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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56010.1
DDBJ      :             putative transcriptional regulator
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  36/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.4.6c.37.1
:863 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   799->863 1fseB PDBj 3e-04 33.8 %
:RPS:PDB   800->862 3cloA PDBj 8e-13 31.7 %
:RPS:SCOP  66->90 1w36B1  c.37.1.19 * 4e-04 32.0 %
:RPS:SCOP  799->863 1fseA  a.4.6.2 * 6e-13 33.8 %
:HMM:SCOP  54->256 1iqpA2 c.37.1.20 * 1.8e-10 24.0 %
:HMM:SCOP  781->863 1p4wA_ a.4.6.2 * 4.4e-15 36.1 %
:RPS:PFM   802->850 PF00196 * GerE 3e-05 44.9 %
:HMM:PFM   802->855 PF00196 * GerE 8.9e-16 38.9 54/58  
:BLT:SWISS 152->379,803->859 MALT_SALTY 2e-11 25.2 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD56010.1 GT:GENE BAD56010.1 GT:PRODUCT putative transcriptional regulator GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(1289119..1291710) GB:FROM 1289119 GB:TO 1291710 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT putative transcriptional regulator GB:PROTEIN_ID BAD56010.1 LENGTH 863 SQ:AASEQ MGVSGKFPSLSVLVVNRVFSVREEHRKGRAGVNTSHDPGRPRRSPVPVPPFTPIARPVLFEAVDAAVAARSGRVLLVSAPAGAGKTVLLADWATRRCDLAVHWVGAADEFTAAADPAAAVRARLATTTPGVLILDDAHLLDDPAALAGLERFLLEAPPELTVVVCARFDPPIRWHLLELQARLTRLGAAELALTPEEISGLCAEHGVTLDEAGRTALSELTGGWAALVRITAVHLAAHRDELAVLATRLPHAVVDYLGAELLDGLSPTLREFLTVTGVPATFTEKLADDLVGGGAGHCLDELDRLGFPLVRTPRGTELWFSYHPMLRAHFRAEADRLGRDRIRALHLRAARWLHAAGHLPAALTHLCAAGDRAPLLDFVTAAGPTLVLDGAGSVLFAELTRTANDVLDDPYVWALRVLDALVHGDTADAVACLDLALARRTHRTSFAPRAWTDALLRALAVDVAAATGRLPEPPGPVEPTGHADIDCYTAIQVATAAIVRGQLADGEELLHRGLALADHACHPRLALRAAARLAFAAGAAESTTAMRQRAGRALALAREHDLLDSPDAAQAMTVAAAAAYLRGEQPEPTQLAAALAMHRDRDGAHSPLVGRHGHLVGQLLAAETGTAVDALHRDMIALLDHDGIAASTAALLPHVVWALLRRHEPRTARLLVDRARNLLGDVPDVTLARGACAHAEEKPRQTLELVEPLLREPAALRPSSRVTARLLCAIARYRLDRPRAAGDMLDRAVRDAADEEFVRPFLDVPGAVALLDVFSGRFGRDEPFVARVRANPAARREIARPALTDTELLVLKQLPTGRTVGQIAADLGVSINTVKTHLRGIYGKLGANSRVGALDTARRSGLL GT:EXON 1|1-863:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 152->379,803->859|MALT_SALTY|2e-11|25.2|283/901| SEG 38->58|pgrprrspvpvppftpiarpv| SEG 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containing nucleoside triphosphate hydrolases| HM:SCP:REP 781->863|1p4wA_|4.4e-15|36.1|83/0|a.4.6.2|1/1|C-terminal effector domain of the bipartite response regulators| OP:NHOMO 39 OP:NHOMOORG 36 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 65 STR:RPRED 7.5 SQ:SECSTR 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cccccccccEEEEEEcccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEccccccccccHHHccccEEccHHHHcccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccc //