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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD55821.1
DDBJ      :             putative ATP-dependent DNA helicase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  67/68 : Bacteria  334/915 : Eukaryota  154/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1
:1584 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   35->405 2zj8A PDBj 2e-22 30.8 %
:RPS:PDB   3->428 3bxzB PDBj 6e-19 14.2 %
:RPS:SCOP  1->224 1gkuB1  c.37.1.16 * 3e-16 21.3 %
:RPS:SCOP  263->467 1gkuB2  c.37.1.16 * 8e-13 10.8 %
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:RPS:PFM   28->190 PF00270 * DEAD 3e-08 33.8 %
:RPS:PFM   333->394 PF00271 * Helicase_C 5e-09 45.2 %
:RPS:PFM   662->850 PF08494 * DEAD_assoc 2e-48 58.8 %
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:HMM:PFM   25->208 PF00270 * DEAD 1.6e-28 29.8 161/167  
:HMM:PFM   329->394 PF00271 * Helicase_C 2.7e-16 39.4 66/78  
:BLT:SWISS 8->1479 LHR_ECOLI 0.0 48.5 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD55821.1 GT:GENE BAD55821.1 GT:PRODUCT putative ATP-dependent DNA helicase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1076891..1081645 GB:FROM 1076891 GB:TO 1081645 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative ATP-dependent DNA helicase GB:PROTEIN_ID BAD55821.1 LENGTH 1584 SQ:AASEQ 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------1-232111122232223232222222244333233332322122222222334222333112-1111-122-2211121-32-11-2-122-1--141--123121-1-------11131---241--1111--1215-1-1--2--1-111113512221-12-111211-1I434233211323234323- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 556 STR:RPRED 35.1 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 1215-1216, 1320-1343, 1579-1584| PSIPRED 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