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Desulfotomaculum reducens MI-1 (dred0)
Gene : ABO48874.1
DDBJ      :             drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  43/68 : Bacteria  707/915 : Eukaryota  105/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:539 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   52->180 2d33D PDBj 5e-10 5.4 %
:RPS:SCOP  18->180 1pw4A  f.38.1.1 * 9e-17 11.7 %
:HMM:SCOP  1->183 1pw4A_ f.38.1.1 * 8.9e-48 34.6 %
:HMM:SCOP  197->520 1pw4A_ f.38.1.1 * 6.7e-36 28.3 %
:RPS:PFM   19->175 PF07690 * MFS_1 3e-24 37.6 %
:HMM:PFM   14->407 PF07690 * MFS_1 1.9e-58 29.4 343/353  
:BLT:SWISS 5->509 YUSP_BACSU e-100 38.5 %
:PROS 63->79|PS00216|SUGAR_TRANSPORT_1
:TM
:REPEAT 2|53->131|308->389
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABO48874.1 GT:GENE ABO48874.1 GT:PRODUCT drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily GT:DATABASE GIB00494CH01 GT:ORG dred0 GB:ACCESSION GIB00494CH01 GB:LOCATION 340153..341772 GB:FROM 340153 GB:TO 341772 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily GB:NOTE TIGRFAM: drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily PFAM: major facilitator superfamily MFS_1 KEGG: chy:CHY_0814 drug resistance transporter, EmrB/QacA family GB:PROTEIN_ID ABO48874.1 GB:DB_XREF GI:134050903 InterPro:IPR001411 InterPro:IPR001958 InterPro:IPR004638 InterPro:IPR005829 InterPro:IPR007114 InterPro:IPR011701 LENGTH 539 SQ:AASEQ MNTDSRRNILLIGLILGMFFSALDQTIVGTAMPRIIGELGGLEILTWVTTAYMLSSTTIVPIAGKLADLFGRRILYVTGIFIFMLGSALCGTSQNMTELIIFRGLQGLGGGIMMPMAMTIVGDIFPPEKRGKWQGLMGALFGFSSIIGPTIGGWFVDYASWRWVFYVNLPVGILAAVTIYIGLQGEKRLKDKVVIDYWGVATLVIGIVSLLLGLSLGGKDYPWSSWQIIGLLSTAFVFLFTFIFIEKRAVEPILSLDLFSNKVFLVTNIIGFLMGLGMFGTMMFLPLFLQGVVGVSATSSGNTMIPMMLAMMITSMLAGQLISRVSFRTLFATGMAIMTVGFYLLSTMTVHTTQWEAIANIIVLGIGMGLVMPILTIAVQQAFPAEQRGVATSATTFFRSIGGTLGMTVLGLVMNHQSVELLKKDFFPVVQKIPGLQSGPFSGMLTKAESDPQGLFNALLSPETLSKIPVQLQEIILPPLKIALSDSLHLVFLVAMGITMLGIIVSLFMGNERVVGTKEKVLDITGGLKNASESALHET GT:EXON 1|1-539:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 5->509|YUSP_BACSU|e-100|38.5|504/541| PROS 63->79|PS00216|SUGAR_TRANSPORT_1|PDOC00190| TM:NTM 14 TM:REGION 8->30| TM:REGION 40->62| TM:REGION 74->96| TM:REGION 102->124| TM:REGION 135->157| TM:REGION 164->186| TM:REGION 194->216| TM:REGION 226->246| TM:REGION 252->274| TM:REGION 277->299| TM:REGION 303->325| TM:REGION 328->350| TM:REGION 359->381| TM:REGION 492->513| NREPEAT 1 REPEAT 2|53->131|308->389| SEG 9->17|illiglilg| SEG 203->218|lvigivslllglslgg| SEG 271->289|gflmglgmfgtmmflplfl| SEG 402->414|ggtlgmtvlglvm| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 52->180|2d33D|5e-10|5.4|129/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 19->175|PF07690|3e-24|37.6|157/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 14->407|PF07690|1.9e-58|29.4|343/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 18->180|1pw4A|9e-17|11.7|163/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 1->183|1pw4A_|8.9e-48|34.6|182/447|f.38.1.1|1/2|MFS general substrate transporter| HM:SCP:REP 197->520|1pw4A_|6.7e-36|28.3|254/447|f.38.1.1|2/2|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 6462 OP:NHOMOORG 855 OP:PATTERN --1-1-965555558615211--2--------2121--1111-9A5251-341--1-11-17661--- 4355o437AA9566B9ABB-B822JCAAAAAACBBCIRUN6MAR8B854A72CB9526--IF73C8DRSQ34222444-3724131112221-2-----1-51--C-323--------------111111-1111-8775621153---------11-1---11--1--3-------------5651--1293C99A9AADE8BEAABC73CA8CBAB4367662856666DP476666766766666954684783FG35525ED77FD63897978533311-1245-----------11111111111111-----1--11--9E111212121135DD1332-----4--2-AA4331-23421111--11-A6662223335C9A423875543466456556C-444449493H1-J555CF5GHF6973131-2-21222--7777777756635217-----111----1111111111111-----147346957BNRTTTRIFDEDMMaRGGFG8HYMaAGCF--DDE127448474D6491-131642222222---1141362433213222433-1221321443392121-11-1111---1--------111-66556133-132212232122433-1111-111-1----------A7973A46556667766-5666667676576776774CJDAC7876536555555546464H76476652-844444444444----6546422221-454111121-22-1-11288798361124187778DCB26774256623422432314443333332332254534333221-----1-11----------------------------------------12-1-11111131 ----111------17UVmMmiqm***rOPIRNPokXNRNPIPTGFFnWQojm*oLQZYSKMN87B26A6644D5K37558589969BA-NREV9IGICDIA3AHAD--3--1----------------------------------------------1---------------1------------31c----2-11- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 129 STR:RPRED 23.9 SQ:SECSTR ###################################################EEEcTTcccGGGcTTcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHTTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEccccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEccTTcTTcccHHHHHHHHHHHHHH####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-3,187-191,512-540| PSIPRED cccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccHHHHHHcc //