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Nocardia farcinica IFM 10152 (nfar0)
Gene : BAD56197.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  710/915 : Eukaryota  14/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.40.4c.68.1
:1145 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   437->811 2vmkB PDBj 8e-68 39.0 %
:RPS:PDB   407->500 3c19A PDBj 6e-12 12.0 %
:RPS:PDB   484->813 2bvlA PDBj 6e-52 10.2 %
:RPS:SCOP  435->512 2oceA4  b.40.4.5 * 7e-11 28.6 %
:RPS:SCOP  483->806 2bvlA1  c.68.1.22 * 1e-38 12.2 %
:HMM:SCOP  436->519 1smxA_ b.40.4.5 * 3.7e-19 42.9 %
:RPS:PFM   19->61 PF04760 * IF2_N 1e-04 52.4 %
:RPS:PFM   435->512 PF00575 * S1 1e-08 47.1 %
:RPS:PFM   515->788 PF10150 * RNase_E_G 4e-84 57.8 %
:HMM:PFM   515->787 PF10150 * RNase_E_G 8.6e-105 52.0 269/271  
:HMM:PFM   18->67 PF04760 * IF2_N 4e-14 46.0 50/54  
:HMM:PFM   434->512 PF00575 * S1 5.8e-13 33.8 71/74  
:BLT:SWISS 20->64 IF2_MYCVP 2e-07 55.6 %
:BLT:SWISS 408->806 RNG_HAEIN 4e-77 39.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAD56197.1 GT:GENE BAD56197.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00210CH01 GT:ORG nfar0 GB:ACCESSION GIB00210CH01 GB:LOCATION 1515888..1519325 GB:FROM 1515888 GB:TO 1519325 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAD56197.1 LENGTH 1145 SQ:AASEQ 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DISOP:02AL 1-5, 8-20, 44-396, 807-1145| PSIPRED ccccccccHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHcccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHccccccHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEEccEEEEEEEEccccccccccEEEEEEEEEEccccEEEEEEccccccEEEHHHHcHHHcccccccccHHHHHccccEEEEEEEEcccccccccccccEEcccEEEEEcccccccEEEccccHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccHHHHHHHHHccccccEEEEccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHccEEEcccccEEEEEcccEEEEEEEcccHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccEEEccccccccHHHHHcccccccccccEEEccccccccHHHHHHHHHHHccHHHcccccccccccccccHHHccccccccccccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 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