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Lactobacillus salivarius UCC118 (lsal0)
Gene : ssl.1
DDBJ      :ssl          DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box family
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  35/68 : Bacteria  413/915 : Eukaryota  166/199 : Viruses  16/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.136.1
:986 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   64->192 2c1lA PDBj 3e-04 29.9 %
:BLT:PDB   211->555 2fwrC PDBj 1e-15 23.6 %
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:RPS:PDB   243->467 3e0jC PDBj 5e-10 14.3 %
:RPS:PDB   452->564 2bhrA PDBj 1e-16 10.6 %
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:RPS:SCOP  218->384 2fwrA2  c.37.1.19 * 1e-15 27.5 %
:RPS:SCOP  359->555 2fwrA1  c.37.1.19 * 7e-15 18.7 %
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:HMM:SCOP  108->387 1rifA_ c.37.1.23 * 7.3e-32 22.3 %
:HMM:SCOP  264->566 1wp9A2 c.37.1.19 * 1.1e-45 28.5 %
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:HMM:PFM   218->370 PF04851 * ResIII 1.2e-34 39.3 150/184  
:HMM:PFM   467->541 PF00271 * Helicase_C 4.4e-17 36.0 75/78  
:HMM:PFM   610->625 PF08130 * Antimicrobial18 0.00061 62.5 16/60  
:BLT:SWISS 165->264 CLPX_CLOPH 9e-05 36.4 %
:BLT:SWISS 240->603 IRC3_YEAST 1e-28 29.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ABD99821.1 GT:GENE ssl.1 GT:PRODUCT DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box family GT:DATABASE GIB00337CH01 GT:ORG lsal0 GB:ACCESSION GIB00337CH01 GB:LOCATION complement(1029920..1032880) GB:FROM 1029920 GB:TO 1032880 GB:DIRECTION - GB:GENE ssl GB:PRODUCT DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box family GB:NOTE COG1061 [KL] DNA or RNA helicases of superfamily II GB:PROTEIN_ID ABD99821.1 GB:DB_XREF GI:90821182 GB:GENE:GENE ssl LENGTH 986 SQ:AASEQ 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