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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD55512.1
DDBJ      :             putative histidine kinase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  42/915 : Eukaryota  8/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.1.8d.122.1
:1268 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   372->529 3bk9F PDBj 4e-23 15.9 %
:RPS:PDB   519->597 2dvyD PDBj 5e-09 14.1 %
:RPS:PDB   899->979 1c8fA PDBj 2e-05 3.9 %
:RPS:SCOP  472->601 2c2aA2  d.122.1.3 * 5e-10 21.1 %
:RPS:SCOP  859->1001 1b1yA  c.1.8.1 * 1e-04 14.0 %
:HMM:SCOP  464->624 1gkzA2 d.122.1.4 * 8.5e-17 22.4 %
:RPS:PFM   362->452 PF10234 * Cluap1 4e-04 30.8 %
:HMM:PFM   508->618 PF02518 * HATPase_c 6.9e-16 27.4 106/111  
:HMM:PFM   306->387 PF00672 * HAMP 3.5e-15 41.5 65/70  
:BLT:SWISS 363->667 MPRB_MYCA1 4e-08 27.4 %
:BLT:SWISS 853->901 IF2_SYNSC 4e-04 56.1 %
:BLT:SWISS 878->1010 LWA_HYDEC 1e-10 38.9 %
:TM
:REPEAT 6|793->820|857->896|916->945|946->975|985->1014|1043->1073
:REPEAT 2|774->792|897->915
:REPEAT 2|1082->1156|1209->1256
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD55512.1 GT:GENE BAD55512.1 GT:PRODUCT putative histidine kinase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 689215..693021 GB:FROM 689215 GB:TO 693021 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative histidine kinase GB:PROTEIN_ID BAD55512.1 LENGTH 1268 SQ:AASEQ 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GT:EXON 1|1-1268:0| BL:SWS:NREP 3 BL:SWS:REP 363->667|MPRB_MYCA1|4e-08|27.4|277/522| BL:SWS:REP 853->901|IF2_SYNSC|4e-04|56.1|41/1104| BL:SWS:REP 878->1010|LWA_HYDEC|1e-10|38.9|131/419| TM:NTM 2 TM:REGION 22->44| TM:REGION 304->326| NREPEAT 3 REPEAT 6|793->820|857->896|916->945|946->975|985->1014|1043->1073| REPEAT 2|774->792|897->915| REPEAT 2|1082->1156|1209->1256| SEG 23->39|vtavlavplavavglgv| SEG 129->140|arailargkaaa| SEG 305->323|tavviatilaalllavfva| SEG 332->341|rlrlaalrva| SEG 608->619|pgvtvtvhvpvg| SEG 680->696|gpltppapaptgpgglp| SEG 757->774|tppatpgtagpagttpgg| SEG 817->829|pggngapaptagg| SEG 835->847|pggngapaptagg| SEG 1012->1031|gatglpprapgapaageggp| SEG 1192->1205|qaarraseaqaekk| RP:PDB:NREP 3 RP:PDB:REP 372->529|3bk9F|4e-23|15.9|157/250| RP:PDB:REP 519->597|2dvyD|5e-09|14.1|78/214| RP:PDB:REP 899->979|1c8fA|2e-05|3.9|77/548| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 362->452|PF10234|4e-04|30.8|91/268|Cluap1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 508->618|PF02518|6.9e-16|27.4|106/111|HATPase_c| HM:PFM:REP 306->387|PF00672|3.5e-15|41.5|65/70|HAMP| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 472->601|2c2aA2|5e-10|21.1|123/151|d.122.1.3| RP:SCP:REP 859->1001|1b1yA|1e-04|14.0|143/500|c.1.8.1| HM:SCP:REP 464->624|1gkzA2|8.5e-17|22.4|156/193|d.122.1.4|1/1|ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase| OP:NHOMO 140 OP:NHOMOORG 50 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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#####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHTTccHHHTHTTTGGGGTTccGGGcHHHHHHHHHHTcccGGGGTTTTTcHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHTTccccTccGGGHHHHHHHHHcTTTTHHHHHTTcEEEEEEcccEEEEEEEEccccccGGGTTGGGcTTccccccccccccccHHHHHHHHHHHTTcEEEEEEETTHHHH######ccTTTcEEEEEEEEcTTccEEEEcccccTTcccEE##EEEEEEEGGGTTEEEEEE######################################################################################################################################################################################################################################ccccccccccccccccccccEEEEEEEEEEE#EEEEccccccccccc##ccccTTTGG#GccccTTccccccccccccccc################################################################################################################################################################################################################################################################################################# DISOP:02AL 1-12, 80-82, 553-579, 590-616, 622-1247, 1263-1268| PSIPRED cccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccEEccccccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEEEccccEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEcccccccccc 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