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Desulfotomaculum reducens MI-1 (dred0)
Gene : ABO49533.1
DDBJ      :             YD repeat protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  2/68 : Bacteria  91/915 : Eukaryota  8/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.69.8
:2558 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   141->269 2wbfX PDBj 8e-05 27.5 %
:BLT:PDB   521->666 2bwrA PDBj 2e-05 25.5 %
:RPS:PDB   420->687 2bwmA PDBj 2e-22 16.9 %
:RPS:PDB   1772->2036 3ckaA PDBj 8e-13 12.0 %
:RPS:SCOP  417->655 1jv2A4  b.69.8.1 * 2e-08 15.5 %
:HMM:SCOP  419->706 1jv2A4 b.69.8.1 * 7e-17 25.8 %
:RPS:PFM   44->246 PF03534 * SpvB 2e-33 37.9 %
:RPS:PFM   664->840 PF12256 * TcdB_toxin_midN 5e-27 44.2 %
:RPS:PFM   888->987 PF12255 * TcdB_toxin_midC 8e-21 45.5 %
:HMM:PFM   42->321 PF03534 * SpvB 5.6e-85 41.0 273/293  
:HMM:PFM   517->539 PF12256 * TcdB_toxin_midN 0.00079 43.5 23/174  
:HMM:PFM   654->838 PF12256 * TcdB_toxin_midN 5.5e-46 46.0 163/174  
:HMM:PFM   886->1020 PF12255 * TcdB_toxin_midC 1.9e-43 44.8 134/148  
:BLT:SWISS 24->341 VRP2_SALTY 1e-43 39.2 %
:BLT:SWISS 1700->2245 WAPA_BACSU 5e-13 25.6 %
:PROS 2242->2254|PS00213|LIPOCALIN
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABO49533.1 GT:GENE ABO49533.1 GT:PRODUCT YD repeat protein GT:DATABASE GIB00494CH01 GT:ORG dred0 GB:ACCESSION GIB00494CH01 GB:LOCATION 1052225..1059901 GB:FROM 1052225 GB:TO 1059901 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT YD repeat protein GB:NOTE TIGRFAM: YD repeat protein PFAM: Salmonella virulence plasmid 65kDa B protein; YD repeat-containing protein KEGG: reh:H16_B1352 insecticidal toxin complex protein GB:PROTEIN_ID ABO49533.1 GB:DB_XREF GI:134051562 InterPro:IPR002345 InterPro:IPR003284 InterPro:IPR006530 LENGTH 2558 SQ:AASEQ 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-------------------------------------------------4121111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 717 STR:RPRED 28.0 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 1-3,2554-2554,2556-2559| PSIPRED ccccccEEEccccccEEEEEcccccccccccccccccccccccccEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEccccccccEEEEEccccEEEEccccccccccccccEEEccccEEEEEEEccccccEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEcccEEEEEcccccccEEEEEcccccEEEcccccccccccccccccEEEEEEEEEEcccccEEEEEEEccccccccccccccccEEEcccEEEEEEcccccccccHHHEEEEEEEEcccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHcccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEccccccEEEEEccccEEEEccccccccEEcccccccccccccccccEEEEEEEccccEEEEEEccccEEEEEcccccccccccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEcccccccccccEEEccccccccccccccccEEEEEEccccccEEEEEccccEEEEEEcccccccccEEccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEEcccEEEEEEcccccccccEEccccccccccEEEEEEEEcccccEEEEEEccccccEEEEEEcccccccEEEEccccccEEEEEEEEEccccEEEccccccccccccccccEEEEEEEEEEcccccEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEEEEEccccccEEEEcccccccccccccHHHccccccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccEEHHEEEccccccccccccEEEccccccEEEEEccccccccEEEccHHHcEEEEEEEcccccEEEEEEEEEEccccccEEEEEEEEcccccccccccccccHHHEEEEcccHHHHHHcccccccccccHHHHcccccccccccccEEEEEEcccccccccccccccccccccccHHHHHccEEEEEEEccHHHccccccccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHcccccHHHHHHHcccccccccccEEEEEEcccccccEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEEEEcccEEEEccEEEEcccccEEEEEEcccccccEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEEcccccccccccHHHccccccccccHHHHHHccccEEccEEEEEEcccHHHHHcccccEEEEEEEEccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEEEccccEEEEcccccEEEEccccccEEcccccccccccEEEcccccEEEEEccccccccEEEEcccccccccccEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEEccEEEEcccccEEEEEEEEcccEEEEEEEcccEEEEEcccccccccccccccEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEcccEEcccccccEEEEEccccEEEEcccccccccEEccccccccccEEEEEEccccccccEEEEEcccccEEEEEEEcccccEEEEEccccccccccccccccEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEccccEEEEEEEcccccccccccccccEEEEEEccccEEEEEEcccccEEEEEEEccccccEEEEEcccccccEEcccEEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEcccccEEEEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEEccccEEEEEEccccccEEEEEccccEEEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEccccEEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEccccccEEEEEEccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEEccccccEEEEEEEcccccccEEEEcccccccEEEEEEcccccEEEEcccEEEEEEEcccccEEEEEEEccccccEEEEEEcccccEEEEEEEcccccEEEEEEEEEccccEEEEEEcccccEEEEEccccEEEEEccccccEEEEEEEccccccccccccccEEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEEcccccEEEccccccccccccccccccEEccHHHHHHHcccccccHHHcccccccccccccccccEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEccccccccccccEEEEEccccHHHHHHHHHccccccccHHHHccHHHHHHHHcccccccEEEEEEEcccccccccccccccccccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHEEccccEEcccccccccEEcccHHHHHHHccccccccccEEEEEEccccHHHHHHcccccEEEEcccccccEEEEEEEEcccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccEEEEEEccccccccccccEEHHHHHcccEEEccccEEEEccccccccccc 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