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Eggerthella lenta DSM 2243 (elen0)
Gene : ACV55422.1
DDBJ      :             DEAD/DEAH box helicase domain protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  60/68 : Bacteria  145/915 : Eukaryota  198/199 : Viruses  1/175   --->[See Alignment]
c.1.8c.37.1c.51.6
:869 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   59->408 2zj8A PDBj 7e-29 32.1 %
:RPS:PDB   50->208 3b6eA PDBj 1e-12 21.4 %
:RPS:PDB   319->415 3dwlD PDBj 2e-06 4.6 %
:RPS:SCOP  74->209 1yksA1  c.37.1.14 * 1e-12 22.0 %
:RPS:SCOP  308->413 1sfsA  c.1.8.8 * 3e-12 15.1 %
:RPS:SCOP  577->640 2i9iA1  c.51.6.1 * 5e-04 7.0 %
:HMM:SCOP  71->414 2bmfA2 c.37.1.14 * 2.4e-39 28.7 %
:RPS:PFM   67->209 PF00270 * DEAD 2e-05 30.1 %
:RPS:PFM   406->862 PF12029 * DUF3516 e-119 52.4 %
:HMM:PFM   406->862 PF12029 * DUF3516 3.1e-191 53.3 454/462  
:HMM:PFM   66->211 PF00270 * DEAD 9.1e-12 24.8 145/167  
:HMM:PFM   319->395 PF00271 * Helicase_C 1.3e-08 26.5 68/78  
:BLT:SWISS 59->408 HELS_PYRFU 2e-28 32.1 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACV55422.1 GT:GENE ACV55422.1 GT:PRODUCT DEAD/DEAH box helicase domain protein GT:DATABASE GIB01015CH01 GT:ORG elen0 GB:ACCESSION GIB01015CH01 GB:LOCATION 1732756..1735365 GB:FROM 1732756 GB:TO 1735365 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT DEAD/DEAH box helicase domain protein GB:NOTE PFAM: DEAD/DEAH box helicase domain protein; helicase domain protein; SMART: DEAD-like helicase ; helicase domain protein; KEGG: mxa:MXAN_4573 DEAD/DEAH box helicase GB:PROTEIN_ID ACV55422.1 GB:DB_XREF GI:257475102 InterPro:IPR001650 InterPro:IPR011545 InterPro:IPR014001 InterPro:IPR014021 LENGTH 869 SQ:AASEQ 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226->238|dvdvvadaprpvp| SEG 425->433|kkirkvkkk| SEG 520->528|vegeggvve| SEG 545->561|lspfllaalelldpesd| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 59->408|2zj8A|7e-29|32.1|343/700| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 50->208|3b6eA|1e-12|21.4|159/182| RP:PDB:REP 319->415|3dwlD|2e-06|4.6|87/272| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 67->209|PF00270|2e-05|30.1|143/167|DEAD| RP:PFM:REP 406->862|PF12029|e-119|52.4|454/463|DUF3516| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 406->862|PF12029|3.1e-191|53.3|454/462|DUF3516| HM:PFM:REP 66->211|PF00270|9.1e-12|24.8|145/167|DEAD| HM:PFM:REP 319->395|PF00271|1.3e-08|26.5|68/78|Helicase_C| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0003676|"GO:nucleic acid binding"|PF00270|IPR011545| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF00270|IPR011545| GO:PFM GO:0008026|"GO:ATP-dependent helicase activity"|PF00270|IPR011545| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 74->209|1yksA1|1e-12|22.0|132/140|c.37.1.14| RP:SCP:REP 308->413|1sfsA|3e-12|15.1|106/213|c.1.8.8| RP:SCP:REP 577->640|2i9iA1|5e-04|7.0|57/221|c.51.6.1| HM:SCP:REP 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44555551B3414474654466545555545564555435435554465454445466566644545425435345515534445456-4766668545456445445C8B78575642356659C371H*92BBB535261665655448347534564AF576A5454F68644667*8A877956B5886654646 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--- STR:NPRED 376 STR:RPRED 43.3 SQ:SECSTR 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ccccccccccccccccccccHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEccccccccccEEEEcHHHHHHHHHccccHHHccEEEHHHHHHcccccccHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHcccccEEEccccccccEEEEEEccccHHHHHHHHHcccccEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHcccccEEEEcHHHHHcccccccEEEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccccEEEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHcccHHHHHccccccHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEccccccccEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEHHHHHHcc //