[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Eggerthella lenta DSM 2243 (elen0)
Gene : ACV54098.1
DDBJ      :             cell wall/surface repeat protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  21/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:2099 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   1766->1881 2a9dA PDBj 5e-04 15.8 %
:HMM:PFM   505->537 PF09479 * Flg_new 0.00013 29.0 31/41  
:HMM:PFM   715->749 PF09479 * Flg_new 3.7e-05 31.4 35/41  
:HMM:PFM   786->826 PF09479 * Flg_new 4.8e-12 37.8 37/41  
:BLT:SWISS 689->825 INLA_LISMF 4e-07 32.5 %
:BLT:SWISS 1034->1424 PSGP_ONCMY 5e-13 28.2 %
:TM
:REPEAT 4|794->1045|1060->1329|1330->1419|1420->1673
:REPEAT 2|1701->1776|1862->1936
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACV54098.1 GT:GENE ACV54098.1 GT:PRODUCT cell wall/surface repeat protein GT:DATABASE GIB01015CH01 GT:ORG elen0 GB:ACCESSION GIB01015CH01 GB:LOCATION 133235..139534 GB:FROM 133235 GB:TO 139534 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT cell wall/surface repeat protein GB:NOTE TIGRFAM: cell wall/surface repeat protein; KEGG: mmw:Mmwyl1_0481 filamentous haemagglutinin outer membrane protein GB:PROTEIN_ID ACV54098.1 GB:DB_XREF GI:257473778 InterPro:IPR013378 LENGTH 2099 SQ:AASEQ MLEKMLDLKNTFEGKFLAVLMSVVLVMSMTNILAFAGNEGQKDGSKTESAPTDQVVGESDKEAVDEAVQHGESAAAKDADASKTTPSQPLVSTTVDEAVVTFETQNAFVSVKDQLLSGTMLTTELHKELRFTASADTGFELGAITAKNAANADVPVTTQDGVSSIAAEYVDSTLVVSVVAAAVVSDEPEVETTPITSDTKIEPGEADEKGEPEEPKSEEPETDEPEAPVADEDVVEVEADVSNPAFEGYAQAGNVLVKVTAAEGVLPEGATVQATRIERQDVVDAVAERVESQGKVLEDAIAIDVTLLDKDGNEIQPNGALNVCFFDANVEGEEVGVYRVSDDASQVETIGARQADPAVQSFDVDHFTIYVATGSNYASTGIKLDSSSIEVGETIKALGERKWNSKGYSWTSSDASVAKVAFSKENRADIVGVSPGVATITYSYKVGNRTYTDTAKVHVVPSVVKHTVSWYVNGDVSKSTKVRDGEVPSYGGTPNRAGDWQYKQFVGWATAPNSKNYLTEGELPAVTEDVSYYAVFTSQAYFYFVLEGRSNTSTVAKDYMYAGEGTMIVPDGFNSGDRWYDGSNFSIADYIVSTPSDEAIRNGIRAAYADYSPDWTYTIDWTTLSVAGSSVDYRYNTFDYGKSMHTDGALSINKDTTIGVTYLTQKPDGSVVTNSTSHDKNVAFGLNSTVNTDAPSFETDGYTYNSRVNHNGASYVFDGWYLDQSYTTKAPDSVSPSSSASFYARYIANTKTLTYQANGGAFSDGTIQDKTAVQQVGARVSFISNPSRDGYVFTGWKDKDTGDVYSAGVSGMIMPDRDVTLVAQWQGVIPIKLLGDETKKTYSGTKQSYTGFTVSGLDMGSYTVSGVQALAQGTDVGTYKGTIDYSGMRIFEKSSGSDVTNQFEVVEASEPTLIVEKAPISIVTPDDSKLYDGAPLIATKGAELSGLVNDETATLIVIGSRTDVGTSDNAYQIDWSGSAKESNYFIDEETIGTLEIAKRPVTVTAKGGEKQYDGKPLTAADTGYDIGGEGLVEGHEADVALSGSQTAPGASPATVESVAVKDGDVDVANNYDVATADGSLKVTNRDAKYEVTLKANSSTGNVYDGTEKSAKGVVTDRFVIDDVEYAVSGYETQDPAEVAAGVYTNNVSGDFKVKDPAGNDVTSEFAVHTEDGELEIAKRPVTVTAKGGEKQYDGKPLTAADTGYDIGGEGLVEGHEADVALSGSQTAPGASPATVESVAVKDGDVDVANNYDVATADGSLKVTNRDAKYEVTLKANSSTGNVYDGTEKSAKGVVTDRFVIDDVEYAVSGYETQDPAEVAAGVYTNNVSGDFKVKDPAGNDVTSEFAVHTEDGELEIAKRPVTVTAKGGEKQYDGKPLTAADTGYDIGGEGLVEGHEADVALSGSQTAPGASPATVESVAVKDGDVDVANNYDVATADGSLKVTNRDAKYEVTLKANSSTGNVYDGTEKSAKGVVTDRFVIDDVEYAVSGYETQDPAEVAAGVYTNNVSGDFKVKDPAGNDVTSEFAVHTEDGELEILPREVTLASGSATKIYDGTALELPDVTVGGDGFVGTEASVRATGSITDIGGPIDNTIVVEPGEGFIAANYNVVYTVGKLTVTSASIDPDDPSYTGIQINNPYDVQYNGQEQRWIPSVFDRNNHKLVTGTDYTVSYSQDVRNVGVVTVTITGIGNYMGTVERAYNITPAPAVIRVNDSSKAYGEADPGFTGAVEGLFGDDLLGDIAYSRTNIDEEVGNYSDVLTATVGNLNGNYTYTVEPGNFSIVPAGGNVVTIDATGLTKTYDGQPVSVVAEASVDGSALLYSVDGSTWSDANPEFTNAGTYTVYVKATHDGYEESAPVSATVVINPAPVTIAVADASKVAGADDPAFSGTVEGLVAEGDLGDINYVRPGGEEAAGVYVGALTALYTQNGNYRVAVLNGTFTITAAPVTPPTPPTPPTSPTPTPLPTPGTVPPDSPIAPVVTPIVDALQGAAEAVIGDNETPLAEPRETEIGDNDTPLASHDHASCWVHWYIILGIIVTALYGACVALRRGLFSRKLKKYEDGLTGGGDPAPGAPSIGDDASAPIAPKGAPAGATLAAGLGE GT:EXON 1|1-2099:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 689->825|INLA_LISMF|4e-07|32.5|126/800| BL:SWS:REP 1034->1424|PSGP_ONCMY|5e-13|28.2|373/542| TM:NTM 2 TM:REGION 15->37| TM:REGION 2024->2045| NREPEAT 2 REPEAT 4|794->1045|1060->1329|1330->1419|1420->1673| REPEAT 2|1701->1776|1862->1936| SEG 19->29|vlmsvvlvmsm| SEG 73->85|saaakdadasktt| SEG 175->185|vvsvvaaavvs| SEG 207->241|dekgepeepkseepetdepeapvadedvveveadv| SEG 456->469|kvhvvpsvvkhtvs| SEG 730->741|apdsvspsssas| SEG 1561->1572|dvtvggdgfvgt| SEG 1678->1689|vgvvtvtitgig| SEG 1907->1918|ggeeaagvyvga| SEG 1937->1973|tftitaapvtpptpptpptsptptplptpgtvppdsp| SEG 2078->2098|asapiapkgapagatlaaglg| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 1766->1881|2a9dA|5e-04|15.8|114/369| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 505->537|PF09479|0.00013|29.0|31/41|Flg_new| HM:PFM:REP 715->749|PF09479|3.7e-05|31.4|35/41|Flg_new| HM:PFM:REP 786->826|PF09479|4.8e-12|37.8|37/41|Flg_new| OP:NHOMO 23 OP:NHOMOORG 21 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------13---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1----------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1----------------------------1-------------------------------1------------------------------------------1------------------------------------1----------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1-11-1-----------1-----------------------------------------1-------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 114 STR:RPRED 5.4 SQ:SECSTR #####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################EccTTcEEccEEEEEEEEEEccTTccEEEEEEEcccccccEEcEEccccccTTcccccEEEE#EEEEEcTTcEEEEEEEEE#ETTccccccccGGGccTTcccccccEEEEEEEcc########################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 17-17,20-20,25-25,31-31,39-39,53-53,59-60,62-62,67-68,73-74,76-76,81-81,95-96,101-102,104-104,109-110,115-116,118-118,123-124,129-130,132-132,137-138,241-241,244-244,249-249,263-263,269-269,272-272,277-277,297-297,300-300,305-305,311-312,314-314,319-319,333-333,339-339,342-342,375-375,381-382,384-384,389-390,395-396,398-398,403-403,473-473,479-479,482-482,487-488,493-494,496-496| PSIPRED cHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEcccccccccccccccccHHHcccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccEEEEEccEEEEEEEcccEEEEEEEEEccccEEEHHHHHHEEEEEcccccEEEEEEEEccccccccccEEcccHHHHHHHHcccEEEEEEHHHHHcccccccEEcccccccEEccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEcccccHHccHHccccEEEEEEEcccccccccEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEEEEEEEcccccEEcccccEEEEEEEccccccEEEEEEEccccHHHEEcccccccccccEEEccEEEEEEEEccccccccEEEccccEEHHHHHHHHHcccccccccEEEcccccEEEEEEccccccEEEEEcccEEEEEEEEEEccEEEcccEEEEEEHHHHEEEEEEEEEcccccEEEEEccccccccccccccccccEEEEEEEEEccccccEEcccccccccccEEEEEEEEccEEEEEEEcccccccccccEEEEccccccccccccccccccccccccEEEEEcccccHHHHHHHcEEEEEEEEcccccEEEEEEEEEEcccccccEEEEEEccEEEEEccccEEEEccEEEEEEEEEcccEEEEEEEEcccEEEEEEccccccccEEEEEEccEEEccccccccccEEEEEEEEcccccEEEEEEEEEcccEEEEEEEccccEEEEEEEccccccccccccccEEccccccccccccccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEccccEEEccEEEEcccEEEcccccEEEEccccccccEEEEEEEccccEEEEEEEEEEEccEEEEEEEEEEcccEEEEEccccccccEEEEEEEEcccEEEEcccEEEEEcccccEEEcccEEEEEccEEEEEEEEcccEEEEEEcccEEEEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEccccEEEEcccEEEEEEccccEEEcccEEEEEEcccEEEEEEEEEccccEEEEEccccccccccccEEEEEEEEccccccccEEEEEEcccEEEEccccEEEEEEEEcccEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEccEEEEEEccccEEEEEEEEcEEEEEEEEEEEEEEccccccccEEEEEEEccEEEEEcccEEEEEcccEEEEcccEEEEEEEcEEEEEEEEEEcccEEEEEEccEEcccccccEEEEEEEEcccccccccEEEEEEcccEEEEEccccEEEEEEEcccEEEEEcccEEEEEEEEEEEEEEcccEEEEEEccccccEEEEEEEEEEEEEccEEEEEccccccEEEEEEEEcccEEEEcccEEEEEccccEEEEcccEEEEEccccEEEEEEEEEccccEEEEcccEEccccEEEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEcccEEEEEEccEEEEEEEEccEEEEEEcccEEEEEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEccEEEEEccEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEcccEEEEEccEEEccEEEEEEEEEEccccEEEccEEEEEcccEEEEEcccEEccccEEEEEEEccccEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEEEEEEEEEEEEEEEcccEEEEEcccccEEEEEEccEEEEEcccEEEEEcccEEEEEcccccccEEEEcccccccEEEEEEEEccccccEEEEEEEEccEEEEEEccEEEEEEccEEEEcccccEEEEEEccccEEEEccccEEEEEEEEEEccEEEEEEcccEEEEcccEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEEccEEEEccccEEEEEccccEEEEEcccEEEEEEEEEEEccccccEEccccccEEEEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEcccEEEEEcccEEccccccccccccccccccccccccccccccEEcccccccccccEEEEccccccccccEEEccccccccccccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccc //