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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD55035.1
DDBJ      :             putative arabinosyltransferase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  36/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:1081 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   40->192 3bywC PDBj 2e-12 34.9 %
:RPS:PFM   14->1079 PF04602 * Arabinose_trans 0.0 56.4 %
:HMM:PFM   13->1080 PF04602 * Arabinose_trans 0 52.9 1052/1077  
:BLT:SWISS 14->1079 EMBC_MYCSM 0.0 50.9 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD55035.1 GT:GENE BAD55035.1 GT:PRODUCT putative arabinosyltransferase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(197789..201034) GB:FROM 197789 GB:TO 201034 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative arabinosyltransferase GB:PROTEIN_ID BAD55035.1 LENGTH 1081 SQ:AASEQ 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GT:EXON 1|1-1081:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 14->1079|EMBC_MYCSM|0.0|50.9|1038/1074| TM:NTM 12 TM:REGION 14->36| TM:REGION 197->219| TM:REGION 312->334| TM:REGION 343->363| TM:REGION 401->423| TM:REGION 442->464| TM:REGION 511->528| TM:REGION 539->560| TM:REGION 567->589| TM:REGION 595->610| TM:REGION 633->654| TM:REGION 675->697| SEG 431->441|rarggggrgag| SEG 513->528|vllmllcllvsvlqvl| SEG 567->588|gvyaglagslaalaavavgtaa| SEG 596->607|alfaaavlflla| SEG 637->654|glstlflgltgaallvav| SEG 781->804|tggenkttnttgagtgggttaeag| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 40->192|3bywC|2e-12|34.9|146/158| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 14->1079|PF04602|0.0|56.4|1043/1060|Arabinose_trans| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 13->1080|PF04602|0|52.9|1052/1077|Arabinose_trans| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0009252|"GO:peptidoglycan biosynthetic process"|PF04602|IPR007680| GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF04602|IPR007680| GO:PFM GO:0016763|"GO:transferase activity, transferring pentosyl groups"|PF04602|IPR007680| OP:NHOMO 92 OP:NHOMOORG 36 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -----11111111132333-33333333333333333333-------------------------18-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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DISOP:02AL 1-5, 769-779| PSIPRED ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEcccccccEEEccEEEccccEEEEEEEEEEEcccccEEEEEccccHHHHHHccEEEEEEccEEEEEEccEEEEEccHHHcccccEEEEEEEccccEEEEEEEccccccccccccccccccEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEcEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEEcccccccEEEHEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHccEEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEcccccccccccEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHcccccccccccccccccccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEccccccccccccEEEEcccccHHHHHHHHHHHccccccccccccccccEEEEEEccEEEEEEcccccccccEEEEEEccccccccEEEcEEEEEHHcccccccccccccHHHccccccEEEEEEEcccccHHcEEEEccccccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHcccccccHHHHccHHHccccEEcccHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHEEEccccccccccEEEEccEEEcccccccccccc 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