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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56151.1
DDBJ      :             putative NAD-dependent glutamate dehydrogenase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  258/915 : Eukaryota  34/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.90.1c.2.1c.58.1c.92.2d.194.1e.45.1
:1645 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   812->1239 1bxgB PDBj 4e-30 18.9 %
:RPS:SCOP  529->746 1nh1A  e.45.1.1 * 9e-22 13.3 %
:RPS:SCOP  779->946 1b26A2  c.58.1.1 * 2e-12 17.7 %
:RPS:SCOP  964->1030 2f9zC1  d.194.1.3 * 1e-09 33.9 %
:RPS:SCOP  1048->1157 1lktA  b.90.1.1 * 4e-34 12.1 %
:RPS:SCOP  1411->1472 1pq4A  c.92.2.2 * 4e-04 18.2 %
:HMM:SCOP  778->988 1gtmA2 c.58.1.1 * 9.1e-27 29.5 %
:HMM:SCOP  976->1314 1hwxA1 c.2.1.7 * 3.5e-29 26.6 %
:RPS:PFM   96->1634 PF05088 * Bac_GDH 0.0 51.6 %
:HMM:PFM   89->1634 PF05088 * Bac_GDH 0 53.6 1497/1528  
:BLT:SWISS 710->1078 DHE2_NEUCR 3e-14 27.1 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD56151.1 GT:GENE BAD56151.1 GT:PRODUCT putative NAD-dependent glutamate dehydrogenase GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1460419..1465356 GB:FROM 1460419 GB:TO 1465356 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT putative NAD-dependent glutamate dehydrogenase GB:PROTEIN_ID BAD56151.1 LENGTH 1645 SQ:AASEQ 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976->1314|1hwxA1|3.5e-29|26.6|267/293|c.2.1.7|1/1|NAD(P)-binding Rossmann-fold domains| OP:NHOMO 326 OP:NHOMOORG 292 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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#########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHTTHHHHHTcHHTHHHHHTcEccEETTTTEEEEEEEEEcccccEEEcEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccEEEEEEEcccccTTTccHTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTEEEEETTEEEEccTTccHHHHHcEEEcccTTccccHHHHHHHTTTccccccccGGGTcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccTcEEEEcccTTcEEEEEcccTTHHHHHHHHHHTTcEEEEEcccHHHHHHHHHTHHHHHHccccTcccTHHHHHHTTcEEEETcTcEEccTTHHTGGGccccEHHHHTcEEEEGGGGcETccEEEccccccccccHHHHTTcc#cccHHHHHHHHHTTccEEccccccccccHHHHHHHHHTTcEEcHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHccccHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHTT############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-17, 144-153, 269-282, 1640-1645| PSIPRED cccccccccHHHcccccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccccccEEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccEEEEEEccccEEEEEccccccccccccEEEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEcccccEEEEEccccccccccccccccccEEEEEEcccEEEEccccccEEEEEEEcccccEEEEEEEEEHHHHHHHHccHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHccHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcccccEEEEEEEcccHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEcccccccEEEEEEEcccccccHHHHccHHHHccEEEEccccEEEEcccEEEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEcccccccEEEEEEEcHHHcccccccccEEEEEEEEEEEEEEEEEccccccccEEcccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHcccccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEccccccHHHHHHHHccccEEEEEEEccEEEEcccccccccHHHHHHHHHcccccHHcccHHHHcccccEEccccccccccHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHccccEEEEccccccccccccccccccccccccEEEccccccEEEEEEcccccccHHHHHHHHHcccEEEccHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHccccHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHccccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccc 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