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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD55643.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  3/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:2348 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   872->978 2dhhA PDBj 3e-04 18.7 %
:HMM:PFM   1565->1618 PF03497 * Anthrax_toxA 0.00033 20.4 54/179  
:PROS 1303->1328|PS00107|PROTEIN_KINASE_ATP
:PROS 259->279|PS00457|NA_SOLUT_SYMP_2
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD55643.1 GT:GENE BAD55643.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(861503..868549) GB:FROM 861503 GB:TO 868549 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAD55643.1 LENGTH 2348 SQ:AASEQ MALYFPSWLEPFEWLIGADWPHGNEDLMWQMGRELQQVAGDIRELIPDLDGIISGLANAYPDGSGGEKILEWIKPLRDGDGSAEAHGSLRQFADNYQALADSADSMGDQLEAAKLNFYIAGGWLVAEVAWALASGPASPFATAAVFASARVAFRAISNAFIRRISEIIVRMIGRRMSAVAAKRVGDLIGHMTFEVMQEALIETFQGTTQELAVQAYQNAKGHIDGYDWNAVGLNAAISAVAGGAGGLVGFGAGRHIDTSMGGWRGAFNGALVSGLAGTGGAAAAYGATGLLTGNWDFDPRSITGGAFSGALPGGIYGYRGTGEFTGPGGGPVQTVPPVDGSLAPPVPGDPATVPAGDSGTDPGAGQPRASDPTATGTPGEHSPGQAPTTGDRAPGTDPTTGDRGTPAADRSPTAEAPGQTDPASGTRTADSTAPGATAPAAAAAPGTESAGGPTPQSTQPAGSVGDVPSAQADAGPTTEAAPTPDADTATDGGSPPAADTRRESDTGDEAPGHQTADSTTPTPRDTAADTPTGEARDSTGTPGQGERAGVTDRNPLDTRASASTAATTGTPGAATAGGTALPNGALPGAGIPVATAAPGAGAPTPGPGTAPVGGTSSSGTATPPGTSTQPGTSTSTNTSTQPGTSTSPGTATPSGTPTPAGTSAATGTANQSTAPGDGAPSATVAQPQPTPTADARPPASPGTAPGASIAPTHASPATVDGHLSAAPSAATHAAPATVDSHAPGTPGTAPTADGRVDAAPGATSAPAAGPPAGSITETSPAAPASAGAARAGIVDGSVAPPVVAVQARSTGVDVPAADRGGDAGLVVPVGPVVPVPESNPRMPWSDRPGDQRGTAGPVGDFRGDARPADLPGLDQGQLLAEIGNNLLLITPGSIAWNRDGGYFVLPDGREIHVRVAPTEDGAVAEFGPLDGRPEAGYEVRVSPTARTADIPRAVAHELAEIALSLEPAIDIDPATETPATLTTHLGGRFAELRVLLAHIDRATFDPARTAELPALRRDLADLAAHLGLTDPARAAQAHELLSRFDPVLAGRFDLEQDSPFAHRPAIGPDTADFGDLADYRTLLEQRLGDESLVRMETLATQGRIREELVRRVFDPVFTGKQAAAARKTVPAKQLFAALDPINAALNDTTLTEVQRAAAVHAAIDNLRAALPDAFRETLGEDGFRRMHEAADDLGTQPRRFATELNHADATVTLDGETMPFADLLREVDRANRAATALGVNVEYTVVVHDRVDGRAAVEILPRPRPQHRLPLEQNVFGEDNERIAHRPRPAAPAAATGAHTIDVGVGRSAFAVEMTPAPDRAGEGLIIKTELASEFPVAAQRRRDRGILDPGPLTEPGTVMVFGDMLFDGHVLAEDGAGRIGRIYINNVSAHFDDDVYDALARSMIEGLAPGARIELQWDMKPEKSEADGGYPGDRGHIDGDRLWEALERLFADSELPFRIDERTEFPGAGNDDYDYTINAGGSNVLDAGKMAKFTPPRPDHRMVIVYEPTGPAATTPTATTPTSTTPAATTPAEGTPAPGDGGIGDGTDNTAVPVPGDDEPTPEQIEERYGIPIENQQKLQRYVDRYGLRMFVRPTNPDSVPHLKRGAVPKPMAIKDKTINDLDIELGAPPDAKGLVGRFAPGMLRMPDTAGMTPEHIAALEKRLQDRTADFDAYETSMREFERQGTFRTTEQGIVEAAVDGEFRPITGDHDLFDLRHADGTRLTPAELREHERNLAILRAGVQHGPHVYWDPPSAYQRERNFEKIIDSHQPDPDPDTDNEPLVVFGALRPPRVEWADLSVEGVDRTMTSWHVADALSRLPGDTGDMLNRVTELTADPGFDIATYRSWLDADDEVAGALRPGTPEHEVALIRRGAETLSTPEDVRRAVADALAAHRDVPVFRSPEEQHDIAAKSGAAPVESTTPAADSDDTAADDTATTAIPDATTDPARAALIEELTNDPDFDPDDYRAWQGYGQRLALAADIDHRPRGLMAVVVDGAVRLLTPGTPAHLRVLLEQIPAAPTDRAELTARVEHAFLPKDLPAARNPDHAVEVARWELGAHPPHDHTVAPIDPGPKAIADLSNHPDGVTRNSDGLITHIGGRPVGEVVDAIARDRAEKFTAARATPAGESNAAGRSRVARWQEKGIYANFKSHGKVSAVVMDLRTGVVYEGFNGSGADTLAADDTHPTIEHNITEMRRRGHVLENGGYPALDRAGNPESPALTRPYPHFDNPYGHAEVKAANEALWARDEHGLDASPAAMAEFYSQTYSLVPPKDENGDPLPLEPKPYCANCHHTMGRATNHSGRYHSFPHLPAHLVDGYVPEPHRVSDTPEPPNDEPGRTEHEQEGQ GT:EXON 1|1-2348:0| PROS 1303->1328|PS00107|PROTEIN_KINASE_ATP|PDOC00100| PROS 259->279|PS00457|NA_SOLUT_SYMP_2|PDOC00429| SEG 136->155|paspfataavfasarvafra| SEG 235->253|aaisavaggagglvgfgag| SEG 269->293|galvsglagtggaaaaygatglltg| SEG 317->338|gyrgtgeftgpgggpvqtvppv| SEG 394->406|pgtdpttgdrgtp| SEG 428->455|tadstapgatapaaaaapgtesaggptp| SEG 472->493|adagptteaaptpdadtatdgg| SEG 515->532|tadsttptprdtaadtpt| SEG 560->674|asastaattgtpgaataggtalpngalpgagipvataapgagaptpgpgtapvggtsssgtatppgtstqpgtststntstqpgtstspgtatpsgtptpagtsaatgtanqsta| SEG 695->712|arppaspgtapgasiapt| SEG 724->737|saapsaathaapat| SEG 758->774|aapgatsapaagppags| SEG 779->792|spaapasagaarag| SEG 826->836|vvpvgpvvpvp| SEG 1010->1028|aelpalrrdladlaahlgl| SEG 1260->1271|lprprpqhrlpl| SEG 1282->1301|riahrprpaapaaatgahti| SEG 1509->1552|ptgpaattptattptsttpaattpaegtpapgdggigdgtdnta| SEG 1883->1898|dvrravadalaahrdv| SEG 1922->1952|ttpaadsddtaaddtattaipdattdparaa| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 872->978|2dhhA|3e-04|18.7|107/1022| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 1565->1618|PF03497|0.00033|20.4|54/179|Anthrax_toxA| OP:NHOMO 6 OP:NHOMOORG 3 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------2---------------------------3-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 126 STR:RPRED 5.4 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cEETcccccTTccccEEccTccHHHHHHHHTTTcccccccccccccccccccHHHHHccEEEccTTHHHEEEEcccETTEEcccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHTTTcccccccEEEEcccccc########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 58-65, 81-90, 136-951, 956-974, 1420-1433, 1769-1770, 1773-1776, 2124-2136, 2327-2348| PSIPRED ccccccHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHccccccEEEcccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEccccccccEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEccccEEEEEEEEHHHHccccccccccHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHEEEEccEEEEEEEEccccccEEEEEcccccccccccHHHccccccccHHHccccccccccccccEEEEEcccccEEEEEEccccccccccEEEEccccccccHHHHHHHccccccccccccccEEEEEEcEEEccEEEEccccccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccEEEcccccccccccccccEEEEcccccHHcccccccccccccccEEEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEcccccccccHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHccEEEEEccccccccHHHHcccccccEEcccccccEEEEEcccccHHHHHHHHccccEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHcccccccccccccEEEEEccccccccHHHHHHHHHcEEEHHHHHHcccEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEEcccccccEEEcccHHccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHccccHHHHHcccccccHHHHHHHHHcHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHcccccccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHcccEEEEEEccccccccEEEEEEccEEEEEccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccEEccccccHHHHHHHccccccccccccccEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHcccEEEccccccEEEEEEEHHccEEEEcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccEEEEHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHEEcccccccccccccccccccccccHHHHccccccccccccccccHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccc 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