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Lactobacillus salivarius UCC118 (lsal0)
Gene : ABD99356.1
DDBJ      :             Hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  6/915 : Eukaryota  6/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:709 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   15->115 2ap3A PDBj 9e-04 26.0 %
:RPS:PDB   72->172 3cpeA PDBj 8e-05 10.0 %
:RPS:PFM   13->176 PF12128 * DUF3584 2e-04 21.0 %
:HMM:PFM   116->157 PF07428 * Tri3 0.00059 38.1 42/413  
:HMM:PFM   156->232 PF10721 * DUF2514 0.00052 15.6 77/162  
:BLT:SWISS 13->652 HMW2_MYCGE 1e-10 22.8 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABD99356.1 GT:GENE ABD99356.1 GT:PRODUCT Hypothetical protein GT:DATABASE GIB00337CH01 GT:ORG lsal0 GB:ACCESSION GIB00337CH01 GB:LOCATION 588945..591074 GB:FROM 588945 GB:TO 591074 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT Hypothetical protein GB:NOTE COG0419 [L] ATPase involved in DNA repair GB:PROTEIN_ID ABD99356.1 GB:DB_XREF GI:90820717 LENGTH 709 SQ:AASEQ MDNKGIVQNDIADAQDKVQKPQQNLNKDIVEFTELKNEKESELDNLLNLQISLQNEYAKLVNIKEKISNEGEESQKEELERNKKSLERVEKSLHETELQWNDNHRKLIQAKKDLNNVEEVSNIEKKQVNAKDSSEIIKRDVERADRKVKISYEDWMRKKKEIESTEKDIAQCKNDISSKKKQLEKEKDKLPTTDKLVKEVQKKIDKNLENIDTVQKQKDELQSILSKLAIAIEKEKNKIDLLPQIRIPQDYTQLLFENFNYGKISREEVADIISPGLELNNKKLNFSEIDDKNKISDVTKLTLQELIEISTFVASLLNPLREKMGSRLIEVTPDSIQFTQAVVDRYNQDNWQTFYSQKSNKLGLGHDIEGLSDLWNQTPSVFEDYDSKDEELANGEEYFNEFSDNEMTMADLKTVIYRVLVDFLFNDTKNNFGHLETLLGLNKSKDYSTHYMAVGIDNNLAIHFEFAYNNIKANGSYVISDFGKKNIEAKINELKAEQAGNLIKLSDLNSQLENENKNKIALEEELQNAQKGPDMTGIMKLEDDLNSLNKNISVLQDRLRGKNNLSELVREEWIKNKGLLRREENKFEASKAAITATEIELNSIKIDLSQKEKQVEKYNKSELENSEQLNILKVNYETIQENIQTILDDLKEYNGIDQKIEELKEKLINNEKDVAKITAVYNDLVVKVQSYQNVLEYKEKELSDLQEYE GT:EXON 1|1-709:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 13->652|HMW2_MYCGE|1e-10|22.8|558/1805| COIL:NAA 248 COIL:NSEG 7 COIL:REGION 72->148| COIL:REGION 163->185| COIL:REGION 194->242| COIL:REGION 486->532| COIL:REGION 580->621| COIL:REGION 624->624| COIL:REGION 626->634| SEG 179->190|kkkqlekekdkl| SEG 659->672|kieelkeklinnek| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 15->115|2ap3A|9e-04|26.0|100/192| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 72->172|3cpeA|8e-05|10.0|100/553| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 13->176|PF12128|2e-04|21.0|162/1179|DUF3584| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 116->157|PF07428|0.00059|38.1|42/413|Tri3| HM:PFM:REP 156->232|PF10721|0.00052|15.6|77/162|DUF2514| OP:NHOMO 12 OP:NHOMOORG 12 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1---1--------------------------1--------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------1--------1---------------------1---1-----------------------1------------------------------------------------1------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 157 STR:RPRED 22.1 SQ:SECSTR ##############HHHHHHHHHHHTTc#ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcTccTTccccccccccGGGccEEEETTEHEEEEcTTTccEEEccHHHHHTTccccccccccccTTcTTTccccccTTTcGGGcTTcccTTccccccHHHHHHH######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-3,14-30,70-79,82-82,125-127,130-130,157-191,267-287,490-499,510-538,608-630,705-710| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHccHHHHHHHccccccccccccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEcHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHccccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHcccccccccccEEccccccccHHHHHccccHHHcccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //