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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD55419.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  50/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:594 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PFM   45->579 PF10081 * DUF2319 e-128 52.8 %
:HMM:PFM   44->579 PF10081 * DUF2319 1.5e-221 56.7 529/534  
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD55419.1 GT:GENE BAD55419.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 592292..594076 GB:FROM 592292 GB:TO 594076 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAD55419.1 LENGTH 594 SQ:AASEQ MRCHGGRAGIVTAHTVRVLEKADTLTRLRARGVVVVRRTEDVIDLNYVGLVVATVFFALSVTPSLVPRDWLFQGLISGINAALGYGLGCLLEWLFRLWVRPRLKVPPAPTWVRYAVKTAVLLTAALTAALMLVQSARWQREITALMGMEGTTTPAYLRTGLLSLAVGVLVVAGYRTVREIILFLARQLNRWVRVPRELAPAVGALVLVVAAVTIFNGVASRAFFAVANSAFSVRNDHTSPNAVQPQQPERSGSPESLAAWDTLGFEGRWFVSHGPTASRIAAVTGRPAREPIRAYVGLESAEDGEDQAELAVRELERTGAFDRQVIVVVTTTGTGWVNSLAAGAIEYMFGGDTAIVASQYSYLPSVLSFLADRGKAAAAGERLFDAVHEHWSQRPPDQRPKLFVYGESLGSQGSEAAFDGLADLRAKVDGALWVGPPNSNRLWEQFVARRDPGSPEVLPVYADGLVVRFAANPPDLAVPGPEWRSPRIAYLQHASDPIVWWSTDLIFSRPDWLSEPRGSDVSSQMRWAPFVTFWQVTADLTNAQGVADGHGHRYGSLVLDAWAAIAQPPGWTPELAEQVRFQLEAAEEFERVVK GT:EXON 1|1-594:0| TM:NTM 5 TM:REGION 43->65| TM:REGION 75->97| TM:REGION 115->137| TM:REGION 162->184| TM:REGION 203->225| SEG 27->38|rlrargvvvvrr| SEG 115->133|avktavlltaaltaalmlv| SEG 160->173|gllslavgvlvvag| SEG 198->212|lapavgalvlvvaav| SEG 218->234|vasraffavansafsvr| SEG 325->335|vivvvtttgtg| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 45->579|PF10081|e-128|52.8|528/534|DUF2319| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 44->579|PF10081|1.5e-221|56.7|529/534|DUF2319| OP:NHOMO 67 OP:NHOMOORG 50 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -----1-111121-21111-12--1211111122222344-----11-1--------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-----------1--------------------1---1------1---11---1---11-------1-----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 56 STR:RPRED 9.4 SQ:SECSTR ############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################EccEEEEETTccEEEEEEEccccccEEEEEcTTcccEEEEETTTEEcTTccTTEEE############################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-6| PSIPRED ccccccccccEEEEEEEcccccccccccccccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHcccccHHHHHHHccccccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEEEEcccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccHHHHHHHHHcccccccEEEEEEccccEEEEEccccccccccccccccEEEEEEcccccEEEccHHHHHHcccccccccccccccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc //