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Clostridium perfringens str. 13 (cper0)
Gene : lipB
DDBJ      :lipB         probable lipase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  20/68 : Bacteria  366/915 : Eukaryota  127/199 : Viruses  1/175   --->[See Alignment]
c.23.10c.69.1
:573 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   314->561 1jjiA PDBj 1e-34 38.5 %
:RPS:PDB   313->567 2c7bA PDBj 7e-25 23.5 %
:RPS:SCOP  75->182 1bwpA  c.23.10.3 * 4e-05 13.1 %
:RPS:SCOP  314->570 1evqA  c.69.1.2 * 3e-49 28.9 %
:HMM:SCOP  312->569 2bceA_ c.69.1.1 * 2.2e-48 30.7 %
:RPS:PFM   331->545 PF07859 * Abhydrolase_3 5e-25 37.8 %
:HMM:PFM   331->545 PF07859 * Abhydrolase_3 5.8e-51 34.5 203/211  
:HMM:PFM   81->150 PF00657 * Lipase_GDSL 0.00042 16.2 68/235  
:BLT:SWISS 34->254 KAD_PELUB 3e-04 29.9 %
:BLT:SWISS 303->564 YR526_MIMIV 3e-25 30.5 %

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAB80448.1 GT:GENE lipB GT:PRODUCT probable lipase GT:DATABASE GIB00075CH01 GT:ORG cper0 GB:ACCESSION GIB00075CH01 GB:LOCATION 918827..920548 GB:FROM 918827 GB:TO 920548 GB:DIRECTION + GB:GENE lipB GB:PRODUCT probable lipase GB:NOTE 573 aa, C-terminal region is similar to pir:C69464 carboxylesterase (estA) homolog from Archaeoglobus fulgidus (311 aa); 35.9% identity in 248 aa overlap CPE0742 GB:PROTEIN_ID BAB80448.1 LENGTH 573 SQ:AASEQ MDKNLKDFNGIKGTEDNLTGIAKANFNTEHGIRNLVLWGKEVDENSYLSLGILKRFHKYYGTDNSEIKFEKVLSDRFDEEVFSKNNANLILLVNSINDLIRLCSDKSKENEENLNLIIKRFVRLIEIAHKNRARIIFTTIPPFSGENKNLEYVRNEINSWIRKSTFLDGYLDLDKIVEKRLGVSKDKKEINYDKELEEYMAENISLDYIVERLKPFELDHMSQSDLIKAMNENSRFINEDGVDILVKPIPDLVKGTRIDRRIKYFDEYKRPKRSGNPYVFNGEAVGDMRDNMGLLNLNLCKSNILMSKENINGVNCRVYKKEGLKENLPCIVYIHGGAFIGGSLDVSENPCKLIAEGINGVVISVDYSLAPEKPYPLGLNDCRKVVEYIEENNFLYGIDKSKIGIVGESAGANLATIVANENSNIKFQGLVYPVVTFVEKNPFFNWDIDLYKNPYKEEKIYNFINSLRNCEDLVQKLYIQRTLDPRREDLSPIFNKNLSKAKKTLIAVSEYDYLRVQGEAYGKLIHKAGVETKIIRYEGVNHAFLDNLGIYPQAEDTINEIVKEFLDAIGNKF GT:EXON 1|1-573:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 34->254|KAD_PELUB|3e-04|29.9|194/213| BL:SWS:REP 303->564|YR526_MIMIV|3e-25|30.5|246/346| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 314->561|1jjiA|1e-34|38.5|231/311| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 313->567|2c7bA|7e-25|23.5|243/290| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 331->545|PF07859|5e-25|37.8|196/205|Abhydrolase_3| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 331->545|PF07859|5.8e-51|34.5|203/211|Abhydrolase_3| HM:PFM:REP 81->150|PF00657|0.00042|16.2|68/235|Lipase_GDSL| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0008152|"GO:metabolic process"|PF07859|IPR013094| GO:PFM GO:0016787|"GO:hydrolase activity"|PF07859|IPR013094| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 75->182|1bwpA|4e-05|13.1|99/212|c.23.10.3| RP:SCP:REP 314->570|1evqA|3e-49|28.9|246/308|c.69.1.2| HM:SCP:REP 312->569|2bceA_|2.2e-48|30.7|257/579|c.69.1.1|1/1|alpha/beta-Hydrolases| OP:NHOMO 1186 OP:NHOMOORG 514 OP:PATTERN ------1222222231-1--1--11----111------------------1----------1-1---- 21--31--2221--57744-45--54444443444424B5-3-3211-----11---1--22311111-11----1----2-------------------1---1414-2---------------1------------------212-12----------1--1---1----------------12-----1----1-1-113221-1-12112---1---1-1212222233-11111111111111-11-11-2--------11-------1-1----------------------------------------------------11111-2-1-1-11-222111--1-----------------------21112-------122---1-111------------11-112-1116-2---1112221111221--------11545555551--1111-------------------------------1141--211-3554433222133342222138362522--34214111311221----1-11----------111-1---------------------------1-----1------------------------------1----11111-232221111112---------------1-111----1-1112-----1-111-1-1-------111-1-1-11111111111111113---------111111111111---------1111-2------1-2---------3343312-11-1--1-213222212-12-222222222----111-111-----111111---1111----11----------------------------------------------------- ----56--------2753236655468231232332253333423347-27A9F223-33-11-1--1----211------------1-2A35-2-111---4518---4N45446-211--816B2238E5-43611217-241-22--2-16-6683--12691-----541-1--------2124C324---2121 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---- STR:NPRED 333 STR:RPRED 58.1 SQ:SECSTR ################################################################################################################################################################################################################################################ccccccHHHHHHHHHHHGGGccccTTcccEEEcTTccEEEEEETTccccTTTTcccccccccEEETTcccccEEEEEEEEccccccEEEEEEEEcccTTTcccTGGGHHHHHHHHHHHTcEEEEEccccTTTccTTHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHTEEEEEEEEEEETHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccEEEEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHcTTccccHHHHHHHHHHccccTTGGGcTTTcGGGcccTTcccEEEEEETTcTTHHHHHHHHHHHHHTTccEEEEEETTcTTGGGGGTTTcHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHH DISOP:02AL 1-4| PSIPRED ccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEcHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHccHHHHHccHHHHHHHHHHcccEEEccccEEEEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccEEEEEEcccEEEEEEEccccccccEEEEEEEcccEEEccHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHcccccHHHccccHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHcccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccc //