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Lactobacillus salivarius UCC118 (lsal0)
Gene : ABD98992.1
DDBJ      :             Multidrug resistance protein B
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  34/68 : Bacteria  663/915 : Eukaryota  92/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:456 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   74->193 2d33D PDBj 1e-06 5.8 %
:RPS:SCOP  33->192 1pw4A  f.38.1.1 * 8e-11 10.6 %
:RPS:SCOP  290->379 1pv6A  f.38.1.2 * 6e-04 18.7 %
:HMM:SCOP  1->456 1pw4A_ f.38.1.1 * 8.4e-62 21.5 %
:RPS:PFM   32->366 PF07690 * MFS_1 8e-18 26.1 %
:HMM:PFM   21->409 PF07690 * MFS_1 6.5e-48 24.7 344/353  
:BLT:SWISS 32->418 YCNB_BACSU 3e-72 37.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABD98992.1 GT:GENE ABD98992.1 GT:PRODUCT Multidrug resistance protein B GT:DATABASE GIB00337CH01 GT:ORG lsal0 GB:ACCESSION GIB00337CH01 GB:LOCATION 203419..204789 GB:FROM 203419 GB:TO 204789 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT Multidrug resistance protein B GB:NOTE COG0477 [GEPR] Permeases of the major facilitator superfamily GB:PROTEIN_ID ABD98992.1 GB:DB_XREF GI:90820353 LENGTH 456 SQ:AASEQ MARNIADTINPKTRLAVSIILLLSTFISLMSQTMMITALPVIQNQMNQSLTTVQWLTTGYTLLIGIVTPLSSNMYDKFSNRSVFLGTIGTFVIGTLIGCLATNFWLLLLARLVQACAGGILMSFQMTTMISIYPPEKRGTIIGMSGLVIAFGPAIGPTLAGFILNLLGWRYLFILILPIMVLIWIIGYFVFPNYSEPLDIKIDYLSVVLSLLGSSLALIGITIVQTQWMLGLAMLVVGAIILYFFVKRQLNLKQPMLNVRIIKLYSFRMMVLVGICAFMVLLGMEQMVSIYAQNVSHVSSMTAGMILLPGAIANALTASVVGRAYDQYGAKWLVISGGILMLISAIPFVIISKGTPIWIMTVFYMIRMVGNALVFSPAISESFRGVAPREISHATALNNTLRQVSGAVSVTMLIVISSIPHSFVLGMRISMWVTVVLVLLMLAVFISYIKNRNSRR GT:EXON 1|1-456:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 32->418|YCNB_BACSU|3e-72|37.7|387/472| TM:NTM 14 TM:REGION 17->39| TM:REGION 54->76| TM:REGION 80->102| TM:REGION 109->131| TM:REGION 141->163| TM:REGION 171->193| TM:REGION 201->223| TM:REGION 225->246| TM:REGION 265->287| TM:REGION 301->323| TM:REGION 330->352| TM:REGION 358->380| TM:REGION 403->425| TM:REGION 429->450| SEG 18->31|siilllstfislms| SEG 205->221|lsvvlsllgsslaligi| SEG 433->444|vtvvlvllmlav| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 74->193|2d33D|1e-06|5.8|120/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 32->366|PF07690|8e-18|26.1|295/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 21->409|PF07690|6.5e-48|24.7|344/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 33->192|1pw4A|8e-11|10.6|160/434|f.38.1.1| RP:SCP:REP 290->379|1pv6A|6e-04|18.7|90/417|f.38.1.2| HM:SCP:REP 1->456|1pw4A_|8.4e-62|21.5|405/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 3466 OP:NHOMOORG 789 OP:PATTERN ------6444444462-3-----2--------2121--11-1-373121-121----11-1323---- 3253M23477954566644-4411B544444565468A971C57646336517456-6--9653357HIF1433355412721131112211-2-----1-61--9-2-2--------------111111-111--4553321152--------------------1--3-------------2211--1252ABBCBCBBE5CECABD82CA7CCCB33455545566659J4544445445444446656757A2EG26313ED99EC638A6C76433311-1133-----------11111111111111-----1--11--8A111212121135AA1333-----3--2-563331-13321111--11-711211111237774223512222442443446-123115262C1-E554CB4EDD5543-11-1-1111---3333333322223112------------1111111111111------542334334HIJGJHEBABADDIHB9AB6BJCK789B--78A-1333325241361----322222222---12211411-2-12111211-11113-111115112------------1---------11-66333121--22221111-21323-12-1-11--1----------46652835555566655-55555565555655555538C8663556436554555436363955365541-844444444444----4523111111-443-11-21-22-1---144444141131-4343489B455631565121112212-1113333332222242433333221-------11--11------------------------------------1---------111 ----11-------1277B478BCIENAA976567785635467332C88CE8JA6699A456--111122--4-621111-1112223-791717321283-1789--1-------------------------------------------------2-------------------------1----5----1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 120 STR:RPRED 26.3 SQ:SECSTR #########################################################################TcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHTTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEccccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEccTTcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHccc####################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-2,453-457| PSIPRED ccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccc //