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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56099.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  12/68 : Bacteria  48/915 : Eukaryota  41/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.92.1
:943 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   202->236,670->770 2wjyA PDBj 4e-09 33.7 %
:RPS:PDB   209->236,498->732 3d3xB PDBj 1e-16 8.6 %
:RPS:SCOP  202->241 1w36B1  c.37.1.19 * 2e-06 25.6 %
:RPS:SCOP  495->731 1t3aA  d.92.1.7 * 2e-21 7.2 %
:HMM:SCOP  197->815 1qhh.1 c.37.1.19 * 2.2e-37 22.2 %
:RPS:PFM   836->929 PF10881 * DUF2726 1e-11 40.2 %
:HMM:PFM   858->929 PF10881 * DUF2726 9.6e-10 32.9 70/126  
:HMM:PFM   218->268 PF09848 * DUF2075 4.8e-06 33.3 51/352  
:HMM:PFM   276->351 PF02541 * Ppx-GppA 0.00013 27.6 76/285  
:HMM:PFM   396->441 PF09278 * MerR-DNA-bind 0.00016 30.8 39/65  
:BLT:SWISS 204->244 ZNFX1_HUMAN 3e-06 51.2 %
:BLT:SWISS 495->764 Y4399_DICDI 9e-12 30.5 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAD56099.1 GT:GENE BAD56099.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1395519..1398350 GB:FROM 1395519 GB:TO 1398350 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAD56099.1 LENGTH 943 SQ:AASEQ MIRYSLGGSWGRDEGGVVDPRQQAVLIRKSVGQPYSNRTRDVTALRLGAAGPVVTFSGGGSYRYGWDRVLILDHPHIVRPGPGTRIMVRGQLRSDVTTAYHFAGRGEEWWHLVRGDGEYEVRRGSSVEIVTDAGREPRTGTILAYWRAIADLLPEGGQSLRKAYGDELILRPDSALYRYLNGTPITPTAPPVGPPLYPFHTNLSQREALQKALTHPLSVIDGPPGTGKTQTILNLIANVIVDETKTVAVVSSNNAAVDNVHAKLVKAGFGYVIANLGRRSKKERFFADQDVRNSEVDRLRMSAEAVPMPPAELVALDGRLLALREMERELAQLTTERSAYELERSHFAEHLENHRLPGEDLLPVLRWSSTKILSFIAATDPELARTSGLARHIERIRNYFRFRSLRFADSQDVDLMLRLQRQYYDRKIAELDQRIDELQSMLSRRRFDQLAEEQRTRSVAWLTEHLRRRYAGRPTRRYDNRYLAQWGEFSRDYPVIASTCHSLGASIGRGRLVDYLIIDEASQVDLLAAGAAMACCRHLVVVGDLRQLAPVVDVPASSCPAAPAPAYDYHRHSILSSLLELHGDHLPRTMLREHYRCDPGIIGFCNQKYYADDLVPFTRATPGHRAMVLVRTERGNHMRTHRDGGKINQREIDVVREEVLPEFCAEFGDEQIGITTPFRRQADLVTDQLIRSIESDTVHSFQGREKEAIVMTTVLDETRSGYRGLEFADKPQLVNVAVSRARKRFVLVTNFDLLPRSRNLRDLIGYIRYQNPRDDVFDSSIVSVFDLLYRDYSARLAPLAARLRGNGRYKSEAIMRALLETVLAEPEFEGYWFREQVFVKNLLPDTTRLDPEQREYVQGRASVDFDVFNRITKERLCVIEVDGFEFHAKSPEQQARDAIKDRICVAYEIPLLRFPTTGSGEVERLRRELGALIRARDESAPPR GT:EXON 1|1-943:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 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hydrolases| OP:NHOMO 123 OP:NHOMOORG 101 OP:PATTERN ----------------1------21111-11--1---------------------121---------- -------------------------1-------1-11----1------------------------1-------------1----1---1----------------1-1----------------1--111---------1--------------------------1--------------------------------------------------------------1-------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------------------21-----------------1---------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-------------------------------1-------------1------1-----------1--------1-----1------1---------1------------------1--------1-----12-----------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1------1--------2-----11-----------------------------------------2-----------------1----------------------------11-------- ----31--------11-1------1-------------------------------------2-------------1-1-----------4---1-1-------1-12-1-1-111------2-----------------------2------1-1---112--1----2-1-1------2-111-22--2-11-1--- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 370 STR:RPRED 39.2 SQ:SECSTR 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cEEEccccccccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEcccccEEEEcccccccccccEEEEEccccEEcccccEEEEEcccccEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEcccccEEEcEEEEEEEHHcccccccccHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHccccccccccHHccccccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEHHHHHHHHHccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccccEEEcHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHcccccEEccccccccccEEEEEcccccEEEEcccccEEcHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcHHHHHHHHHHHHcccEEEcccccccccccEEEEEEEccccccccccccccccccEEHHEEHHHcccEEEEEcHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccccEEEEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccc //