[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56186.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  4/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.26.1
:906 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   759->889 2cswA PDBj 4e-08 13.8 %
:RPS:SCOP  770->893 1mzkA  b.26.1.2 * 2e-09 21.1 %
:HMM:SCOP  744->893 1g3gA_ b.26.1.2 * 9.4e-11 27.1 %
:HMM:PFM   804->886 PF00498 * FHA 1.6e-09 34.8 66/68  
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD56186.1 GT:GENE BAD56186.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION complement(1500489..1503209) GB:FROM 1500489 GB:TO 1503209 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAD56186.1 LENGTH 906 SQ:AASEQ MGKSPSTVGIAPGEGLIARFGAALVYLAESDSGERILDAVEAESDGAHPGAAIARRLAGVVFGGGAEPPAFGVVAPTEDGTVILLRGPVRARIHGAEGARDLSGARAFTWVDEIVREPVRRILVGRDTGAWPAVHPHTDLRAGIVPGAAFELRVGVRRSDPVTPASGAATSAPGAAPALPRPDSPATGRPVASGAVSTGDRASGIAGAPGLPVRRPGASANWRAAALRPGVSGFERVASAAVPAAGDPGPNSPAPGSPAPTAETPATSDGTPAESRDGRSTATPRIPATTGSARGASPTTPAEPGATTPPASGMSTAAASTAGTNLSGTGGDSGARATTDTSAAAHTDNGTATGNGNGTATGNGNGTGSGNGTDAGSDTDAGSGTDAGSGTDAGSGNGAGSGNGNGNGNGGNAAGTSPGTADDNGAGTGTNTSSTGTATGASAGSTSPSSASTGGRTADTADDHRTPTTTGSDNATGGTLGTAPATAEAPRDTALGERPTVTGRPDITTGTTPPTAPAPDEPPHAVPLGQGSTHPDRPGHATRPTPALTTDAPGSGSRPADVAQAESPSPPSSGPTAAAGTPGTADRTNTPGGTADSTAGAGPRPTPVPDRPAPTSPEATRTRYPAPTAARTQAQPALPGAAGNTGSAQRPATGQATTADRPTPAATGKHVTGTPAGVTPPVPGGPGAAGPGEPGPTVFLGPGDRPAPETSAPDNPSTADLPATAPAGFDALSEDTDRPEDAPKPATKVMPLAWSEVEEPARPAPFAPQPDRWGRVVPLRPQSAAEPPGALIFEDVIYPLDRAYVVGRNPSGDEAVRNGLAAPLTLPRDRHVSRVHAHVTLDGGRVLVRDAGTPAGTFLAGPGSDQWTRVGSSPVELPPGWRLRIGQKILTHRPATRPLAAFPRRY GT:EXON 1|1-906:0| SEG 163->178|tpasgaatsapgaapa| SEG 243->268|paagdpgpnspapgspaptaetpats| SEG 295->331|gaspttpaepgattppasgmstaaastagtnlsgtgg| SEG 335->455|arattdtsaaahtdngtatgngngtatgngngtgsgngtdagsdtdagsgtdagsgtdagsgngagsgngngngnggnaagtspgtaddngagtgtntsstgtatgasagstspssastgg| SEG 475->487|atggtlgtapata| SEG 500->523|tvtgrpdittgttpptapapdepp| SEG 567->585|spsppssgptaaagtpgta| SEG 603->617|prptpvpdrpaptsp| SEG 619->637|atrtrypaptaartqaqpa| SEG 656->667|attadrptpaat| SEG 671->698|vtgtpagvtppvpggpgaagpgepgptv| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 759->889|2cswA|4e-08|13.8|109/145| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 804->886|PF00498|1.6e-09|34.8|66/68|FHA| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 770->893|1mzkA|2e-09|21.1|109/122|b.26.1.2| HM:SCP:REP 744->893|1g3gA_|9.4e-11|27.1|133/164|b.26.1.2|1/1|SMAD/FHA domain| OP:NHOMO 4 OP:NHOMOORG 4 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------1----111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 157 STR:RPRED 17.3 SQ:SECSTR ################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cEEEEEccccccEEEEEEEEEEccccccccccTTccEEEEEccTTccccccEcTTccccEEccTTccEEEEccTTccEEccccccccEEcccGGGccTTcEEEEEcTccEEEEcccccccEEEccEccTTcccccTccEEccccccEEEccccTEEE############# DISOP:02AL 1-4, 8-12, 14-17, 20-791, 803-819| PSIPRED cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEccccccHHHHHccccccEEcccccccccccEEEEEcccEEEEEEccccccEEEEcccccHHEEccccccccccccEEEHHHHHHHcccccccHHHccccc //