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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD55876.1
DDBJ      :             putative helicase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  8/68 : Bacteria  393/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  4/175   --->[See Alignment]
c.2.1c.37.1
:956 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   470->949 1z6aA PDBj e-107 43.0 %
:RPS:PDB   498->645 2ekdA PDBj 4e-07 8.0 %
:RPS:PDB   634->881 1ekuA PDBj 3e-47 7.4 %
:RPS:SCOP  293->334 2csuA1  c.2.1.8 * 9e-05 26.3 %
:RPS:SCOP  470->704 1z63A1  c.37.1.19 * 5e-43 41.3 %
:RPS:SCOP  706->953 1z5zA1  c.37.1.19 * 7e-46 40.2 %
:HMM:SCOP  466->692 1z3iX2 c.37.1.19 * 7.2e-79 41.9 %
:HMM:SCOP  696->951 1z3iX1 c.37.1.19 * 1.9e-63 37.4 %
:RPS:PFM   109->159 PF10005 * DUF2248 8e-04 34.7 %
:RPS:PFM   310->408 PF12419 * DUF3670 8e-15 42.4 %
:RPS:PFM   480->737 PF00176 * SNF2_N 3e-52 42.0 %
:RPS:PFM   820->891 PF00271 * Helicase_C 8e-04 30.0 %
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:HMM:PFM   305->436 PF12419 * DUF3670 8.6e-37 37.1 132/141  
:HMM:PFM   817->893 PF00271 * Helicase_C 1.5e-16 26.7 75/78  
:BLT:SWISS 477->947 Y018_MYCGE 9e-66 35.1 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD55876.1 GT:GENE BAD55876.1 GT:PRODUCT putative helicase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1133195..1136065 GB:FROM 1133195 GB:TO 1136065 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative helicase GB:PROTEIN_ID BAD55876.1 LENGTH 956 SQ:AASEQ 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ABBCJKN-eEB6FEMNMRJMPNMNNOPMLKMNMMLMLMOMJMLJKJOMNPMOTNJKKOLMLLIKHGGG3GGFHHGIG5HHGGFGGHLJ-HTIMLKNJGIJIeFLLO6LvMjccclZaRSROUVQ*yNwK**dAwd*PORNVLTZWPSNNPjRO*QcSXSKZgNOMMJSJLgULQHBGMO*HHGGOcROqOgZINGJKJX --------------------------------------1---------------11------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 491 STR:RPRED 51.4 SQ:SECSTR 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734-741, 929-938, 951-956| PSIPRED cccccccccccEEEcccEEEEEEEEcccccEEEEccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccEEEccHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHccEEccccccHHcccccccccccccccccEEEEEEEEcccccHHccHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHccHHHcccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHccccEEEEcHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHcHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHcccHHHHHHHHHccHHHccc //