccccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccc //