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Clostridium perfringens str. 13 (cper0)
Gene : CPE1132
DDBJ      :CPE1132      hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  291/915 : Eukaryota  19/199 : Viruses  5/175   --->[See Alignment]
d.2.1d.3.1
:983 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   672->751 2k1gA PDBj 2e-07 38.5 %
:RPS:PDB   795->942 2anvA PDBj 6e-25 26.1 %
:RPS:SCOP  658->784 2evrA2  d.3.1.16 * 1e-24 29.3 %
:RPS:SCOP  788->948 1xjtA  d.2.1.3 * 1e-29 20.5 %
:HMM:SCOP  651->781 2evrA2 d.3.1.16 * 2.9e-28 36.7 %
:HMM:SCOP  775->950 1xjtA_ d.2.1.3 * 2e-30 33.1 %
:RPS:PFM   31->346 PF06605 * DUF1142 2e-12 29.1 %
:RPS:PFM   667->778 PF00877 * NLPC_P60 7e-14 43.4 %
:RPS:PFM   821->936 PF00959 * Phage_lysozyme 2e-13 47.1 %
:HMM:PFM   667->764 PF00877 * NLPC_P60 5.5e-23 36.8 87/105  
:HMM:PFM   64->347 PF06605 * DUF1142 8.1e-16 17.6 255/327  
:HMM:PFM   860->936 PF00959 * Phage_lysozyme 5e-08 29.3 75/110  
:BLT:SWISS 490->625 GLMM_CLOBK 2e-04 30.2 %
:BLT:SWISS 648->745 YDDH_BACSU 2e-13 42.6 %
:BLT:SWISS 794->974 LYS_BPB03 9e-13 33.3 %

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAB80838.1 GT:GENE CPE1132 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00075CH01 GT:ORG cper0 GB:ACCESSION GIB00075CH01 GB:LOCATION 1324849..1327800 GB:FROM 1324849 GB:TO 1327800 GB:DIRECTION + GB:GENE CPE1132 GB:PRODUCT hypothetical protein GB:NOTE 983 aa, partially similar to pir:F70700 hypothetical protein Rv0024 from Mycobacterium tuberculosis (strain H37RV) (281 aa); 40% identity in 120 aa overlap GB:PROTEIN_ID BAB80838.1 LENGTH 983 SQ:AASEQ 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627-656, 784-794, 977-981| PSIPRED 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