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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56071.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  259/915 : Eukaryota  16/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.90.1c.2.1c.58.1d.194.1e.45.1
:1134 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   310->751 1bw9B PDBj 3e-40 18.1 %
:RPS:SCOP  45->241 1nh1A  e.45.1.1 * 1e-21 14.2 %
:RPS:SCOP  317->443 1b26A2  c.58.1.1 * 8e-15 19.7 %
:RPS:SCOP  462->528 2f9zC1  d.194.1.3 * 5e-06 29.0 %
:RPS:SCOP  546->656 1lktA  b.90.1.1 * 6e-37 16.0 %
:RPS:SCOP  646->760 1bw9A1  c.2.1.7 * 2e-06 11.5 %
:HMM:SCOP  276->486 1gtmA2 c.58.1.1 * 1.1e-25 31.9 %
:HMM:SCOP  474->823 1hwxA1 c.2.1.7 * 1.6e-31 27.1 %
:RPS:PFM   36->1132 PF05088 * Bac_GDH 0.0 58.1 %
:HMM:PFM   36->1132 PF05088 * Bac_GDH 0 56.9 1084/1528  
:BLT:SWISS 205->709 DHE2_NEUCR 3e-12 28.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD56071.1 GT:GENE BAD56071.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(1358513..1361917) GB:FROM 1358513 GB:TO 1361917 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAD56071.1 LENGTH 1134 SQ:AASEQ 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GT:EXON 1|1-1134:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 205->709|DHE2_NEUCR|3e-12|28.0|450/100| SEG 15->29|rprrrldgdwddrlr| SEG 297->308|prripelplprp| SEG 973->988|rdaaalrtrtaaltdr| SEG 1013->1027|vaaatgrpaaavapv| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 310->751|1bw9B|3e-40|18.1|315/347| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 36->1132|PF05088|0.0|58.1|1083/1516|Bac_GDH| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 36->1132|PF05088|0|56.9|1084/1528|Bac_GDH| RP:SCP:NREP 5 RP:SCP:REP 45->241|1nh1A|1e-21|14.2|190/290|e.45.1.1| RP:SCP:REP 317->443|1b26A2|8e-15|19.7|117/175|c.58.1.1| RP:SCP:REP 462->528|2f9zC1|5e-06|29.0|62/152|d.194.1.3| RP:SCP:REP 546->656|1lktA|6e-37|16.0|100/104|b.90.1.1| RP:SCP:REP 646->760|1bw9A1|2e-06|11.5|104/202|c.2.1.7| HM:SCP:REP 276->486|1gtmA2|1.1e-25|31.9|166/178|c.58.1.1|1/1|Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain| HM:SCP:REP 474->823|1hwxA1|1.6e-31|27.1|277/293|c.2.1.7|1/1|NAD(P)-binding Rossmann-fold domains| OP:NHOMO 309 OP:NHOMOORG 275 OP:PATTERN 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------------------------------------------------1-1------1-111---------------------------1-----1----11-------------------------------------------------------------1----------1-------------------3333- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 524 STR:RPRED 46.2 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 1-6, 8-10| PSIPRED 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