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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD54930.1
DDBJ      :             putative membrane protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  12/68 : Bacteria  119/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.35.1
:720 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   401->524 3d9bA PDBj 3e-04 18.3 %
:RPS:SCOP  584->698 1iwgA7  f.35.1.1 * 2e-06 14.2 %
:HMM:SCOP  105->333 1iwgA8 f.35.1.1 * 2.9e-28 29.8 %
:HMM:SCOP  459->702 1iwgA8 f.35.1.1 * 5.3e-27 27.8 %
:RPS:PFM   486->698 PF03176 * MMPL 1e-11 36.6 %
:HMM:PFM   45->365 PF03176 * MMPL 5.4e-45 29.6 314/333  
:HMM:PFM   397->707 PF03176 * MMPL 1.2e-36 28.8 295/333  
:BLT:SWISS 39->719 MMPL3_MYCTU 5e-49 32.4 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD54930.1 GT:GENE BAD54930.1 GT:PRODUCT putative membrane protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 72253..74415 GB:FROM 72253 GB:TO 74415 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative membrane protein GB:PROTEIN_ID BAD54930.1 LENGTH 720 SQ:AASEQ 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cHHHHHHHHHHccccEEEHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEcccccccccccccccccEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccEEccccEEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHcccccccccc //