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Eggerthella lenta DSM 2243 (elen0)
Gene : ACV55129.1
DDBJ      :             BCCT transporter
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  8/68 : Bacteria  389/915 : Eukaryota  12/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:602 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   68->387 2w8aC PDBj 4e-18 27.5 %
:RPS:SCOP  125->337 1pv6A  f.38.1.2 * 7e-04 13.7 %
:RPS:PFM   79->540 PF02028 * BCCT 5e-65 34.2 %
:HMM:PFM   50->540 PF02028 * BCCT 2.2e-124 34.6 480/485  
:BLT:SWISS 68->546 OPUD_BACSU 2e-49 27.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ACV55129.1 GT:GENE ACV55129.1 GT:PRODUCT BCCT transporter GT:DATABASE GIB01015CH01 GT:ORG elen0 GB:ACCESSION GIB01015CH01 GB:LOCATION complement(1392116..1393924) GB:FROM 1392116 GB:TO 1393924 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT BCCT transporter GB:NOTE PFAM: BCCT transporter; KEGG: dsh:Dshi_2119 choline/carnitine/betaine transporter GB:PROTEIN_ID ACV55129.1 GB:DB_XREF GI:257474809 InterPro:IPR000060 LENGTH 602 SQ:AASEQ MRSKSSDDDARKHVHPMEVENESGEVDPEPKEAQAARLGRTVRHDHVIRAASVAIVAVVLGIALVSADTFINAVGVLRTFVTQYCSWWIVLCAFLCFAVCIFVAVTKLGSIRLGGKDAKPAFSYFSWFAMLFATGQGVGLVFWAVAEPIMMYGGTPFNAPDPLFAGDTALAWTYFHWAIPAWAIYAIVSLFMAYARYNMHKDTTFRGTVEDLFPARAKRPVGIVVEILVVIATIFGLTTSLGLASYQFNSGIQQIFNIQTGQALQVAFVILFGSIATMSVWFGVVRGIKKISNANAVMSIVFVAAVFIFGPTLYILGVLPESLSVFIDQFMLMSGFTEAVNLGAGIASYGDSWQAFWSFFIFCWCFAFATFTAGFVSTISRGRTLREFVGGVVFVPAAVCIVWTCVVGGTGVWAAMSDPGIVAQTNADSSMGLFLTIDSVPLIGGVLTVLATILIGGYIVTSVDSGVMALSNFVSPAARQSRGFKALLALCITALAVLFMVTAGQDFLSTIQFATIAGGIPFSVIVILMGVQFFKWVKHDEQLVERGLAEPFPEDSLAARQLRQWHEEREAREAEKAWLTRHEEVDVPDGAGLDESMKEVSR GT:EXON 1|1-602:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 68->546|OPUD_BACSU|2e-49|27.0|467/512| TM:NTM 13 TM:REGION 53->75| TM:REGION 89->111| TM:REGION 125->147| TM:REGION 175->196| TM:REGION 220->242| TM:REGION 265->287| TM:REGION 296->318| TM:REGION 356->378| TM:REGION 390->412| TM:REGION 430->452| TM:REGION 456->478| TM:REGION 482->504| TM:REGION 512->534| SEG 47->67|viraasvaivavvlgialvsa| SEG 355->375|afwsffifcwcfafatftagf| SEG 388->413|fvggvvfvpaavcivwtcvvggtgvw| SEG 567->575|eereareae| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 68->387|2w8aC|4e-18|27.5|298/495| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 79->540|PF02028|5e-65|34.2|448/485|BCCT| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 50->540|PF02028|2.2e-124|34.6|480/485|BCCT| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF02028|IPR000060| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF02028|IPR000060| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF02028|IPR000060| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 125->337|1pv6A|7e-04|13.7|205/417|f.38.1.2| OP:NHOMO 823 OP:NHOMOORG 409 OP:PATTERN ------------------------211-1111--------------1--------------------- -----334334435---11-11--1111111111111212----1163221-14233---111-155-121---------111--------------------2---1--------------------------1----------------------111111----------------1------------113333333423333334311113321-118111111111-13333333333333243345--1--------11----1--------1-1------------------------------------------1---1111111-1-----1-------1-11--45-2---3---------------1------------------------------11-11---1-2-------1----1--1113111111341----------------------------------------------1--1-1222-11111--111111--1111-11-------------11-1-----11-----121111111--------8-42111-1---------------------11--1-----1----------1-----11-33-322321111111611112-63134----361------21--1-13332332343-343342234432343244122211--3111111111111111121111122---21222212222---1----------2164111111-1111---16464633344--333333233644431111--1-1---25446111116462233-1111-------------------------11--------------------------------------- -------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------6-----A232-----1---111---1 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 298 STR:RPRED 49.5 SQ:SECSTR ###################################################################HHHHHHHHHTTHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcGGGGcccccTTccccccHHHHHH##HHHH#cHHH#HHHHHHHHHHHTccTTcccc#####cHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccccGGGGGTTTccTTccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccccHH#####HHHHHHHHHHHTTGGGTTccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHH#HHHTccTTTcccHH##HHHHTT#####HHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTTTccHHH####################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 596-597| PSIPRED cccccccHHHHHccccccccccccccccccHHHHHccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHcc //