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Eggerthella lenta DSM 2243 (elen0)
Gene : ACV56626.1
DDBJ      :             glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  24/68 : Bacteria  560/915 : Eukaryota  103/199 : Viruses  2/175   --->[See Alignment]
c.1.18
:594 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   351->572 2pz0B PDBj 2e-33 38.5 %
:RPS:PDB   346->578 3ch0A PDBj 7e-41 21.9 %
:RPS:SCOP  351->581 1zccA1  c.1.18.3 * 4e-54 28.8 %
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:HMM:PFM   84->227 PF10110 * GPDPase_memb 6.1e-22 23.6 144/149  
:HMM:PFM   225->278 PF07663 * EIIBC-GUT_C 0.00019 37.3 51/93  
:BLT:SWISS 346->571 GLPQ_BACSU 2e-29 35.8 %
:PROS 531->544|PS00153|ATPASE_GAMMA
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACV56626.1 GT:GENE ACV56626.1 GT:PRODUCT glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GT:DATABASE GIB01015CH01 GT:ORG elen0 GB:ACCESSION GIB01015CH01 GB:LOCATION 3097214..3098998 GB:FROM 3097214 GB:TO 3098998 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GB:NOTE PFAM: glycerophosphoryl diester phosphodiesterase; KEGG: rde:RD1_0308 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein GB:PROTEIN_ID ACV56626.1 GB:DB_XREF GI:257476306 InterPro:IPR000131 InterPro:IPR004129 LENGTH 594 SQ:AASEQ MEFARSTWRLFAANARTAILFEFGFRFLFAILFVPACFGMVDLAMEAAGLAYLADTNMTTLFANPLAWVFLLVAALVLALGALFEMCALVVVMQAGKTGRRIGVFETSRLAFSSARRIARPSNWLLALFVLLLVPLTNLTVTSSALTGVRLPEFIMDFIWENGALTAVFVIVMAALYLHAFFLAFGIHFFTLCDESWMQARISSRSLLRGNAWRLARRLLALFAVFASGAVAAIVVGVLILAAILEGGLPFGVSFALTLVMFAFTIVVDCVFAPLSYAALSATFYEFSQERGIDIPYRIDEPSRTCRTRLARAAVGSFLAMLGLVSLLSYDPLHGVFESESQREPAPDFAITAHRGGAREAPENTLAAFQNAIDQGADWVELDVQQTADGVLVVMHDANLKRTTGLDKEFWQVTYDEIKDLDNGSWFDPAFADQRICTLEEALALCKGKIKLNIEVKPDGHGVDLERKTVDLINAYDMRDQVAVASISYESLAKVKEIDPSMPTMYDMTLAYGSISSIEHVDYFSVDDFFVTQELVDEVQGAGKIIYAWTVNDPANMSRLIDYGIDGLVTDDIAQARELYEAALNEGHEYFAAI GT:EXON 1|1-594:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 346->571|GLPQ_BACSU|2e-29|35.8|226/293| PROS 531->544|PS00153|ATPASE_GAMMA|PDOC00138| TM:NTM 7 TM:REGION 23->45| TM:REGION 69->91| TM:REGION 123->145| TM:REGION 169->191| TM:REGION 219->241| TM:REGION 258->280| TM:REGION 309->331| SEG 66->83|lawvfllvaalvlalgal| SEG 125->142|llalfvlllvpltnltvt| SEG 174->185|aalylhafflaf| SEG 207->245|llrgnawrlarrllalfavfasgavaaivvgvlilaail| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 351->572|2pz0B|2e-33|38.5|218/243| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 346->578|3ch0A|7e-41|21.9|233/265| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 354->571|PF03009|2e-30|41.1|214/241|GDPD| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 354->574|PF03009|1.2e-44|29.9|221/255|GDPD| HM:PFM:REP 84->227|PF10110|6.1e-22|23.6|144/149|GPDPase_memb| HM:PFM:REP 225->278|PF07663|0.00019|37.3|51/93|EIIBC-GUT_C| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0006071|"GO:glycerol metabolic process"|PF03009|IPR004129| GO:PFM GO:0008889|"GO:glycerophosphodiester phosphodiesterase activity"|PF03009|IPR004129| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 351->581|1zccA1|4e-54|28.8|226/240|c.1.18.3| HM:SCP:REP 347->581|1t8qA_|8.4e-74|42.1|235/0|c.1.18.3|1/1|PLC-like phosphodiesterases| OP:NHOMO 1327 OP:NHOMOORG 689 OP:PATTERN --1-211--------13111111----1-1-1-------------11-1-----11-111-1------ --211------22-12211-111121111111211112------182-12--1233----24222-4655----------1-2--1-11141-1-------1-2112411---------------11----1---111111---111----------------1------1------------112--1112245555555545555545255335542224222222222363444434334444345344431223322222441133312422322-111---111111111111111111111111111111---111212-2-3333333132-2--222131-1-211------1-11--111-11-3-1122-11111--1-1----------------------------222-55533224321----111------1-3-------------121------------------------------1-1--111111--1-121111--111111111111111--111-1111112221111----11----------11122111111-21111-1-1----2-221221-1--------------------1-11---11-11-111111222211-1112-11-211---11-1------21221112222222222-222222222222222222222233--2222222222222222212212222--122222212322---1111111111-1121---------------2222211---1122222222211111333111111111-11111111121111--21111222------1-222222---1-1112-----------1--11111-1111---1111111111--- ---111--211--1-2111----------111-----111-11--------1-2------1---------1--1--1--1------11-1--1---42211211-1----67B659442-235243252AR5-5551-118335-132317419254731-1133-1---12421-11-------1122-31------- -------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--- STR:NPRED 242 STR:RPRED 40.7 SQ:SECSTR #########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cTTcEEEETTTTTTTccTTcHHHHHHHHHHTccEEEEEEEEcTTccEEEcccccccTTTcETTEEGGGcHHHHTTcccccccTTcTTccccccccccHHHHHHccEEEEEEcccGGHHHHHHHHHHHHHHTTcGGGEEEEEccHHHHHHHHHcTTcEEEEcccccHHHHHTTccccccEEEEcGGGccHHHHHHHHHTTEEcccccccHHHHHHHHHHTccEEEEccGGGGTcHHHHHHHHc####### DISOP:02AL 48-48,95-95,594-595| PSIPRED ccccHHHHHHEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHccccHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHcccccccccccEEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHccccEEEEEEEEEEccEEEEcccccccccccccccHHHccHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHcccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEccHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccHHHHHHHHcccEEEccHHHccHHHHHHHHHcccEEEEEEcccHHHHHHHHHccccEEEEccHHHHHHHHHHHHccccHHHHcc //