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Clostridium perfringens str. 13 (cper0)
Gene : CPE1368
DDBJ      :CPE1368      conserved hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  52/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.1.16b.1.5b.40.10c.6.3
:1710 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   598->700 3e38A PDBj 6e-07 10.3 %
:RPS:SCOP  34->152 1ifrA  b.1.16.1 * 2e-09 13.2 %
:RPS:SCOP  219->305 1nnxA  b.40.10.1 * 3e-10 21.8 %
:RPS:SCOP  604->816 2anuA1  c.6.3.1 * 1e-07 23.8 %
:RPS:SCOP  949->1037 1kv3A3  b.1.5.1 * 7e-06 12.6 %
:RPS:SCOP  1536->1628 1kv3A3  b.1.5.1 * 4e-04 17.2 %
:HMM:SCOP  218->305 1nnxA_ b.40.10.1 * 4.4e-05 22.7 %
:HMM:SCOP  597->838 2anuA1 c.6.3.1 * 2.8e-23 22.6 %
:HMM:PFM   238->305 PF01336 * tRNA_anti 2.1e-06 26.5 68/76  
:HMM:PFM   1338->1404 PF01336 * tRNA_anti 2.1e-10 34.4 64/76  
:HMM:PFM   1440->1504 PF01336 * tRNA_anti 0.00076 28.8 52/76  
:HMM:PFM   603->648 PF02811 * PHP 5.6e-09 37.8 45/175  
:HMM:PFM   650->688 PF12228 * DUF3604 1.3e-05 25.6 39/592  
:HMM:PFM   793->837 PF12228 * DUF3604 0.00026 22.2 45/592  
:HMM:PFM   1535->1602 PF00927 * Transglut_C 0.001 22.1 68/106  
:HMM:PFM   1669->1707 PF00746 * Gram_pos_anchor 3.9e-05 28.9 38/39  
:BLT:SWISS 252->439 HRCA_MYCS5 7e-05 33.1 %
:BLT:SWISS 495->932 Y512_CHLPN 6e-09 25.9 %
:BLT:SWISS 1041->1306 IFT52_HUMAN 2e-05 29.3 %
:BLT:SWISS 1332->1482 YHCR_BACSU 7e-05 32.2 %
:BLT:SWISS 1466->1624 YJ41B_YEAST 6e-04 31.3 %
:REPEAT 2|854->1041|1443->1631
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAB81074.1 GT:GENE CPE1368 GT:PRODUCT conserved hypothetical protein GT:DATABASE GIB00075CH01 GT:ORG cper0 GB:ACCESSION GIB00075CH01 GB:LOCATION complement(1614594..1619726) GB:FROM 1614594 GB:TO 1619726 GB:DIRECTION - GB:GENE CPE1368 GB:PRODUCT conserved hypothetical protein GB:NOTE 1710 aa, similar to pir:H72357 hypothetical protein TM0599 from Thermotoga maritima (strain MSB8 (546 aa); 30.2% identity in 533 aa overlap. Putative N-terminal signal sequence and 1 putative transmembrane region were found by PSORT GB:PROTEIN_ID BAB81074.1 LENGTH 1710 SQ:AASEQ MKKDYKILITKALSLSMVGSLFTSYPTFAKEIKTQEGDLIISEYLHGPSNSKAIEIFNGTGEGINLSNYDLAVYSNGKYEGSPVSQSLEDKIIESGETYVIYNNQGKDEKFTEVINDLENKLGVGSQTVGFNGDDVVLLRKNTGSGYEIIDSFGAKTEKDKKFYDSKFISARRKSEIKDGENNIDKTPFDVSVQWDVDTENLYDDLGKHDISWSEGENPSGKVLKVKEARNKNLGEEVTTRGVVTFNDRNKTLHIQDETGAIAISNFKSGVDFGAITKGNKIEISGTLDNFNGLLQVQATDIKVLGDLGMPDPKLVTIKELKESNFDSHYIELKNTVVDLEAKTLTQGEDVLDIYFIPSGLEVKTGDLVDVKGVIGRFNDKVQLYGSSAEFTKIVEDNESPVITHKKIEKANINEDLNIEAKVSDNNKLEEVSISFKGKEDTEFKKVVLKEEDGIFKALIPKEDLKASGMEYYIEASDGKNISRVPESGVYAFQVVDEDLSGPEVKNVLPKENSSVGENRRPVISGEFIDNSGVNVESVKIKLDNEDITKRAKITEAGFSYEIEKDLEDGEHRVEVSVSDSLGNNRVKEWKFRVGKINHYYGQLHSHTNISDGTGSLEDAYKWARDEGNADYFAVTDHSNWFDNDTEANINDGSMSKAWTNAQNISDKYNDDGNFVAMYGYEMTWSGSTGGWGHINTFNTPGFETRKNSDMNLKNYYNTISQLPESVSQLNHPGKTFGDFADFGFYSEGADKVVNLIEVGNGEGPVRGSGYFPSYEYYTRALDKGWHVAPTNNQDNHKGKWLTANDARTIILSEENSRDALYKAMNKKQVYSSEDKNMTIDYTVNNQIMGSNLGEVEDLDFNIEINDEDKEDTIKKVSIIANGGVEVISKEFNSNKVSWNFKLKPEYSYYYVKVVQGDQDIAVTAPVWIGENVNVGLNELKTDKDMLLVGDEAKLSIEVYNNSSERLNNIKVEFFNGEISDEKKIGEEIIESLEGNSLKESSITWQPERAGEFTIYAKATISINGTDKTFTKSSKIEVVNEGDVYKVMIDGAHANQYVTGNYAGKIDAFEKLLTENDCIPIINKEEITEKSLENVDLLVITDPQGIDEPKYEVYKSNFTDSEIDAIGKYMDKGGNIIITSRADYKDGVGEYSNGAQLNPILEKINSELRVNDDQVADYEVNEGQQFRLMLNKYSSPNFNLVEGLGEEDKFSFYSGSSVVLKDGAKGEKVDFLVSGHESTGTDDSDNQGDNVPLEKGQVNVLAVEELSNGGKVAVAGSTFFSNFEIDGTNAESKSNSKVTKNIINWMLPEKELEKLTIKEFREDKNNDGEPDRLGEEYVLEGIVTAQSEAVEPKNAFFEVIYIQDETGGINVFGVSNTPVKVGQKVRVKGRVEAYQGEFEIQISDESADLEIIDENINEVSPKEMSTGDSMLHENEGWLTKVTGKVVNMDDSNLYLDDGSGVSRIYVEGYIWDGINENMKGKWDPRIKVGDTVSAIGLSSEDPEGNRLRVRNTGEIVLQEEENLGVINTEITSDKNEIKENEKISLLAKVENRTKEVLENVTLKIFANNGENEVLLKEEKIDSLGANESKELTFEHAFELEGRYSIGIKLFDSEGNEIKSKNKEFSLVVLKEINGGDSDNNGDANNGGDSNNGSGNDSGEENKPGTDKPNTEKPEELPNTGNRMNANMLMGFGALYLALGFYMVSKRKKVR GT:EXON 1|1-1710:0| BL:SWS:NREP 5 BL:SWS:REP 252->439|HRCA_MYCS5|7e-05|33.1|154/340| BL:SWS:REP 495->932|Y512_CHLPN|6e-09|25.9|398/620| BL:SWS:REP 1041->1306|IFT52_HUMAN|2e-05|29.3|229/437| BL:SWS:REP 1332->1482|YHCR_BACSU|7e-05|32.2|143/1217| BL:SWS:REP 1466->1624|YJ41B_YEAST|6e-04|31.3|134/1803| NREPEAT 1 REPEAT 2|854->1041|1443->1631| SEG 1379->1391|vkvgqkvrvkgrv| SEG 1633->1658|nggdsdnngdannggdsnngsgndsg| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 598->700|3e38A|6e-07|10.3|97/334| HM:PFM:NREP 8 HM:PFM:REP 238->305|PF01336|2.1e-06|26.5|68/76|tRNA_anti| HM:PFM:REP 1338->1404|PF01336|2.1e-10|34.4|64/76|tRNA_anti| HM:PFM:REP 1440->1504|PF01336|0.00076|28.8|52/76|tRNA_anti| HM:PFM:REP 603->648|PF02811|5.6e-09|37.8|45/175|PHP| HM:PFM:REP 650->688|PF12228|1.3e-05|25.6|39/592|DUF3604| HM:PFM:REP 793->837|PF12228|0.00026|22.2|45/592|DUF3604| HM:PFM:REP 1535->1602|PF00927|0.001|22.1|68/106|Transglut_C| HM:PFM:REP 1669->1707|PF00746|3.9e-05|28.9|38/39|Gram_pos_anchor| RP:SCP:NREP 5 RP:SCP:REP 34->152|1ifrA|2e-09|13.2|106/113|b.1.16.1| RP:SCP:REP 219->305|1nnxA|3e-10|21.8|87/93|b.40.10.1| RP:SCP:REP 604->816|2anuA1|1e-07|23.8|181/224|c.6.3.1| RP:SCP:REP 949->1037|1kv3A3|7e-06|12.6|87/102|b.1.5.1| RP:SCP:REP 1536->1628|1kv3A3|4e-04|17.2|89/102|b.1.5.1| HM:SCP:REP 218->305|1nnxA_|4.4e-05|22.7|88/0|b.40.10.1|1/2|Hypothetical protein YgiW| HM:SCP:REP 597->838|2anuA1|2.8e-23|22.6|217/0|c.6.3.1|1/1|PHP domain-like| OP:NHOMO 60 OP:NHOMOORG 53 OP:PATTERN ------------------------------------------------------------1------- --1------------------------------------------1--------------1-1---------------------------------------------1-----------------------------------1--------11-----------1-----------------11-----------------------------------1111-------1----------------------------------------------------------------------------------------------1-------2-21---12212--------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--1----1------1-1--11-1-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------1-1------------------------------------------------------------------------1-------------------------11-2111111--- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 212 STR:RPRED 12.4 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################TEEEEEEccEccTTTTccccHHHHHHHHHHTTcccEEccEEEccccTTTTTccccTccccTHHHHHHHHHHHHHTcEEccEEEEEccTTcEEEEEcccccGGGccccccTTcccEEEEcHHHHHHHHHHTEEEEcccccccccHHcHHHHcTTTTTTccEEEEEETTEEcHHHHHHHHHHHHHHcTTGGGcEEccccTTccccccccccHHH###################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-3, 1220-1223, 1616-1617, 1634-1680, 1708-1710| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEcccEEEEEEEccccccccccccccccEEcccEEEEEEccccccccEEEEcccccccccEEEEEEEccccEEEEEEEccccEEEEEEEEcccccccccccccccEEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEcccEEEEEcccccEEEEEEEcccccHHcccccEEEEEEEEEEEccEEEEEccEEEEEEcccccccEEEEHHHEEEcccccEEEEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEcccccEEcccEEEEEEEEEEEEccEEEEcccccHHHEEEcccccccEEEEEEEEEEcccccEEEEEEcccccccEEEEEEEccccccEEEEEEcccccEEEEccccccccccHHHHHHHHHccEEEEEEcccccEEEEEEEEEcccccHHEEEEcccEEEEccccEEEEEEEEcccccccEEEEEEEEccEEEEEEEcccccEEEEEccccccccEEEEEcccccEEEcEEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEcccccHHHHHHHHHHHccEEEEEEccccccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEccEEccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccccccccEEccccccccccccccccccccccHHHEEEEEEccccccccccccccccHHHHHHHHHcccEEEEEEccccccccccccccccEEEEEccccHHHHHHHHHcccEEEEcccEEEEEEEEccEEcccccccccccEEEEEEEEEccEEEEEEEEEEEccccEEEcccccccEEEEEEEEEccEEEEEEEEEEccccEEEEccEEEEcccccEEEEEEEcHHHEEEccccEEEEEEEEccccccEEEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcHHHcEEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEccEEEEEcccEEEEEEEccccccEEccccHHHHHHHHHHHHHcccEEcccccccccccccccEEEEEccccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccccccccccccccccHHHHHHHcccEEEEEccEEccccccccHHHHHHHHHcccccHHHHHcccccEEEEEEEccEEEEEccccccEEEEEEEccccccccccccccccEEEccccEEEEEEHHHHcccEEEEEEccEEEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHcccccccHHHcccEEEEEEEEEEcHHccccccEEEEEEEEEEccccEEEEEccccccccccEEEEEEEEEEEcccEEEEEcccccccEEEEccccccccEEEEccHHHHHHHccEEEEEEEEEEEccccEEEEcccccEEEEEEEcccHHcccHHHcccccccEEEcccEEEEEcccccccccEEEEEcccEEEEEEcccccEEEEEEcccHHHHccccEEEEEEEHHHHHHHHHccEEEEEEEcccccEEEEEHHHHHHcccccccEEEEEEEEEEccEEEEEEEEEcccccHHHccccEEEEEEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHccccccEEccHHEEHHHHHHHHHHHHHcccccccc 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