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Clostridium perfringens str. 13 (cper0)
Gene : CPE1882
DDBJ      :CPE1882      probable collagenase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  25/68 : Bacteria  554/915 : Eukaryota  11/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.1.8
:786 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   12->168 2cliA PDBj 9e-09 11.5 %
:RPS:SCOP  13->188 1x7fA2  c.1.8.12 * 2e-10 13.4 %
:RPS:SCOP  730->781 1amyA2  c.1.8.1 * 7e-04 19.2 %
:RPS:PFM   84->297 PF01136 * Peptidase_U32 2e-53 50.0 %
:RPS:PFM   379->499 PF12392 * DUF3656 5e-16 38.7 %
:HMM:PFM   80->301 PF01136 * Peptidase_U32 7.2e-81 47.1 221/233  
:HMM:PFM   595->765 PF01136 * Peptidase_U32 3e-15 21.8 170/233  
:HMM:PFM   379->498 PF12392 * DUF3656 7.9e-27 29.4 119/122  
:HMM:PFM   344->381 PF01123 * Stap_Strp_toxin 0.00095 26.3 38/88  
:BLT:SWISS 6->501 YDCP_ECOLI 1e-61 37.2 %
:BLT:SWISS 525->581 HIS4_CAMJJ 6e-04 32.7 %
:PROS 164->182|PS01276|PEPTIDASE_U32
:REPEAT 2|7->259|509->764
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAB81588.1 GT:GENE CPE1882 GT:PRODUCT probable collagenase GT:DATABASE GIB00075CH01 GT:ORG cper0 GB:ACCESSION GIB00075CH01 GB:LOCATION complement(2160151..2162511) GB:FROM 2160151 GB:TO 2162511 GB:DIRECTION - GB:GENE CPE1882 GB:PRODUCT probable collagenase GB:NOTE 786 aa, similar to pir:D69102 collagenase from Methanobacterium thermoautotrophicum (strain Delta H) (807 aa); 37.5% identity in 512 aa overlap proteinase GB:PROTEIN_ID BAB81588.1 LENGTH 786 SQ:AASEQ MNFMERIELLAPAGSMESLIAAINRGADAIYLGGSKFSARAYASNFDNETMEKAVDYAHTYGVKVYVTVNTLIKENEFQEAVDYIGVLYKIGVDALIIQDVGLAKRIREVYPDFELHASTQMSIHNGEGALFFRENGFFRIVLSRELTLDEIKYISKDLGIETEIFVHGALCVCYSGQCLMSSLIGGRSGNRGRCAQSCRLPYTLIREKDKKETKGFLLSPKDICTIENVEDLIKTGTSSLKVEGRMKRPEYVAGVIESYREAIDNSYRNIKKSQEGNKFKLKKLFNREGFSTAYMYKNVGKDMMAFKTPRNTGVLLGEVLKNGEVLLLDDLSLKDGIRTNDDGFTVSKILMGNREVTEAKKGDKVKIFPKKYKANDKLYKTSDTKLLNELKTSYENPYERKINLKAYMKFKVNEPMELTVEYNGNYFTKTGDMVQVAVNRPMDKEKVEKNLKKSGDIPYEISEIEYVTFEDGFAAVSSINNLRREVLEEIRNSEIKKYKRVIEKQNNIELNEKKGEMPEVLVVVNTKEQLRASIDCGIKNIALDIFGKNQGQLNKNAIKEFKVEGINLYIKAPTIIKEEFETISNIIEENLNLIKGLVTANTGIINRFKDKTNIIGDYKLNIFNSYGMKFYNEHMMGSCLSLELNKKELNKMLKKYSKGAQIFVYGRPEVMVSEYCPIGSTFGGKCTSKNCDNQCVSSTFTLRDRMNQDFVIRTDIFCRSHIYNTVPVNLIQEIDEIKSLGVNSLRLDFVDENYEEVRQVIEALNKEEALRLKDYTKGHFKRGVE GT:EXON 1|1-786:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 6->501|YDCP_ECOLI|1e-61|37.2|481/653| BL:SWS:REP 525->581|HIS4_CAMJJ|6e-04|32.7|55/243| PROS 164->182|PS01276|PEPTIDASE_U32|PDOC00982| NREPEAT 1 REPEAT 2|7->259|509->764| SEG 586->595|niieenlnli| SEG 641->659|lslelnkkelnkmlkkysk| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 12->168|2cliA|9e-09|11.5|157/258| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 84->297|PF01136|2e-53|50.0|212/231|Peptidase_U32| RP:PFM:REP 379->499|PF12392|5e-16|38.7|119/121|DUF3656| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 80->301|PF01136|7.2e-81|47.1|221/233|Peptidase_U32| HM:PFM:REP 595->765|PF01136|3e-15|21.8|170/233|Peptidase_U32| HM:PFM:REP 379->498|PF12392|7.9e-27|29.4|119/122|DUF3656| HM:PFM:REP 344->381|PF01123|0.00095|26.3|38/88|Stap_Strp_toxin| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0006508|"GO:proteolysis"|PF01136|IPR001539| GO:PFM GO:0008233|"GO:peptidase activity"|PF01136|IPR001539| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 13->188|1x7fA2|2e-10|13.4|164/230|c.1.8.12| RP:SCP:REP 730->781|1amyA2|7e-04|19.2|52/346|c.1.8.1| OP:NHOMO 1064 OP:NHOMOORG 590 OP:PATTERN --------1---111-----------------332111111111111113333--------------- --1--------------------------------------------------------------------11111111222-1111122221222--1-121---1------------------11111111111111-----1----1---111111111-1--11111------------111------32222222222222222-222222222222--222222211222222222222222222222----------------------222222222222233333333332222221222222222222122222223222222222222222222222222-222133222321212222-221-11--1-------1----11111111111111111---------1----11---1---11----1--11111-----------1----111----------------------------------1----1------11111---1111111---1121112212-23321-3-11-2212133111111111-43322324222112222-222222222----11-311111111111111111111111111132312132-123333334433333345354--1-111------33223313333333332-3333333323333333333333221123333333333333333222322231-222222222222---2---------1-2-11111111111-1111111111---12-22222222222223111111111111123332222233322--------------112211------------2-1-----------2------1--------1--------12 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------1-------------117111-1--------1----1 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 259 STR:RPRED 33.0 SQ:SECSTR ###########HHHHHHHHHHHHHHTcccEEEEccccccTTcHTTccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcHHHHHTTcHHHHHHHHHHHTccEEEETTccGGGcHHHHHHHHHccEEcTTccHHHHHHHHHHccccEEEEccccccccHHHHHHHcccEEEEccccHTcTTccHHHHHHTTccEEEEGGGGTcHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHTHHHHHHTTccHHHHHHHHHHHTTcccccccTTccc#ccHHHHHHHHHHHHHc################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-3, 354-362, 392-401, 435-444, 495-520| PSIPRED ccccccEEEEEccccHHHHHHHHHccccEEEEcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcEEccccHHHHHHHHHccccEEEEcccccHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccHHHHccHHHHHHHHHcccccccccccccccccEEEEcccccccccEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHEEEcccccccEEEEEEEEEEcEEEEEEEEEEcccEEEcccccEEEEEEEccEEEEEEccccEEEEEccccccccEEEEcccHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEEEEcccEEEEEEccccEEEEEHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEEEccccEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHcccccccccccccEEEEEEccHHHHHHHHHccccEEEEcHHccccHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcHHHHHHHcccccEEEEccccHHHHHHHHHHHccccEEEEcccccHHHHHHHHHHccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccEEEEccccEEEEEEEccccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccc //