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Lactobacillus salivarius UCC118 (lsal0)
Gene : ABE00410.1
DDBJ      :             ATP-dependent nuclease subunit B
Swiss-Prot:ADDB_LACS1   RecName: Full=ATP-dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B;         EC=3.6.1.-;AltName: Full=ATP-dependent helicase/nuclease rexB;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  173/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.69.9c.37.1c.52.1
:1193 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   537->702 3ckdC PDBj 9e-04 26.1 %
:RPS:SCOP  318->768 1w36C2  c.37.1.19 * 3e-29 14.5 %
:RPS:SCOP  807->1035 1w36B3  c.52.1.24 * 4e-11 13.8 %
:RPS:SCOP  1037->1171 1k32A3  b.69.9.1 * 1e-04 16.0 %
:HMM:SCOP  318->736 1w36C2 c.37.1.19 * 1.2e-47 21.5 %
:BLT:SWISS 1->1193 ADDB_LACS1 0.0 100.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABE00410.1 GT:GENE ABE00410.1 GT:PRODUCT ATP-dependent nuclease subunit B GT:DATABASE GIB00337CH01 GT:ORG lsal0 GB:ACCESSION GIB00337CH01 GB:LOCATION complement(1691619..1695200) GB:FROM 1691619 GB:TO 1695200 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT ATP-dependent nuclease subunit B GB:NOTE COG3857 [L] ATP-dependent nuclease, subunit B GB:PROTEIN_ID ABE00410.1 GB:DB_XREF GI:90821771 LENGTH 1193 SQ:AASEQ MSLGFVLGDATKNHRQVLLEQITNWQAEDPQAKIYYIVPNHNKFSAEVKVLDYLKSQQDNQDLFATSNVQTFSFTRLAWYFMKDTATYQVNRITNAGLNMIVYRSLQEHSDELTIFKGEQTQPGFIAQLVSQLIELQQSCITYDDIERMKENLSQQDTADSAELEAKLHDIAIIYRDFMQMTDSKYLKPADILPSLTQYLQNEDLSNSYFIIEGFSQFTAQEQAIISVLLQRAKEVRIDLILNRGVTDIEDLSDKQSLFYRSERTYYLLYQQARKAQVKILNDVYPQELRVETPELQSLAKYWKESTDLKPINVEKIGDNHNLQVIKADTRMTEIKEIATRIKQMVALKDYRYADFLLLTPDLNKYRNIIEPIFNDYKVPIFVDLAKKMIDHPLVELLTALFNVKARHYRYVDMMRLLKTELLIPKTEYGYLGIKQFRQDLDLTENLILKFGFEGSQWLRKDDWVYYRFGSSDFGTQTDVQEKITKQVNVIRRYIKEILPPFFKQLDEAENGKEAAQILMNFLIINGVPEQLINWRNKALEQGDMVMADRPEQVWNLFCALMDEYVDTLGDLSFKEEDFLNLLQTGFEGATYRQVPSTLDQVIISETTATQMNDRKVTFIFGATDLVMPNRIQNTMLLTDMDRELVQGTLDDEKYLSDTAEGRMAAEPFMNYLAFMTPKERLYFSYPVAGVNEDGLRMSPYVNRIMKQFDLPLYEANGEPTLEDKKVLKFVATKRTALSNLIGVARQAKGQKQPLPVMWRYIYQKLQEDATYRRLTRKLMAGIEYSNIPERLKTEYAEKLYGKTLNTSVSKFEEFFKNHYAFFLKYGLKLKERDVFELSPANTGEFYHMALDKLLKTLKQDKVSITDINKSQFDAYLQQVLGGMEQLPQFQILQSSNRMQFILKQLGATVSQMGWALHNQGQRTKMRPLETEVLFGHVGTENGLKALTYDLGNGHKVNVRGKIDRIDQMIIDNQRYLGIVDYKSSSHKFNYQDAYYGLALQMLTYLNAMLQNTDLLLDLNAGEEIKPAGAVYMHLQNPVIKQKDILKNPYSEVLLKQNKYDGLVLDDQELLSNLDTSIEKAGNSIVYPVRKYADGHFGGIKNSGNVITFDNLMLLLKRNEELIQEAAKLIFAGDVALNPVLWPDRRSALQYSPYKAIMQFDELLGNQYYRLPKENTADILQKLAQENSAESEV GT:EXON 1|1-1193:0| SW:ID ADDB_LACS1 SW:DE RecName: Full=ATP-dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B; EC=3.6.1.-;AltName: Full=ATP-dependent helicase/nuclease rexB; SW:GN Name=rexB; OrderedLocusNames=LSL_1608; SW:KW ATP-binding; Complete proteome; DNA damage; DNA repair; Exonuclease;Hydrolase; Nuclease; Nucleotide-binding. SW:EXACT T SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1193|ADDB_LACS1|0.0|100.0|1193/1193| GO:SWS:NREP 7 GO:SWS GO:0005524|"GO:ATP binding"|ATP-binding| GO:SWS GO:0006974|"GO:response to DNA damage stimulus"|DNA damage| GO:SWS GO:0006281|"GO:DNA repair"|DNA repair| GO:SWS GO:0004527|"GO:exonuclease activity"|Exonuclease| GO:SWS GO:0016787|"GO:hydrolase activity"|Hydrolase| GO:SWS GO:0004518|"GO:nuclease activity"|Nuclease| GO:SWS GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|Nucleotide-binding| SEG 851->862|ldkllktlkqdk| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 537->702|3ckdC|9e-04|26.1|161/267| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 318->768|1w36C2|3e-29|14.5|428/470|c.37.1.19| RP:SCP:REP 807->1035|1w36B3|4e-11|13.8|218/276|c.52.1.24| RP:SCP:REP 1037->1171|1k32A3|1e-04|16.0|131/360|b.69.9.1| HM:SCP:REP 318->736|1w36C2|1.2e-47|21.5|390/0|c.37.1.19|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 174 OP:NHOMOORG 174 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111--1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111-1111111-111-111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 160 STR:RPRED 13.4 SQ:SECSTR ########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################GGHHHHHHHHHTTTTcTTHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTT###cHHHHHHHHHHHHHHHHHH##HHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHTHHHHTcccccTTccHHHHHHHHH############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ DISOP:02AL 60-60,634-638,691-694,715-724,1184-1194| PSIPRED ccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEEHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccHHccccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEccHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHcccccccEEEEEEEcccccccccEEEEEEcccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHcccccEEcccccccccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHcccccEEcHHHHHHHHHcHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEHHHHHHHHcccccccccccEEEcccccEEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEEEccccccccHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccEEEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccEEEcHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHccccccHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHcccccc //