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Lactobacillus salivarius UCC118 (lsal0)
Gene : smc
DDBJ      :smc          Chromosome partition protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  41/68 : Bacteria  633/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.215.1d.58.26
:1178 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1->152 1e69A PDBj 3e-29 48.1 %
:BLT:PDB   372->491 3hnwA PDBj 1e-07 37.9 %
:BLT:PDB   483->686 1gxlA PDBj 2e-24 29.1 %
:BLT:PDB   1029->1175 1xewY PDBj 3e-29 43.8 %
:RPS:PDB   1->61,1071->1174 1e69A PDBj 7e-13 44.7 %
:RPS:PDB   378->477 2c1gA PDBj 4e-04 9.0 %
:RPS:PDB   664->848 1bg1A PDBj 5e-05 15.9 %
:RPS:SCOP  2->158 1w1wA  c.37.1.12 * 8e-24 26.4 %
:RPS:SCOP  137->215 1s4eA2  d.58.26.7 * 4e-05 16.7 %
:RPS:SCOP  501->663 1gxjA  d.215.1.1 * 6e-42 31.2 %
:RPS:SCOP  997->1176 1w1wA  c.37.1.12 * 8e-32 31.3 %
:HMM:SCOP  1->1177 1w1wA_ c.37.1.12 * 1.2e-85 31.0 %
:RPS:PFM   3->456 PF02463 * SMC_N 1e-52 41.2 %
:RPS:PFM   518->635 PF06470 * SMC_hinge 6e-14 38.4 %
:RPS:PFM   803->1164 PF02463 * SMC_N 5e-39 34.7 %
:HMM:PFM   3->139 PF02463 * SMC_N 9.6e-42 44.9 136/220  
:HMM:PFM   782->1167 PF02463 * SMC_N 4e-28 43.5 115/220  
:HMM:PFM   517->636 PF06470 * SMC_hinge 1.8e-24 33.9 118/120  
:BLT:SWISS 1->1175 SMC_BACSU 0.0 36.1 %
:COIL
:REPEAT 2|256->561|758->1069
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ABD99436.1 GT:GENE smc GT:PRODUCT Chromosome partition protein GT:DATABASE GIB00337CH01 GT:ORG lsal0 GB:ACCESSION GIB00337CH01 GB:LOCATION 669510..673046 GB:FROM 669510 GB:TO 673046 GB:DIRECTION + GB:GENE smc GB:PRODUCT Chromosome partition protein GB:NOTE COG1196 [D] Chromosome segregation ATPases GB:PROTEIN_ID ABD99436.1 GB:DB_XREF GI:90820797 GB:GENE:GENE smc LENGTH 1178 SQ:AASEQ 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GT:EXON 1|1-1178:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1175|SMC_BACSU|0.0|36.1|1160/1186| COIL:NAA 331 COIL:NSEG 10 COIL:REGION 173->203| COIL:REGION 337->372| COIL:REGION 410->450| COIL:REGION 668->698| COIL:REGION 701->738| COIL:REGION 758->798| COIL:REGION 802->804| COIL:REGION 819->858| COIL:REGION 864->914| COIL:REGION 998->1016| NREPEAT 1 REPEAT 2|256->561|758->1069| SEG 169->176|kykkekkk| SEG 236->250|qkssekeqkeselqk| SEG 354->367|eklskkilelekii| SEG 747->756|klkelkessk| SEG 850->861|aiakiknkekia| SEG 967->974|kklkllkl| SEG 1091->1102|altaitllfail| BL:PDB:NREP 4 BL:PDB:REP 1->152|1e69A|3e-29|48.1|135/263| BL:PDB:REP 372->491|3hnwA|1e-07|37.9|103/124| BL:PDB:REP 483->686|1gxlA|2e-24|29.1|199/205| BL:PDB:REP 1029->1175|1xewY|3e-29|43.8|144/160| RP:PDB:NREP 3 RP:PDB:REP 1->61,1071->1174|1e69A|7e-13|44.7|164/263| RP:PDB:REP 378->477|2c1gA|4e-04|9.0|100/384| RP:PDB:REP 664->848|1bg1A|5e-05|15.9|182/558| RP:PFM:NREP 3 RP:PFM:REP 3->456|PF02463|1e-52|41.2|410/536|SMC_N| RP:PFM:REP 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1->1177|1w1wA_|1.2e-85|31.0|407/0|c.37.1.12|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 1852 OP:NHOMOORG 871 OP:PATTERN -----------------------111111111-1-211111111111111111-11111111111-11 1111111111111111111-11111111111111111111111111-111111111-1--111-1111111----1111111111112-----------------11-1---------------111111111-1111111---11121111111111111111111111211111111111111-1111111111111222121221111111112211111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11-1-121111111-111111111-----111111111111111111111111---1-11--111-1111111111111111111111111111111111111111111-----------------------------11111-1111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111-1-----------111111111111111---------------------------1111-111-111-1111111111111111121--11111--------------------------------------------------------------------------------------------11111122111111----------------11111111111111111111111111111------------------------11111111111111---21111111111111111-----1-12111111111111111111111111111-1- 6544624-C4634363345444444444444554444454445444343345254444363344647414567438817657555645-46435444444444345444447868DA54556A7883E2PlA1E6H7346A276957555A45B5H68A5Eb35444557AI7334344W4544336664624364774 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 881 STR:RPRED 74.8 SQ:SECSTR cEEEEEEEEccTTccccEEEEccccEEEEEccTTTccTHHHHHHHHTcccccTTcccccTTEEEHHHHHHHHHcccccGGGGcTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcEETTEEEcHHHHHHHTTTccTTTTcccEEEHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHTccEEEEccEEcTTcccccG#######################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTEEEEEEEETTEEEEEEEEEETTEEcHHHHHHHHHHHHHTcccccEEEEEEEEEEEcccTTEEEEEEEEEEEEccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTccHHHHHHHTTTTccTTEEEEGGGTccccHHHHHHHHHHHGGGGGcEEEccHHHHHHHHHHHHHHTcccccEEETTTccccc####cccTGGGcTTEEEEGGGGcccccTTHHHHHHHcccEEEEccHHHHHHHHHHTccccEEEcTTccEEcTTccEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH###HHHHHHHHHTTcccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHTTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccTTcTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE#########################################################################################################################################################################ccHHHHHHHEEEEccccccTTccHHHHHcTTcTTccHHHHHHEccTTcGHHHHEEEcTTcccccGGGccHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHTTTcEEEEEcccTTGGGGccEEEEEEEccEccEEEEEcccHc## DISOP:02AL 169-185,235-291,296-355,391-391,401-461,486-507,662-679,690-691,695-761,781-781,791-791,793-813,815-817,847-851,853-853,855-855,857-869,886-898,953-964,1081-1083,1176-1179| PSIPRED cEEEEEEEEEEEEEccEEEEEccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHccccccccccEEEEEEEEEcccccccccccEEEEEEEEEEcccEEEEEccEEccHHHHHHHHHHcccccccccEEEccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHccccccccHHHHHEEEcHHHHHHHHHHHHHHccEEEEccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccEEEEccHHHHHHHHHcccccEEEEEcccEEEEccEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccccccEEEEEEccccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccHHccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccHHHHHHccEEEEEEEEcccEEEEEEEEHHHcc 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